| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 1 (0.010) | 118 (0.770) | 80/144 | 0.4 | 99.2% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 1 (0.010) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > NC_000913/3156181‑3156331 | ttgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA < 1:988533‑M1/76‑1 (MQ=255)ttgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA < 1:574790‑M1/76‑1 (MQ=255) tgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAg > 1:5648055‑M1/1‑75 (MQ=255) gttgCCGACCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAgg < 2:948248‑M1/76‑3 (MQ=255) gttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAgg < 1:107886‑M1/76‑3 (MQ=255) gttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGGGGTTTCCGACTCTTACCCCCAgg > 2:5350253‑M1/1‑74 (MQ=255) ttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggc < 1:2090279‑M1/76‑4 (MQ=255) tgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACACCCAggcg > 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tataGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttca > 2:564577‑M1/1‑44 (MQ=255) tataGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccctca > 2:5258811‑M1/1‑44 (MQ=255) tataGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtaaagccttcttttaaaacccccttca > 2:1030759‑M1/1‑44 (MQ=255) taGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaag < 1:2007513‑M1/76‑35 (MQ=255) taGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGGTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaag > 1:3746878‑M1/1‑42 (MQ=255) gCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagac < 2:4951960‑M1/76‑37 (MQ=255) cTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacg < 1:3419472‑M1/76‑38 (MQ=255) cTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacg < 1:5211487‑M1/76‑38 (MQ=255) cTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaacaccctcaagacg > 1:2541709‑M1/1‑39 (MQ=255) 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aggcggttaatgccttctataaaacccccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggca < 2:284100‑M1/76‑76 (MQ=255) | TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > NC_000913/3156181‑3156331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |