| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 289082 = | 664 (4.180) | 5 (0.030) | 4/140 | 14.6 | 0.79% | coding (448/1005 nt) | argF | ornithine carbamoyltransferase 2 chain F |
| ? | NC_000913 | 289096 = | 635 (4.280) | coding (434/1005 nt) | argF | ornithine carbamoyltransferase 2 chain F | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/289161‑289082‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgcATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCA > NC_000913/289096‑289170 GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGTGGGGCCTGAAGACCCTGCACGCGCAC > 1:4083449/1‑76GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGCTGACCATGCCGGAGCAC > 2:5670384/1‑76GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 1:960137/76‑1GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 2:3381424/76‑1GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 2:3561814/76‑1GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 2:787430/76‑1GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC > 2:1869304/1‑76GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC > 1:1732737/1‑76GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 1:4237547/76‑1GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC > 1:497468/1‑76GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 1:2282269/76‑1GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCAC < 2:5086938/76‑1 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCACCGAGGTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCTGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC < 1:3228248/76‑1 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCATCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 1:1362074/1‑76 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 1:4577717/1‑76 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 1:4863713/1‑76 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC < 1:5166587/76‑1 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC < 2:2141859/76‑1 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 2:3066176/1‑76 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC < 2:3362670/76‑1 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 2:1207218/1‑76 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 1:3535089/1‑76 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC < 1:1878066/76‑1 CCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGCTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACC > 1:4868499/1‑76 CGGTGTGGAACGGTGTGGCGAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGTCGGACCTGATGACCATGCAGGATCACCT < 2:1446396/76‑1 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCTCCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT < 2:2568814/76‑1 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCc > 2:4926922/1‑75 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT > 1:3358890/1‑76 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT < 1:5700604/76‑1 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT > 1:1356831/1‑76 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT < 2:3959775/76‑1 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT < 1:3795481/76‑1 CGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCT < 1:674059/76‑1 ggcGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCCGGCCGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 2:2233054/4‑76 GGTGTGGACCGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGCACTCATGCCCCTGCAGGAGCACCTc > 2:59260/1‑75 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 2:4046230/1‑76 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 1:4006387/1‑76 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 1:426767/1‑76 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 2:5193345/1‑76 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 2:3385510/1‑76 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG > 1:5357409/1‑76 GGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCCGGCGGACCTGATGACCATGCACGAGCACCTc > 2:5242444/1‑75 GGTGTGAAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTG < 1:1356382/76‑1 GTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGC > 1:2261639/1‑76 GTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGC > 1:4069431/1‑76 GTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGC < 2:3838027/76‑1 GTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCACGAGCACCTcc > 2:703295/1‑74 GTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGGTCCACACGACCCAGCTGCCGGAGGACCTGATGACCCTGCCGGAGCTCCTGC > 2:2283507/1‑76 GTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCACGCCGGAGCACCTGCAc > 2:940041/1‑75 GGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGAACCAGCTGCTGGAGGACCTGATGACCACGACGGCGCACCTGCAggc > 1:3038458/1‑73 CAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGCATGGTCATCAGG < 2:1598622/52‑1 CAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGCATGGTCATCAGG > 1:1598622/1‑52 gtGCACCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGC < 1:1734513/74‑1 cCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGC < 2:2954879/75‑1 CCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCC > 1:1956636/1‑76 gTGCATGGTCATCGGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACGCCGGCACGCCC < 2:883120/75‑1 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGTCACGCCC < 1:3342766/76‑1 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 2:4858951/1‑76 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 1:2426294/1‑76 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 1:2959439/1‑76 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC < 1:311118/76‑1 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC < 1:1801703/76‑1 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 1:4232958/1‑76 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC < 1:4306002/76‑1 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 1:1422438/1‑76 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 2:1285464/1‑76 CTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGCGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCC > 2:5088990/1‑76 CTGCATGGTCAGCTGGTGCGCCAGCAGCTCGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGGCCTTTCCACACCGGCACGCCC < 1:5482827/76‑1 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGCAATCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCCGCACGCCCG > 2:2561616/1‑76 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCc > 2:5216931/1‑75 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCG < 2:4961334/76‑1 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCG > 1:5713666/1‑76 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCG < 1:2899176/76‑1 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCG < 1:3596181/76‑1 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCG < 1:4055354/76‑1 TGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCCGCACCCCCc > 2:305414/1‑75 TGCAGGGTCATCATGTCCGCCAGCCGCTGGGTCGGGTGGACCTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCCCGCCCG < 1:5388645/76‑1 GCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGC > 2:2855015/1‑76 GCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGC > 1:4833273/1‑76 GCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGC < 1:546761/76‑1 GCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGC < 1:1152866/76‑1 CATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCc > 1:877423/1‑75 CATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCA > 1:2005679/1‑76 CATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGGCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCA < 2:3106695/76‑1 CATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGGTGGTACGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGac > 2:5240429/1‑74 CATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCCGGGGCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGACTGCA > 1:2845168/1‑76 CATGGTCACCAGGCCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCA < 1:222130/76‑1 GCCGGTGTGGAACGGGCTGACCAACGAGTTCCACCCGACCCAGCTGCTGGCGGACCTGATGACCATGCAGGAGCACCTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/289161‑289082‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgcATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCA > NC_000913/289096‑289170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |