| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | DH1 | = 1702500 | 208 (0.420) | 242 (0.500) | 164/292 | 1.8 | 51.7% | noncoding (5/1205 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 1703700 = | 250 (0.510) | noncoding (1205/1205 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1702347‑1702500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA > DH1/1703700‑1703849 GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATGCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTTCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGT < 4:832457/151‑1 CGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTT < 1:631749/151‑1 GGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTT > 5:15169/1‑150 GCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTACGTT > 4:1332865/1‑149 CGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGT < 8:811927/151‑1 GAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTC < 4:541917/151‑1 GAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTC > 5:1306232/1‑151 AGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCAC < 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< 3:578823/150‑1 CAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGATAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTG > 4:1602082/1‑151 AGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGG > 2:1780932/1‑151 GAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGT < 4:97874/151‑1 ATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTAT > 2:90349/1‑151 ATCATAATATTCCTGGTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTAT < 6:1558663/151‑1 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6:1859886/1‑150 ATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTAT < 6:1439752/151‑1 ATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCG > 7:1484696/1‑151 ATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATC < 7:731000/150‑1 CCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAA < 2:1926779/150‑1 CCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAA < 4:1689139/150‑1 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TGGCGATATTCCGTTAGTTCACTGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCT < 2:782622/150‑1 TGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCT < 4:1247145/150‑1 GCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCC < 1:1149876/151‑1 GCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCC < 8:1482797/151‑1 GATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCG > 5:1770028/1‑150 ATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGAT < 5:478388/151‑1 ATTCCGTTATTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATT < 8:1578168/150‑1 GTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATC < 2:1527626/151‑1 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT < 4:1523391/151‑1 GTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA < 7:450462/151‑1 GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1702347‑1702500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA > DH1/1703700‑1703849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |