| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 731453 | NA (NA) | 7 (0.050) | 7/142 | 12.9 | NA | coding (2648/4194 nt) | rhsC | RhsC |
| ? | NC_000913 | = 731461 | NA (NA) | coding (2656/4194 nt) | rhsC | RhsC | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
ACACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/731375‑731453‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccggTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGT < NC_000913/731461‑731387 tCACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCAC < 1:324781/75‑1ACACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCAC > 1:4657318/1‑76ACACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCAC > 1:4602763/1‑76ACACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACACAACCAC > 2:333365/1‑76ACACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGGTACAGCGACAGCACCAC > 2:2294158/1‑76 cgCCTGGGACTGCAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC < 2:1401574/74‑1 ccCCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC < 1:2848531/74‑1 CACCTGGACCGACAACGGCGAACTCATCCGCAGCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC < 1:1258278/76‑1 CACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC < 1:4120952/76‑1 CACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC > 1:5215443/1‑76 CACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC > 2:2639296/1‑76 CACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC > 2:1821067/1‑76 CACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC > 1:2070165/1‑76 CACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC > 1:285483/1‑76 CACCGGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACC < 2:4060017/76‑1 gCCTGGACCGACAGCGGCGAACGCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG < 2:110937/75‑1 cCCTGGGAGGACAACGGCGAACTCGTCCGCATCAGCAGCCCGCGCCGGACCCGGAGTTACAGCTACAGCAGCACCG < 2:1914652/75‑1 cCCTGGAACGACAGCGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG < 2:3354417/75‑1 cCCTGGAACGACACCGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG < 1:706109/75‑1 cCCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG < 1:1354108/75‑1 cCCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGGTACAGCTACAGCACCACCG < 1:1365854/75‑1 aaCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACCACTACAACACCACCG > 1:787873/3‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGACCTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGGCCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG < 2:1894407/76‑1 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCCGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG > 2:4607503/1‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCCGAACCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG > 1:5757312/1‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG > 2:1814114/1‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG > 1:2236202/1‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCG > 2:1092340/1‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGGTACAGCTACAGCACCACCG > 1:800016/1‑76 ACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGAATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCGACCGCCCCACCa > 2:5656462/1‑75 CCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACCGCACCACCcg > 2:5291456/1‑74 CCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCGG < 1:2007107/76‑1 CCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCCCCAGACCCGGAGGTACAGCTACAGCACCACCGG > 2:1592832/1‑76 AGTTACAGCTACAGCACCACCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTCTAACTCCGGGGCTGGCGCGGGGTGCcg > 2:3884320/1‑74 GTTACAGCTACAGCACCACCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGGCTGGGGGGGGGTGCTGt > 2:402018/1‑75 TACAGCACCACCGGTCATCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCT > 2:4884168/1‑66 TACAGCACCACCGGTCATCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCT < 1:4884169/66‑1 CAGCACCACCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAG > 2:2049283/1‑76 AGCACCACCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGAT < 1:651418/66‑1 AGCACCACCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGAT > 2:651418/1‑66 gcgGGTGAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCG < 2:1758567/73‑1 CCGGTCAGCCTGCCTGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT < 1:1157043/76‑1 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT < 1:1462959/76‑1 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT > 1:1894627/1‑76 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT < 2:2334376/76‑1 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT > 1:3586831/1‑76 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT > 1:3653195/1‑76 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT > 1:1591555/1‑76 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGT < 1:3972013/76‑1 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGCCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGCTGAGTTCGCCGT > 2:4952058/1‑76 CCGGTCAGCCTGCCGGTGGCGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTAGCCGT > 1:2489261/1‑76 gGGTGAGCGTGCCGTTGGTGCTGTAGCTGTACCTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 2:1898015/75‑1 gGGTCCGCCGGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAGCTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 1:265681/75‑1 gGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 2:4427131/75‑1 CGGTGAGCCTGCCGTTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 1:1638634/76‑1 CGGTCGGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 1:4099155/76‑1 CGGTCGGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 2:5594753/76‑1 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTACCTCCGGGTCTGGCGGGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGct > 2:3630119/1‑74 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGGGCGGGCTGCTGAT < 2:3704217/58‑1 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGGGCGGGCTGCTGAT > 1:3704217/1‑58 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGGTGCGGATGAGTTCGCCGTT > 1:1898955/1‑76 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 1:1033504/76‑1 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT < 2:2970552/76‑1 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT > 1:4921483/1‑76 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT > 1:4056006/1‑76 CGGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTT > 1:4342786/1‑76 cGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTG > 2:5668288/2‑76 GGTCGGCCGGCCGTGGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTG < 2:1423626/76‑1 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGCTGCGCTCGCCGTTG > 2:2114964/1‑76 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTG > 1:603335/1‑76 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTG > 1:5811297/1‑76 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTG > 1:4314491/1‑76 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGGTCGCCGTTG > 1:360147/1‑76 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCCGGCCGCTGATGCGGATGAGCTCGCCCTTG > 2:734276/1‑76 GGTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACGCCGGGTCTGGCGAGGGCTGCTGGTGCGGATGAGTTCGCCGTTG > 2:2390653/1‑76 GTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGc > 1:1024372/1‑75 GTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGT > 1:4372507/1‑76 GTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGT > 1:5817717/1‑76 GTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGT < 2:3987269/76‑1 ACACCTGGAACGACAACGGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/731375‑731453‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccggTCAGCCTGCCGGTGGTGCTGTAGCTGTAACTCCGGGTCTGGCGCGGGCTGCTGATGCGGATGAGTTCGCCGTTGT < NC_000913/731461‑731387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |