| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 289082 = | 664 (4.180) | 5 (0.030) | 4/140 | 14.6 | 0.79% | coding (448/1005 nt) | argF | ornithine carbamoyltransferase 2 chain F |
| ? | NC_000913 | 289096 = | 635 (4.280) | coding (434/1005 nt) | argF | ornithine carbamoyltransferase 2 chain F | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 685 total aligned reads displayed.
CCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCAT > NC_000913/289021‑289171 | ccATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCAt < 1:962261/76‑1 (MQ=255) cATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATg > 1:813719/1‑76 (MQ=255) cATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATg < 1:4404181/76‑1 (MQ=255) tttttgttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATgg < 1:354737/73‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATgg < 2:1558378/76‑1 (MQ=255) aTGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATgg > 1:563578/1‑76 (MQ=255) gttgttGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGtc < 2:5366884/76‑1 (MQ=255) gttgttGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑CGCTCCTGCATggcc > 2:4944686/1‑74 (MQ=255) ttgttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGtca < 1:4161085/76‑1 (MQ=255) ttgttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑CGCTCCTGCCTGGcca > 2:4441625/1‑76 (MQ=38) tgttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGtcat < 2:2784789/76‑1 (MQ=255) tgttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCCGCAGG‑CGCTCCCGCCTGGccac > 2:4834138/1‑75 (MQ=37) tgttgCGCGCATCGCCAGCGAAGACTAGCGTGAGCTCGTTAAACGCCGGGCCCGGCACG‑TGCTCCTGCATGGtcat > 1:3340334/1‑76 (MQ=255) ttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGtcatca > 1:1106255/1‑76 (MQ=255) ttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGtcatca < 1:2946883/76‑1 (MQ=255) ttgCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGtcatca < 1:1934837/76‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAgg < 2:2417559/76‑1 (MQ=255) gcgcgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑CGCTACTGCATGGTCATCAgg > 1:3453260/1‑76 (MQ=255) gcgcgcAGCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAgg < 2:4009410/76‑1 (MQ=255) cgcgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGt > 1:581245/1‑76 (MQ=255) gcgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTc < 1:2861845/76‑1 (MQ=255) cgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTcc < 1:5225446/76‑1 (MQ=255) cgcATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTcc < 1:3272338/76‑1 (MQ=255) cgcATCGCCCGCGGAGGCCGGCGTAGTCTCGTAAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCGGCATGGTCATCAGGTcc < 2:5609641/76‑1 (MQ=255) cATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTcc > 2:3833091/1‑74 (MQ=255) cATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGc > 1:1651450/1‑76 (MQ=255) ctCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGcc < 1:504371/75‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGcc < 1:2630750/76‑1 (MQ=255) gCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCcagc < 2:3033482/76‑1 (MQ=255) gCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCcagc > 1:2166155/1‑76 (MQ=255) gCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCcagc > 1:1430842/1‑76 (MQ=255) gCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCcagc > 1:1968285/1‑76 (MQ=255) gCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGGCATCAGGTCCGCcagc > 1:378131/1‑76 (MQ=255) cccGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGCCCGCcagca > 2:841901/1‑76 (MQ=255) gcgTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCCGCt > 2:2547123/1‑76 (MQ=255) gTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCagcagc < 2:2973108/73‑1 (MQ=255) gTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTgg > 1:2044141/1‑76 (MQ=255) tAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTggg < 1:3189692/76‑1 (MQ=255) tAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGCTCATCAGGTCCTCCAGCAGCTggg > 2:4304269/1‑76 (MQ=255) aGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGt < 1:4093353/76‑1 (MQ=255) gcccAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTc < 1:1825071/74‑1 (MQ=255) gACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTTCTGCATGGTCATCAGGGCCGCCAGCAGCTGGGta > 1:3380892/1‑75 (MQ=255) gACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTc > 2:1734600/1‑76 (MQ=255) cAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCCGGGTCcgg > 2:1970267/1‑76 (MQ=255) cAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCACCAGGTCCGCCAGCAGCCGGGTCcgg > 2:1874782/1‑76 (MQ=37) aGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGt < 2:4647193/76‑1 (MQ=255) aGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGGCgggg > 2:5237831/1‑75 (MQ=255) cGTCATCTCGTGAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTgg < 1:700242/76‑1 (MQ=255) cGTCAGCTGGTTAGATGCTTTGACCGGTAGT‑TACTCGTGCATGGTCATCAGCCGCACCAGCAGCGGGTGCGGGTgg < 2:751475/76‑1 (MQ=255) gttaTCTCGTTAAACGCCTGCCCCGGCAGGCTGC‑CCTGCATGTTCACCATGTCGGCCTGCGGCTGGGTCGGCTGGa > 1:426253/4‑76 (MQ=255) gTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑AGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGCGCGGa > 1:2559109/1‑76 (MQ=38) aTCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACt > 1:5127800/1‑76 (MQ=255) tctcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTc < 2:4533894/76‑1 (MQ=255) tcgcGTTAAGCGCCTTGCCCGGCGGG‑TGCTCCTGCATGGTCGTCAGGTCCGCCAGCAGCTTGGTCGGGTGGAACTc < 2:1221021/73‑1 (MQ=255) ctcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCg < 2:3338593/76‑1 (MQ=255) tcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGGCGGGGGGAACTCGt > 2:228735/1‑76 (MQ=255) tcGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTCCGTCGGGTGGAACTCGt > 2:3712500/1‑76 (MQ=255) gTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGGCGGGTGGGACTCGTTg > 1:1248661/1‑76 (MQ=255) ttAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTgg < 1:1538256/76‑1 (MQ=255) tAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGGGGAACTCGTTGGt > 1:3137255/1‑76 (MQ=255) aaaCGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGGGGAACTCGTTGGTc > 2:2144520/1‑76 (MQ=255) gCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGcc < 2:2653658/76‑1 (MQ=255) gCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGcc > 1:3049849/1‑76 (MQ=255) ccTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGccc < 1:4480914/76‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCACCTGGGCCCGGCGGAACCCCCTCGTCAGccc > 2:1300561/1‑76 (MQ=255) ccTGGCCCGGCATG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGccc < 1:273016/76‑1 (MQ=255) catGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCg < 1:4636727/74‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCGGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGt > 1:3004328/1‑76 (MQ=255) ttGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGt < 1:1746786/76‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGt > 1:4033541/1‑76 (MQ=255) gtcccGGCAGG‑TGCTCCTGCATGTTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGtt < 1:2286065/74‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTc > 1:4542362/1‑76 (MQ=255) cccGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTcc > 1:5274527/1‑76 (MQ=255) ccGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCCGCAGCTGGGCCGGGTGGAACCCGTTGGCCCCCCCGTcccc > 2:5846726/1‑75 (MQ=255) ccGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCca > 2:4063550/1‑76 (MQ=255) cGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCcac < 1:3099474/76‑1 (MQ=255) cGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCcac > 1:3878863/1‑76 (MQ=255) cGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGCAGGGTGGAACTCGTTGGGCAGCCCGTTCcac > 1:234087/1‑76 (MQ=38) ggCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTTGTTGGTCAGCCCGTTCcaca < 2:348642/76‑1 (MQ=255) ggCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCcaca > 1:617031/1‑76 (MQ=255) ggCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCcaca > 2:1417318/1‑76 (MQ=255) ggCACG‑TGCTCCTGCACGGTCATCAGGTCCGCCCGCACCTGGGTCCGGCGGCACTCCTTGGTCAGCCCGTTCccca > 2:547021/1‑76 (MQ=255) cAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACAcc < 2:3385510/76‑1 (MQ=255) gg‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCgg < 1:4863713/76‑1 (MQ=255) gg‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGATGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCgg < 1:1362074/76‑1 (MQ=255) g‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGc < 1:497468/76‑1 (MQ=255) g‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGc > 2:5086938/1‑76 (MQ=255) g‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGc > 2:3561814/1‑76 (MQ=255) ggCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCa < 1:37366/75‑1 (MQ=255) gCTCGTGGATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCAc < 2:314870/76‑1 (MQ=255) gCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCAc < 2:2891713/76‑1 (MQ=255) cTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACg > 1:1002074/1‑76 (MQ=255) cTCCTGCATGGTCATCAGGGCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACg > 1:765479/1‑76 (MQ=255) tCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGc > 2:3076036/1‑76 (MQ=255) tCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGc > 2:4140996/1‑76 (MQ=255) cTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGccc < 1:4306002/76‑1 (MQ=255) cTGCATGGTCAGCTGGTGCGCCAGCAGCTCGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGGCCTTTCCACACCGGCACGccc < 1:5482827/76‑1 (MQ=255) tGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCg > 1:5713666/1‑76 (MQ=255) tGCAGGGTCATCATGTCCGCCAGCCGCTGGGTCGGGTGGACCTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGcccgcccg < 1:5388645/76‑1 (MQ=255) cATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGcc > 1:877423/1‑75 (MQ=255) | CCCATGTTGTTGCGCGCATCGCCCGCGTAGACCAGCGTCATCTCGTTAAACGCCTTGCCCGGCAGG‑TGCTCCTGCATGGTCATCAGGTCCGCCAGCAGCTGGGTCGGGTGGAACTCGTTGGTCAGCCCGTTCCACACCGGCACGCCCGCAT > NC_000913/289021‑289171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 5 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |