| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 359487 | 610 (3.840) | 7 (0.050) | 4/140 | 14.6 | 1.3% | coding (272/1155 nt) | cynX | CynX |
| ? | NC_000913 | 359506 = | 523 (3.530) | coding (291/1155 nt) | cynX | CynX | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 630 total aligned reads displayed.
GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCG > NC_000913/359412‑359562 | gCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgct < 1:2458593/76‑1 (MQ=255)gCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgct > 2:3792532/1‑76 (MQ=255)gCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgct < 1:3675611/76‑1 (MQ=255)gCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCAGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgct > 1:3088595/1‑76 (MQ=255)gCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGACGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgct > 2:4223883/1‑76 (MQ=255) cAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctg < 1:2903088/76‑1 (MQ=255) cAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctg > 1:2540741/1‑76 (MQ=255) cAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctg > 1:3760016/1‑76 (MQ=255) aGTGTCGCCGTCAGCCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGCTGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctgc < 2:3451937/76‑1 (MQ=255) aGTGTCGCCCTCAGTCTGGTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTTCgctgctgc < 2:5234394/76‑1 (MQ=255) aGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctgc > 1:1866418/1‑76 (MQ=255) aGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctgc < 1:5002925/76‑1 (MQ=255) gtgtCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctgct > 1:2971900/1‑76 (MQ=255) gtCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCTGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTa < 1:5837700/76‑1 (MQ=255) gtCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTa < 2:4309982/76‑1 (MQ=255) tCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTag > 1:5205096/1‑76 (MQ=255) cGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTagc < 2:2243492/76‑1 (MQ=255) gCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTCCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTagca < 1:982501/76‑1 (MQ=255) gCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTagca < 2:2763168/76‑1 (MQ=255) ccATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGAATTGATGCGCGAGCTTTACCCGCAACGTGCGCTGATGCTTagcag > 1:4693296/1‑76 (MQ=255) cATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTagcagc > 2:4971828/1‑76 (MQ=255) aaTCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCTTTGCTGAGTAAGCTTTCCCCGCCCAGTGCGCTGCTGCTTcgcagc < 2:1266173/75‑1 (MQ=255) ttgaGTGTGTGGGTGATTGCCGTCGGTGTATTGGTGCGTGAGCTTTCTCCGCAACGTGCGCTGCTGCTTAGCAgcg < 2:1327550/73‑1 (MQ=255) aTCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCgctgctgct > 1:3546181/1‑68 (MQ=255) tCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGGGCCCCGCTGCTTAGCCgcgc > 2:5618488/1‑76 (MQ=255) tCAGTCTGTGGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAgcgc < 2:2667380/76‑1 (MQ=255) cAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCa < 2:5097268/76‑1 (MQ=255) aGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCAc < 1:1552401/76‑1 (MQ=255) gTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACt < 2:3043127/76‑1 (MQ=255) gTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACt < 2:4616618/76‑1 (MQ=255) tCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTTATGCGTGAGCTTTCCCCGCAAAGTGCTCTGCTTCTTCTCAGCGCaacg > 1:1242216/1‑73 (MQ=255) tCTGTTGCTGATTACCGTCGATACATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAGAGTGCGCTGCTGCTTCGCAGCGCCCTg < 1:4289411/76‑1 (MQ=255) cTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGc < 2:3916491/76‑1 (MQ=255) cTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGc > 2:2897625/1‑76 (MQ=255) gTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCtt < 2:5489455/76‑1 (MQ=255) ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtg < 2:2531359/76‑1 (MQ=255) ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtg > 2:1136343/1‑76 (MQ=255) tGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtgg > 1:798751/1‑76 (MQ=255) cTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtg > 2:3341184/1‑76 (MQ=255) tGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtgg > 1:4557662/1‑76 (MQ=255) tGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtgg < 2:2470507/76‑1 (MQ=255) tGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtgg < 1:940170/76‑1 (MQ=255) gATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggg < 1:4922050/76‑1 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTagc < 2:1908194/57‑1 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggtgg > 1:4247954/1‑76 (MQ=255) cggcGGTGCATTGAGGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGtggggtgggg < 2:91255/73‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGtggggtgggg > 1:235240/1‑76 (MQ=255) cGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGtggggtgggg > 2:1552654/1‑76 (MQ=255) gTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTCCTTGGTGGGGGGGGGa > 1:73730/1‑76 (MQ=255) ggTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCg > 1:5740694/1‑76 (MQ=255) gTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCgg > 1:5574755/1‑76 (MQ=255) aTTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatc > 1:1083689/1‑76 (MQ=255) ttGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatca < 2:834058/76‑1 (MQ=255) ttGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatca > 1:5261149/1‑76 (MQ=255) tGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatcat > 2:1725115/1‑76 (MQ=255) tGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGCGGGGATCGGtatcat > 1:3873853/1‑76 (MQ=255) aTGCGGGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTc < 2:3731865/76‑1 (MQ=255) tGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCa > 1:1047320/1‑76 (MQ=255) tGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCa < 1:2109264/76‑1 (MQ=255) tGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCa < 1:2231778/76‑1 (MQ=255) gCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAg > 1:3033288/1‑76 (MQ=255) gTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGc > 1:4075346/1‑76 (MQ=255) gTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGCGGGGACCGGCATCATTCCGGc > 2:5832572/1‑76 (MQ=255) tGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTCGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGCTCGGCATCATTCAGGCg > 2:407338/1‑76 (MQ=255) gAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCgg < 2:737279/76‑1 (MQ=255) gAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCgg > 1:4193224/1‑76 (MQ=255) aGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGt > 1:4379915/1‑76 (MQ=255) tcTTTACCCGCAACGTGCTGTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGTGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTg < 1:2010949/75‑1 (MQ=255) gCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTg < 1:2840466/76‑1 (MQ=255) tttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 2:4514693/76‑1 (MQ=255) tttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 1:262132/76‑1 (MQ=255) tttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGGGAt > 2:4882154/1‑76 (MQ=255) tttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGCGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt > 2:2165611/1‑76 (MQ=255) ttgaCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCATGGCACTGCTTGGTGGGGTAGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 1:88659/73‑1 (MQ=255) tctACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 2:2037639/74‑1 (MQ=255) ttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATg > 2:3983181/1‑76 (MQ=255) tACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGc > 1:5082035/1‑76 (MQ=255) aCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGcc > 1:3228937/1‑76 (MQ=255) cccGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCt < 1:4785672/76‑1 (MQ=255) cGCAAGGTGCGCTGCTGCTTCGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGTTGATGCCTTc < 1:3975922/76‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc < 1:1669498/76‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGCGCGGCTGCTGAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc < 2:1776167/76‑1 (MQ=255) aaaGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCggg > 1:1738900/1‑75 (MQ=255) aaaGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGt < 2:3656798/76‑1 (MQ=255) aaaGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGt < 2:2354452/76‑1 (MQ=255) aaaGGGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGt < 2:4767594/76‑1 (MQ=255) aaGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTg < 1:1172479/76‑1 (MQ=255) aGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCGCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGa < 1:3597609/76‑1 (MQ=255) aGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGa < 1:1412515/76‑1 (MQ=255) gTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGAt < 2:2807137/76‑1 (MQ=255) cgcgGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTaa < 2:4177347/76‑1 (MQ=255) gctgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTaaa > 2:1463913/1‑76 (MQ=255) gctgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGGGATTaaa > 2:4388021/1‑76 (MQ=255) gctgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGGGATGCCTTCGGCGACTaaa > 2:4462563/1‑76 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg > 2:5351179/1‑76 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg < 2:3160562/76‑1 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcgg > 1:1790696/1‑76 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGGGGTTAAAcgg > 2:5721828/1‑76 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTCGGGATCGGCATCATTCATGCGGTGATGCCTTCGCTGATTaaaacg > 1:5428919/1‑73 (MQ=255) ctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcggc < 1:3372713/76‑1 (MQ=255) | GCAGTGTCGCCATCAGTCTGTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCG > NC_000913/359412‑359562 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |