| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | DH1 | = 1702500 | 208 (0.420) | 242 (0.500) | 164/292 | 1.8 | 51.7% | noncoding (5/1205 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 1703700 = | 250 (0.510) | noncoding (1205/1205 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 507 total aligned reads displayed.
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA > DH1/1703551‑1703849 | ggaagaaattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagtt < 7:1747926‑M2/2‑1 (MQ=255) aCAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTc < 3:1411151/151‑1 (MQ=31) agaaattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCAc < 5:771635‑M2/5‑1 (MQ=255) aGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACg > 6:744521/1‑151 (MQ=33) aattaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGc > 7:837420‑M2/144‑151 (MQ=255) attaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCa < 8:1515368‑M2/9‑1 (MQ=255) ttaaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggctatattccgttagTTCACGGCAt > 8:1317014‑M2/142‑151 (MQ=255) taaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATg > 2:1114604‑M2/141‑151 (MQ=255) aaagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGc > 1:236806‑M2/140‑151 (MQ=255) ctctTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGcc > 1:1863059/1‑151 (MQ=38) ctctTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGcc > 3:930357/1‑151 (MQ=38) aagagttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGcc < 4:1806356‑M2/13‑1 (MQ=255) ttttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCttt > 5:1520926/1‑151 (MQ=40) agttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCttt < 2:191503‑M2/16‑1 (MQ=255) agttgtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCttt > 8:1243319‑M2/136‑151 (MQ=255) ttCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCtttt < 4:1187594/150‑1 (MQ=255) gtgtcagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTAt < 4:1511754‑M2/19‑1 (MQ=255) tGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTAttt > 5:1623327/1‑151 (MQ=255) ggTCTTACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTAttt < 5:17201/150‑1 (MQ=255) ggTCTGACCGCGCTTACTGCTCAATTCCCAGTCGGCGAAGTTAATGTGATGCCTCATTATGAACCCTGTTCTATGGGTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGCTAGTTGTTCGGACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTAttt < 6:1059865/150‑1 (MQ=14) cagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCt < 3:578823‑M2/23‑1 (MQ=255) cagaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgatagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTg > 4:1602082‑M2/128‑151 (MQ=255) cTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTgg > 7:1185125/1‑151 (MQ=255) agaatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTgg > 2:1780932‑M2/127‑151 (MQ=255) gACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggta < 3:1241476/151‑1 (MQ=255) aatcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggta < 1:1200254‑M2/27‑1 (MQ=255) tcataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatc > 7:930991‑M2/123‑151 (MQ=255) cataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcg < 2:528818‑M2/30‑1 (MQ=255) cataatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcg < 7:590452‑M2/30‑1 (MQ=255) taatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGGCTTTTATTTCTggtatcggt > 2:659906‑M2/120‑151 (MQ=255) gcTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcggt > 1:1286252/1‑150 (MQ=255) aatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcggta < 6:1162664‑M2/33‑1 (MQ=255) aatattcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcggt > 6:1859886‑M2/119‑150 (MQ=255) ttACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcggtatc > 4:1716726/1‑151 (MQ=255) attcctgttgaattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTggtatcggtatc < 7:731000‑M2/35‑1 (MQ=255) aCTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGgtatcggtatcg > 8:767474/1‑150 (MQ=255) gAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCAt < 7:1272484/150‑1 (MQ=255) aattaatccagtgtcgggttaatgaaatagaaacctatatggatggtgtgcatttgatatgcaccactgccaaagtggatcgtagttttggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTAc > 1:482149‑M2/106‑150 (MQ=255) 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tGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtg < 8:165202/149‑1 (MQ=255) gTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATTCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtgctg < 3:391982/151‑1 (MQ=255) gTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtgctg > 4:463046/1‑151 (MQ=255) ggcgatattccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGAtgctgc > 1:967295‑M2/17‑151 (MQ=255) aCCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGAtt < 8:107589/151‑1 (MQ=255) ccttcgttAGTTCACGGGTTGCCTTTTATTTCTGGTATGGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTg < 6:1265394/151‑1 (MQ=255) attccgttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTg < 6:1767948‑M2/141‑1 (MQ=255) tccttAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtc < 1:429312/150‑1 (MQ=255) ccttAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtca < 6:1939742/150‑1 (MQ=255) gttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGtcatc < 2:1527626‑M2/146‑1 (MQ=255) agTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTcatcat < 3:991780‑M2/148‑1 (MQ=255) gTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTa < 7:450462‑M2/150‑1 (MQ=255) | GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA > DH1/1703551‑1703849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |