| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | DH1 | 2,204,804 | Δ120 bp | intergenic (‑239/‑54) | tqsA ← / → mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | DH1 | 2204804 | 2204923 | 120 | 270 [3] | [0] 266 | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2204803 | 3 (0.010) | 263 (0.530) | 160/296 | 2.2 | 99.4% | intergenic (‑238/‑174) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ |
| ? | DH1 | 2204924 = | 0 (0.000) | intergenic (‑359/‑53) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA > DH1/2204653‑2204952 | aGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATT > 6:1727470‑M1/1‑151 (MQ=255) gAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTgg < 1:896912‑M1/150‑3 (MQ=255) aaaaTATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtt > 3:35058‑M1/1‑147 (MQ=255) ttttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATCGAAAAATTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTgttttcgctt > 2:1357321‑M1/1‑141 (MQ=255) tttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctg > 7:1725274‑M1/1‑140 (MQ=255) tttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctg > 2:1661585‑M1/1‑140 (MQ=255) tttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctg < 2:1187946‑M1/150‑11 (MQ=255) ttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctga > 5:1947469‑M1/1‑139 (MQ=255) ttGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctga < 3:577280‑M1/150‑12 (MQ=255) gAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaatt < 7:368230‑M1/151‑15 (MQ=255) aaTTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCATCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACTCTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTGTACATTggtttcgctgaattaagcg < 1:632811‑M1/151‑20 (MQ=255) tCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaa > 1:1483923‑M1/1‑129 (MQ=255) tAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaat < 1:1085118‑M1/150‑25 (MQ=255) tAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaa < 5:759155‑M1/149‑24 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt < 2:1335183‑M1/150‑26 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt > 4:1228305‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatt > 6:445508‑M1/1‑125 (MQ=255) aGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaatta > 5:1436857‑M1/1‑124 (MQ=255) gCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaa > 8:1376317‑M1/1‑123 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat < 6:1476856‑M1/150‑31 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaat < 3:12954‑M1/150‑31 (MQ=255) aTGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaa < 2:1512117‑M1/149‑30 (MQ=255) gATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataa < 1:484366‑M1/150‑33 (MQ=255) aTACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataatt < 1:403791‑M1/151‑35 (MQ=255) tACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaataaaaataatt > 6:331305‑M1/1‑116 (MQ=255) aCAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattataataattc < 4:159827‑M1/150‑36 (MQ=255) cAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctc > 3:595202‑M1/1‑114 (MQ=255) aTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttg < 3:1660593‑M1/151‑41 (MQ=255) aTCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttg < 2:1721057‑M1/151‑41 (MQ=255) tCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgc > 5:860038‑M1/1‑110 (MQ=255) cGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaaataagcgaaaattaaaataattctcttgcagg > 5:1155839‑M1/1‑105 (MQ=255) gtgtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggaga < 2:411249‑M1/151‑48 (MQ=255) gtgtTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcagg > 2:1474529‑M1/1‑104 (MQ=255) ttCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagg > 1:1794918‑M1/1‑101 (MQ=255) tCAACTACCGATGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAATCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagg < 3:1127886‑M1/150‑51 (MQ=255) tCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaagg < 4:1107935‑M1/150‑51 (MQ=255) cAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggac < 3:696650‑M1/151‑53 (MQ=255) aaCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggac > 5:474456‑M1/1‑98 (MQ=255) aCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaa < 5:1287940‑M1/151‑55 (MQ=255) aCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca > 5:391309‑M1/1‑97 (MQ=255) aCTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggaca > 5:1463324‑M1/1‑97 (MQ=255) aCCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagagaaaattaaaataattctcttgcagcagaaggacaatgt > 2:899911‑M1/1‑94 (MQ=255) cGAGTACAATTATCATCCGCGATGTCGTGAATCAACACTGAGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTTCATTgctttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtat < 6:1542308‑M1/151‑60 (MQ=255) cGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtat < 8:30497‑M1/151‑60 (MQ=255) gAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtata < 2:335908‑M1/151‑61 (MQ=255) gAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtat > 5:1910439‑M1/1‑91 (MQ=255) ggACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatt > 1:703018‑M1/1‑89 (MQ=255) gACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatattt < 8:1652886‑M1/151‑64 (MQ=255) aaTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttatt > 7:1826190‑M1/1‑85 (MQ=255) aTTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattg > 7:1465059‑M1/1‑84 (MQ=255) tATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattgg > 5:1534343‑M1/1‑82 (MQ=255) atcatcCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggat > 7:1174199‑M1/1‑81 (MQ=255) ccGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggatttta < 4:1136002‑M1/150‑75 (MQ=255) gACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtc < 4:946811‑M1/150‑82 (MQ=255) aCGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctg > 7:1309109‑M1/1‑68 (MQ=255) agaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggct > 8:1207610‑M1/1‑65 (MQ=255) gaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggcta < 1:116215‑M1/151‑88 (MQ=255) gaAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggct > 3:812924‑M1/1‑64 (MQ=255) aaCACTGCGGATAATTGTAATATTATTGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgct < 4:753654‑M1/151‑93 (MQ=255) aaCACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgct > 1:1367242‑M1/1‑59 (MQ=255) aaCACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgct < 7:697410‑M1/151‑93 (MQ=255) gCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacaga < 4:1002195‑M1/150‑98 (MQ=255) ggATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaat > 7:39215‑M1/1‑51 (MQ=255) ggATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaat < 1:253805‑M1/151‑101 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatta < 5:1673984‑M1/151‑103 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaatt > 4:716800‑M1/1‑49 (MQ=255) aTAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtatggctattgctacagaaatt > 6:658388‑M1/1‑49 (MQ=255) tAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattac > 3:1907010‑M1/1‑48 (MQ=255) aaTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttagctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattacc > 6:952589‑M1/1‑47 (MQ=255) aTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCCGGACGTTATTTGCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattacaataattctcttgcaggagacggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccg < 2:702477‑M1/151‑106 (MQ=255) aTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccg < 5:1794597‑M1/151‑106 (MQ=255) aTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccg < 2:570594‑M1/151‑106 (MQ=255) aTTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccg < 3:892243‑M1/151‑106 (MQ=255) tGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggt > 3:861839‑M1/1‑44 (MQ=255) tGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccgg < 8:266588‑M1/150‑107 (MQ=255) tGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattacaggt > 6:605464‑M1/1‑44 (MQ=255) tGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctaaagaaattaccggt > 4:441185‑M1/1‑44 (MQ=255) tAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtac > 6:1391089‑M1/1‑42 (MQ=255) aaTATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtac < 7:262068‑M1/150‑110 (MQ=255) atatTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgc < 8:1463129‑M1/151‑112 (MQ=255) attatGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctg > 1:1624244‑M1/1‑38 (MQ=255) atGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtc > 2:1855459‑M1/1‑35 (MQ=255) aaTTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaa > 4:1729832‑M1/1‑29 (MQ=255) aTTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaat > 3:12085‑M1/1‑28 (MQ=255) ttGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctatttctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg > 2:35096‑M1/1‑26 (MQ=255) ttGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgg > 5:163423‑M1/1‑26 (MQ=255) tCAGGACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcg > 7:1582358‑M1/1‑22 (MQ=255) ggACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcg > 8:1553481‑M1/1‑19 (MQ=255) gACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgt > 6:233134‑M1/1‑18 (MQ=255) gACGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgt > 3:1916547‑M1/1‑18 (MQ=255) cacGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacacaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgt > 8:812622‑M1/2‑18 (MQ=255) aCGTTATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtc > 1:87259‑M1/1‑17 (MQ=255) tATTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtg > 5:769006‑M1/1‑13 (MQ=255) aTTTTCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtg > 5:1198641‑M1/1‑12 (MQ=255) tttCTACATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgag < 8:539927‑M1/150‑141 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaat > 8:1299545‑M1/1‑5 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaat > 1:1906165‑M1/1‑5 (MQ=255) aCATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaa < 8:1830485‑M1/149‑145 (MQ=255) cATTggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatg < 1:1027273‑M1/151‑148 (MQ=255) tggtttcgctgaattaagcgaaaattaaaataattctcttgcaggagaaggacaatgtatatttattggattttattaggtctggctattgctacagaaattaccggtacgctgtcaatgaaatgggcgagcgtcagtgagggaaatggc < 4:315904‑M1/150‑150 (MQ=255) | AGTGAAAATATTTTGAGTTAATTCTTAAGCTATGATACAAATCAGGCGTGTTCAACTACCGAGGACAATTATCATCCGCGATGACGAGAAGCAACACTGCGGATAATTGTAATATTATGGACAATTTGTTCAGGACGTTATTTTCTACATTTACCCATCTTCGTACCTCATCCACTATCTTGCTCGTAGGTGAGCAGCACTGGCGCAACGCGCTTTAGTCCTTTCTTCTGCCAAAGCTTGCGCTATGCGCGGGGCTTGACCACTTTACTTTGGTTTCGCTGAATTAAGCGAAAATTAAAA > DH1/2204653‑2204952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |