| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 279335 | NA (NA) | 135 (0.850) | 78/150 | 0.6 | 30.0% | coding (252/339 nt) | b4505 | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 370982 = | 315 (1.980) | coding (535/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase | |||||
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
GAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGA > NC_000913/279262‑279410 | gaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagcag > 2:4397440/1‑76 (MQ=34) gaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCAGTGACAGATTGAATCTAcagcag > 2:2210287/1‑76 (MQ=21) aaaGACACTGAAGGTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGCCAGATTGAATCGACagcagc > 2:3829337/1‑76 (MQ=11) aaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCt < 2:4941940/76‑1 (MQ=38) aaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCt < 1:767886/76‑1 (MQ=38) aaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCt < 1:2094609/76‑1 (MQ=38) aGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtt > 2:2408741/1‑76 (MQ=38) aGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtt < 2:3144488/76‑1 (MQ=39) 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gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc < 2:4794877/76‑1 (MQ=255) gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc > 1:5570789/1‑76 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg > 1:1157012/1‑76 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg > 2:2467323/1‑76 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg < 2:3195837/76‑1 (MQ=255) agagATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGt > 2:2348991/1‑76 (MQ=255) agagATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGt < 2:1054858/76‑1 (MQ=255) gagaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTa < 1:3744235/76‑1 (MQ=255) agaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTaa > 1:4673606/1‑76 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc > 1:4064951/1‑76 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc < 2:5347283/76‑1 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc < 2:3388154/76‑1 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc < 2:4488742/76‑1 (MQ=255) tAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAccc > 2:1298728/1‑76 (MQ=255) tAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAccc < 2:3818284/76‑1 (MQ=255) aaTTGAGGGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCg < 2:80720/76‑1 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGGAGTGACAGATTGAAGCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGGCCCGTTCGTCGGTAACCCGttt < 2:5848529/76‑1 (MQ=37) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGttt < 2:3948535/76‑1 (MQ=255) gAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTc 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> 1:1465051/1‑76 (MQ=255) tGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtc < 1:2978060/76‑1 (MQ=255) tGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtc > 1:1699852/1‑76 (MQ=255) tGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtc < 2:5520472/76‑1 (MQ=255) gAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtct > 1:1609312/1‑76 (MQ=255) gAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtct < 2:3779225/76‑1 (MQ=255) gAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtcc > 2:1810081/1‑75 (MQ=255) aaTCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtctc < 2:4651561/76‑1 (MQ=255) aaTCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGAtctc < 2:3239290/76‑1 (MQ=255) aTCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCg < 2:3530722/76‑1 (MQ=255) 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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |