| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 359487 | 610 (3.840) | 7 (0.050) | 4/140 | 14.6 | 1.3% | coding (272/1155 nt) | cynX | CynX |
| ? | NC_000913 | 359506 = | 523 (3.530) | coding (291/1155 nt) | cynX | CynX | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 564 total aligned reads displayed.
GTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCA > NC_000913/359431‑359581 | gTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCtt < 2:5489455/76‑1 (MQ=255) ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtg > 2:2702752/1‑76 (MQ=255) ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtg < 2:2531359/76‑1 (MQ=255) ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtg > 1:5779662/1‑76 (MQ=255) ttGCTGATTGCCGTCGGTGCATAGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtg < 1:4283417/76‑1 (MQ=255) gCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggt > 2:1358207/1‑76 (MQ=255) gCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCAGCGGCTTAGCAGCGCACTGATtggc > 2:1271196/1‑75 (MQ=255) tGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtgg > 1:4557662/1‑76 (MQ=255) tGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTtggtgg < 2:2470507/76‑1 (MQ=255) gATTGCGGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAATGGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggg < 2:5234596/76‑1 (MQ=255) gATTGCCGTCGGTGCATTGGTGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggg < 1:4167628/76‑1 (MQ=255) aTTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtgggg > 2:4936386/1‑76 (MQ=255) ttGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggt < 2:5531301/76‑1 (MQ=255) ttGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggg > 1:397671/1‑75 (MQ=255) ttGCCGTCGGTGCAGCGATGCGTGGGCTTTACCCGCAAAGGGCGCTGCTGCTTTGCCGCGCACTCCTtggtggcgg > 2:3594846/1‑73 (MQ=255) tGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggtg > 1:2119336/1‑76 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggtgg > 1:957968/1‑76 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggtgg < 1:765857/76‑1 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggtgg > 1:685308/1‑76 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTggtggggtgg > 2:2855514/1‑76 (MQ=255) gCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCCGCTGCTTAGCAGCGCACCCGTTgggggggcgg > 2:439949/1‑76 (MQ=255) cggcGGTGCATTGAGGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGtggggtgggg < 2:91255/73‑1 (MQ=255) gTCGGCGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGa > 1:3506613/1‑76 (MQ=255) tCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGAt < 1:844157/76‑1 (MQ=255) cGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATc < 1:2622394/76‑1 (MQ=255) ggTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCg < 1:4868546/76‑1 (MQ=255) ggTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCGGCTGCTTAGCAGCGCACCGATTGGCGGGGTGGGGAGCg > 2:2177179/1‑76 (MQ=255) gTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCgg > 1:5574755/1‑76 (MQ=255) gTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGGGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCGTGGTGGGGTGGGGAGCgg > 1:3664357/1‑76 (MQ=255) tGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGc < 2:4269384/76‑1 (MQ=255) tGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGc < 2:3980603/76‑1 (MQ=255) tGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGc > 1:2953472/1‑76 (MQ=255) aTTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatc > 1:4662831/1‑76 (MQ=255) tGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatcat > 2:1725115/1‑76 (MQ=255) tGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGcatcat > 1:5424918/1‑76 (MQ=255) tGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGCGGGGATCGGtatcat > 1:3873853/1‑76 (MQ=255) aggCGTGAGCTTTCCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTc < 1:1440829/74‑1 (MQ=255) aTGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTc > 1:913255/1‑76 (MQ=255) aTGCGGGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTc < 2:3731865/76‑1 (MQ=255) tGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCa > 1:1047320/1‑76 (MQ=255) tGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCa > 2:4775818/1‑76 (MQ=255) tGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCa < 2:5740693/76‑1 (MQ=255) gTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGc > 2:4496962/1‑76 (MQ=255) gTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGc > 2:1510392/1‑76 (MQ=255) gTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGc < 2:2414766/76‑1 (MQ=255) gTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGCGGGGACCGGCATCATTCCGGc > 2:5832572/1‑76 (MQ=255) tGAGCTTTACCCGCAAAGTGCACTGCTGCTCAGCAGCGCACTCCTTCGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCATGCg > 1:2712753/1‑76 (MQ=255) gAGCTGTGCCCGAAAAGTGCGCTGGTGCTTAGCGGTGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATTATGCAGGCgg < 2:3382376/76‑1 (MQ=255) aGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGt > 1:4379915/1‑76 (MQ=255) aGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGt < 1:1858503/76‑1 (MQ=255) cTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGa < 2:4863481/76‑1 (MQ=255) tttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 2:4557661/76‑1 (MQ=255) tttACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 1:3729941/76‑1 (MQ=255) tctACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGAt < 2:2037639/74‑1 (MQ=255) tACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGc < 1:1196475/76‑1 (MQ=255) aCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGcc > 1:3211444/1‑76 (MQ=255) aCCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGcc < 2:3211444/76‑1 (MQ=255) cccGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCt < 1:4785672/76‑1 (MQ=255) ccGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCtt > 1:5383533/1‑76 (MQ=255) cGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc > 1:109903/1‑76 (MQ=255) cGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc < 1:2381575/76‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc < 1:1669498/76‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGCGCGGCTGCTGAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTc < 2:1776167/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCtttcg > 1:5676542/1‑73 (MQ=255) cAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCgg < 1:2897625/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCgg < 1:5154959/76‑1 (MQ=255) aaaGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCggg > 1:2335993/1‑75 (MQ=255) aaGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTg > 2:1916904/1‑76 (MQ=255) aGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCGCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGa < 1:3597609/76‑1 (MQ=255) ggcgcTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGAtt < 2:5172700/75‑1 (MQ=255) cgcTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTaa < 2:4142693/76‑1 (MQ=255) gctgctgctTAGCAGCGCCCTGCTTGGTGGGGTGTGGCTCTGCATCCTTCAGTCGTTGATTCCTTCGGTGATTaaa < 2:5050385/76‑1 (MQ=255) gctgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTaaa < 2:229024/76‑1 (MQ=255) ctgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAc < 1:4074769/76‑1 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg > 2:5351179/1‑76 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg < 2:2952588/76‑1 (MQ=255) tgctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg < 2:2782431/76‑1 (MQ=255) tgcggctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcg < 2:1048771/76‑1 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcgg < 1:1297373/76‑1 (MQ=255) gctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcgg > 1:303106/1‑76 (MQ=255) ctgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcggc < 1:3372713/76‑1 (MQ=255) tgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcggcg > 1:1761704/1‑76 (MQ=255) tgctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcggcg < 2:4205135/76‑1 (MQ=255) gctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcggcgg > 1:2452383/1‑76 (MQ=255) ctgagcagcACACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAGCGGCGGt < 1:5526437/73‑1 (MQ=255) ctTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAAcggcggg > 2:4346634/1‑75 (MQ=255) ttAGCAGCGCGCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGtt < 2:1573132/76‑1 (MQ=255) taagcagcGCACTGCCTGCAGGGGTGGGGATCGGAATCATTCAGGCGGAGATGCAATCGGCAGTTGAACGGAGGtg > 2:3132726/3‑75 (MQ=255) agcagcGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTc < 2:3788589/76‑1 (MQ=255) cagcGCTCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGgtttcg > 1:4982380/1‑73 (MQ=255) agcGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGttt < 1:1975759/72‑1 (MQ=255) cgcACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTcagcag < 2:818616/76‑1 (MQ=255) gcACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTcagccgc < 1:1725115/76‑4 (MQ=255) gcACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCagcagc < 1:2213725/76‑1 (MQ=255) cACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAgcg < 1:2547717/76‑1 (MQ=255) cACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGTTTagcagcc > 1:5215958/1‑75 (MQ=255) aCTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGGGTTAGCAgggc > 1:2047594/1‑76 (MQ=255) gtGCTGGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCa < 2:69808/75‑1 (MQ=255) gCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACg < 1:4223884/76‑1 (MQ=255) ttGGGGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGcc < 1:307945/76‑1 (MQ=255) | GTTGCTGATTGCCGTCGGTGCATTGATGCGTGAGCTTTACCCGCAAAGTGCGCTGCTGCTTAGCAGCGCACTGCTTGGTGGGGTGGGGATCGGCATCATTCAGGCGGTGATGCCTTCGGTGATTAAACGGCGGTTTCAGCAGCGCACGCCA > NC_000913/359431‑359581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |