| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 359487 | 610 (3.840) | 7 (0.050) | 4/140 | 14.6 | 1.3% | coding (272/1155 nt) | cynX | CynX |
| ? | NC_000913 | 359506 = | 523 (3.530) | coding (291/1155 nt) | cynX | CynX | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/359408‑359487‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCC > NC_000913/359506‑359580 CGTCGCATTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGC < 1:4827579/76‑1CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCCAAGTGCGC > 2:564629/1‑76CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGC > 1:3650129/1‑76CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGC < 1:660245/76‑1CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGC > 1:3876506/1‑76CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGC < 1:4525311/76‑1CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGC < 1:299625/76‑1CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGCGCGC > 2:4860589/1‑76 GTCGCAGTGTCGCCGGAAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGGAAAGTGCGCT < 2:4033434/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGCGCTTTACCCCGCAAAGTGCGC > 1:1438076/1‑76 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT > 1:3558168/1‑76 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:3798959/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:384387/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 2:3635591/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT > 2:2622394/1‑76 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:5176388/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT > 1:2202287/1‑76 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT > 1:1964988/1‑76 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 2:2175770/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:1807237/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:1451328/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:1388827/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 2:1507404/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 1:1033105/76‑1 GTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTGA‑CCCGCAAAGTGCGCT < 2:4444162/76‑1 gCGCAGTGTCGCCATCGGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTG < 2:1053372/75‑1 TCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCCAAGTGCGCTG > 1:4972460/1‑76 TCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTG < 2:2165172/76‑1 TCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTG > 1:2239171/1‑76 TCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTCAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTG > 2:4025668/1‑76 CGCAGTGTCGCCATCGTTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC < 2:2725884/76‑1 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC < 1:547807/76‑1 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC < 1:3145615/76‑1 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC < 1:3144265/76‑1 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC > 2:1313039/1‑76 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC < 1:1905743/76‑1 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCCCTGC > 2:3970772/1‑76 CGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCATCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGC < 1:3493250/76‑1 gacGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTG‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 1:33129/73‑1 GCAGTGTCGCCCTCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 2:2260624/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCCAAGTGCGCTGCT > 1:5803558/1‑76 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 1:1637891/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 2:2535441/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 1:2458593/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 1:1094985/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 2:4130065/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT > 2:3792532/1‑76 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 2:3815412/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 1:3796945/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 1:3675611/76‑1 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT > 1:3550526/1‑76 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCCGCT > 2:4137089/1‑76 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCAGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT > 1:3088595/1‑76 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGACGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT > 2:4223883/1‑76 GCAGTGTCGCCATCAGTCTGGTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 2:91541/76‑1 GCAGGGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT < 2:1513508/76‑1 TGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCCAAGTGCGCTGCTTctt < 2:3973161/76‑4 GTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGAT > 1:1081550/1‑76 CTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAC < 2:1081550/76‑1 ggcGCGCTGGTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGC < 2:5171808/73‑1 GCGCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGC < 1:3316260/76‑1 GCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGC < 2:1234453/76‑1 GCTGCGTGGTGGGGTTGGGATGGGCATCATTCAGGCTGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCGGCAGCGC < 2:2334519/76‑1 gTGCTGGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCA < 2:69808/75‑1 cgGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATTATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCA < 2:5413537/74‑1 CTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCA < 2:1024070/76‑1 CTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCA < 1:4447386/76‑1 CTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTTAGCAGCGgc > 1:5043583/1‑74 CTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGGGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTTCGCAGCGCc > 2:4259440/1‑75 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 2:1537412/76‑1 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 2:1742618/76‑1 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 1:259901/76‑1 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 1:4137090/76‑1 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 2:4303390/76‑1 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 1:3336592/76‑1 TGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGGTTTGCAGCGCgc > 1:1988221/1‑74 TGCTGGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCTGTGGTGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 1:5584599/76‑1 TGCTGGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCAC < 1:83823/76‑1 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACG < 1:3066491/76‑1 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACG < 1:4864946/76‑1 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACG < 1:4223884/76‑1 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACG < 1:4800382/76‑1 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTTAGCCGCGCgcc > 2:5194364/1‑73 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTTAACAACGCACc > 1:2634295/1‑75 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTCCGCACCGCACc > 2:3166851/1‑75 GCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGGTTTGCAGGGCACG > 1:3082164/1‑76 CTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTTTGCCGCGCACGC > 1:3655486/1‑76 TTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCC < 1:724589/76‑1 TTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCC < 1:543164/76‑1 TTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTTTGCAGCGCACGCC > 1:4029022/1‑76 TTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTAAGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCC < 2:5232725/76‑1 TTGGGGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCC < 1:307945/76‑1 CGTCGCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTA‑CCCGCAAAGTGCGCTGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/359408‑359487‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgctTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCC > NC_000913/359506‑359580 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |