| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 289082 = | 664 (4.180) | 5 (0.030) | 4/140 | 14.6 | 0.79% | coding (448/1005 nt) | argF | ornithine carbamoyltransferase 2 chain F |
| ? | NC_000913 | 289096 = | 635 (4.280) | coding (434/1005 nt) | argF | ornithine carbamoyltransferase 2 chain F | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 668 total aligned reads displayed.
CCAGCATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACAC > NC_000913/289007‑289157 | ccAGCATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCgg < 2:2637520/76‑1 (MQ=255) cAGCATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGc < 1:3036349/76‑1 (MQ=255) aGCATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCa > 1:2756241/1‑76 (MQ=255) cATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAgg > 2:2187847/1‑76 (MQ=255) cATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGCTAAACGCCTTGCCCGGCAgg > 2:4086249/1‑76 (MQ=255) aTCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGt > 1:3274235/1‑76 (MQ=255) aTCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGt < 1:37408/76‑1 (MQ=255) cGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCTTCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCCGCAGGGGc > 2:1196724/1‑76 (MQ=37) gAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGcc > 2:4863712/1‑75 (MQ=255) gAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCt < 2:2289758/76‑1 (MQ=255) gAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGCGCt > 2:5157151/1‑76 (MQ=255) aGTTGCGCATCTGGTGGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTc < 2:3350580/76‑1 (MQ=38) aGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTc > 1:5831573/1‑76 (MQ=255) gTTGCCGATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTATTCCCGCGTCATCTCGTTCAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTcc < 2:4404551/76‑1 (MQ=255) gTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTTCTcc > 1:5066768/1‑76 (MQ=255) ttGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCt < 1:4205510/76‑1 (MQ=255) ttGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCt > 2:7431/1‑76 (MQ=255) ttGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCt > 2:3213809/1‑76 (MQ=255) ttGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCt > 1:5541399/1‑76 (MQ=255) tGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTg > 1:1349893/1‑76 (MQ=255) cccATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCa > 1:4057838/1‑76 (MQ=255) ccATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCAt < 1:962261/76‑1 (MQ=255) ccATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATATCGATAAACGCCTTGCCCCGCAGGTGCTCCGGCAt > 1:2312324/1‑76 (MQ=37) aTGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATgg < 1:3186257/76‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATgg < 1:2425456/76‑1 (MQ=255) tgttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGtcat > 1:3058489/1‑76 (MQ=255) ttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGtcatca > 1:1106255/1‑76 (MQ=255) ttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGtcatca < 1:100987/76‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAgg < 2:2417559/76‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACCCCTCGCCCGGCAGCCGCCCCCGCATGCGCATCAgc > 2:5333792/1‑75 (MQ=255) cgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTcc > 1:4461159/1‑76 (MQ=255) cgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTcc < 1:5225446/76‑1 (MQ=255) gcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTTATCAGGTCCg > 1:4536297/1‑76 (MQ=255) gcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCg < 1:2606963/76‑1 (MQ=255) gcATCGCCCGCGTAAACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTc > 2:4991531/1‑74 (MQ=255) cATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGc < 1:1916764/76‑1 (MQ=255) cATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGc > 1:1651450/1‑76 (MQ=255) cATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGCGCCCCCCCACGGTCACCCGCTCCGc > 2:5646270/1‑76 (MQ=25) aTCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGcc > 1:2565561/1‑76 (MQ=255) aTCGCCCGCGTAGACCAGAGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCACGGGCATCCGGAACGcc > 2:1951415/1‑76 (MQ=255) cGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCTTCAGGTCCGCcag < 1:3478931/76‑1 (MQ=255) gCCCGGGTGGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCcagc < 2:4606938/76‑1 (MQ=255) gCCCGCGTAGTCCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCcagc > 2:2542015/1‑76 (MQ=255) gCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGCGCTCCCGCATGGTCATCCGGCccgcccgc > 2:147862/1‑76 (MQ=25) gcgTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCt > 1:2913132/1‑76 (MQ=255) gcgTAGACCAGCGTCATCTCGTCAAACGCCTTGCCCGGCAGGAGCCGCTGCATGCTCATCACGGCCCCCACCAGCt > 2:2938034/1‑76 (MQ=255) cgTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTg < 2:4016008/76‑1 (MQ=255) gTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTgg > 2:3559575/1‑76 (MQ=255) gTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTgg > 1:2677637/1‑76 (MQ=255) tAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTggg < 2:3119629/76‑1 (MQ=255) tAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTggg < 1:3587176/76‑1 (MQ=255) tAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGCTCATCAGGTCCTCCAGCAGCTggg > 2:4304269/1‑76 (MQ=255) aGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGt > 1:863645/1‑76 (MQ=255) gcccAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTc < 1:1825071/74‑1 (MQ=255) gACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTc < 1:807450/76‑1 (MQ=255) aCCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCg > 2:4461705/1‑76 (MQ=255) aCCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCg < 1:1956446/76‑1 (MQ=255) cAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCACCAGGTCCGCCAGCAGCCGGGTCcgg > 2:1874782/1‑76 (MQ=37) cAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCCGCATGGTCATCAGGTCCGCCCGCAGCCGGGTCcgg > 2:282126/1‑76 (MQ=255) aGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGtc > 2:3778005/1‑48 (MQ=255) gCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTg < 1:4868258/76‑1 (MQ=255) cGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGCgg > 2:2054231/1‑76 (MQ=255) gTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGa > 1:4301927/1‑76 (MQ=255) tCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGaa < 1:3119919/76‑1 (MQ=255) cATTTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGGGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAAc < 2:1345135/76‑1 (MQ=255) cATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAAc < 1:2976288/76‑1 (MQ=255) aTCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACt > 1:4604317/1‑76 (MQ=255) aTCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACt > 1:5127800/1‑76 (MQ=255) tctcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTc < 1:2028609/76‑1 (MQ=255) tctcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTc > 2:2724522/1‑76 (MQ=255) ctcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCg < 1:2132718/76‑1 (MQ=255) tggTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGt < 2:4695931/74‑1 (MQ=255) tcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGt < 1:2226131/76‑1 (MQ=255) tcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGt > 2:3451875/1‑76 (MQ=255) tcGTTAAACGCCGTGCCCAGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCATCTGGGTCGGGTGTAACTCGt < 1:5422500/76‑1 (MQ=255) gTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGGCGTCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTg < 2:3654727/76‑1 (MQ=255) ttAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTgg < 1:1538256/76‑1 (MQ=255) tAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGt < 1:3389239/76‑1 (MQ=255) aaccGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTc < 1:1448416/73‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTcg > 1:5776640/1‑75 (MQ=255) aaCGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCa > 1:3911475/1‑76 (MQ=255) cGCCTGGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGc < 1:740837/76‑1 (MQ=255) gCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGcc > 1:672091/1‑76 (MQ=255) gCCTTGCCCGGCAGGGGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCACACAGCAGCTGGGTCGGGCGGGACTGCGTGGTCCGcc > 2:5388644/1‑76 (MQ=255) ccTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGccc < 2:3058489/76‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGccc < 1:5650569/76‑1 (MQ=255) cTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCg > 1:413877/1‑76 (MQ=255) ttGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGt > 2:5517655/1‑76 (MQ=255) ttGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGt < 1:1746786/76‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGt < 2:4138733/76‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTc < 1:3317118/76‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTc > 2:1732737/1‑76 (MQ=255) cccGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTcc > 1:5274527/1‑76 (MQ=255) cccGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTcc > 1:3817821/1‑76 (MQ=255) ccGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCCGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCca < 2:3014970/76‑1 (MQ=255) ccGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCca < 2:1584910/76‑1 (MQ=255) ccGGCAGGGGCTCGTGCATGGTCAGCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCca < 2:824131/76‑1 (MQ=25) cGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCcac < 1:4995501/76‑1 (MQ=255) ggCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGACCTCGTTGGTCAGCCCGTTCcaca < 1:4392416/76‑1 (MQ=255) gCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCacac > 2:3838027/1‑76 (MQ=255) | CCAGCATCGAGTTGCCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGGTGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACAC > NC_000913/289007‑289157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |