New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | DH1 | 1703700 = | 211 (0.380) | noncoding (1205/1205 nt) | repeat_region | repeat region |
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1702347‑1702500 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT > DH1/1703700‑1703848 CGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTT < 4:1373028/151‑1 GCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG < 5:1313337/151‑1 GCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTT > 2:2062880/1‑149 GGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTT > 1:808924/1‑151 GAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCGCTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTC < 2:277277/151‑1 GAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTC > 1:1200985/1‑151 GAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTC < 7:838345/151‑1 AAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTC > 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AGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGA < 1:222765/151‑1 AGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTG > 7:1580090/1‑150 TGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTG > 2:1810229/1‑151 TGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTG > 5:1673625/1‑151 CGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCG > 7:494404/1‑151 CGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCG < 3:576127/151‑1 GATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGA < 4:1512222/151‑1 GATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGA < 3:740481/151‑1 GATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTCATCCTGCCG > 6:335189/1‑150 GATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTCACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCG > 3:1089647/1‑150 TATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATT > 4:1596139/1‑151 TATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTATGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATT > 8:675221/1‑151 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTG < 7:626597/151‑1 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTG < 5:869506/151‑1 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATT < 7:1036833/150‑1 TCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTC > 3:331494/1‑151 TCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACATCCGACCTACGCTGATCCTGCCGATTGTC > 5:65066/1‑151 CCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCA < 4:905058/151‑1 TAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATC < 4:1029843/149‑1 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT < 4:680872/151‑1 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT < 6:1602673/151‑1 GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1702347‑1702500 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT > DH1/1703700‑1703848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |