| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | DH1 | = 1702500 | 208 (0.420) | 242 (0.500) | 164/292 | 1.8 | 51.7% | noncoding (5/1205 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 1703700 = | 250 (0.510) | noncoding (1205/1205 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 465 total aligned reads displayed.
GCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTTA > DH1/1702350‑1702649 | cggAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAgg < 5:966902/151‑1 (MQ=255) cggAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGt < 8:811927‑M1/151‑2 (MQ=255) gaagaaATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGttc < 4:541917‑M1/151‑4 (MQ=255) 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aaaGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGGGAAGGTGCGa < 7:1837692/150‑1 (MQ=255) aaGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGGGAAGGTGCGAAt > 4:1058221/1‑151 (MQ=255) agagTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGGGAAGGTGCGAATa < 4:683378/151‑1 (MQ=255) agTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGttcacggcatgccttt > 8:1243319‑M1/1‑135 (MQ=255) agTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATAATCCGTTAGGGAAGGTGCGAATa > 2:1017446/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |