New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1977295 = | 0 (0.000) | 79 (0.580) | 57/150 | 1.1 | 100% | intergenic (‑56/‑482) | insA5/yecG | IS1 protein InsA/putative regulator |
? | NC_000913 | = 2100969 | NA (NA) | coding (443/474 nt) coding (443/444 nt) |
b4529 yefJ |
hypothetical protein putative glycosyl transferase |
CTTGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1977368‑1977295 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCAT < NC_000913/2100969‑2100896 CTTGCTCGCGTAGCGCAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTGATGTT > 1:1362486/1‑76 CTTGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTT > 1:1357770/1‑76 TTGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTA < 2:879125/76‑1 TTGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTA > 2:593718/1‑76 TTGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTA > 2:2073659/1‑76 TGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAA > 1:1389285/1‑76 GCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAG > 2:1302609/1‑76 TAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGA < 2:2562411/76‑1 GTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGg > 2:379703/1‑75 AGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCACAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGC > 2:1080777/1‑76 AGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGC > 2:2458385/1‑76 AGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGC > 1:4792167/1‑76 gctAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAGGGAAGGTGCG < 2:406973/73‑1 CGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGA > 2:3358699/1‑76 GAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAA > 1:980605/1‑76 AAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAAC > 2:4220555/1‑76 AAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAAC > 1:2518786/1‑76 AAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAAC > 2:2008805/1‑76 AAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACA > 2:4853599/1‑76 AAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACA < 1:2255148/76‑1 AAAACTTTGTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACA < 1:2271584/76‑1 AAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAA > 1:1175597/1‑76 AAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAA < 1:3081984/76‑1 ACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGT > 2:1365214/1‑76 TTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG < 2:2247061/76‑1 TTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG < 1:40125/76‑1 TTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTG > 2:1498045/1‑76 ACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATA < 2:1752020/76‑1 CAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATAT > 1:1781110/1‑76 ATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAG < 1:4613259/76‑1 TTGAAATACACCCCAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGA > 2:1865162/1‑76 GAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATC < 1:1220561/76‑1 AATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAT < 2:2101949/76‑1 AATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAT > 1:2092347/1‑76 ATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGCGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATG < 2:1367667/76‑1 TACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGT < 1:1185066/76‑1 CACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATCTGAGATCATGTTT > 1:136389/1‑76 CACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTT > 1:143903/1‑76 ACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTG > 2:2871455/1‑76 aCCAAAAAAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT < 2:2803897/75‑1 CCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT < 2:1029029/76‑1 CAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCA < 2:1073524/76‑1 AAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATC > 2:3125603/1‑76 AAACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATC > 2:1919214/1‑76 AACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCT < 1:4483508/76‑1 ACAAAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTG > 1:1943976/1‑76 AAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > 1:2138456/1‑76 AAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > 1:2173420/1‑76 AAAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAG > 1:1380824/1‑76 AAGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGC < 1:2861344/76‑1 AGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCC < 2:2082401/76‑1 AGTATGACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCC > 2:2539306/1‑76 GACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGA > 1:2091864/1‑76 GACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGA < 1:4213582/76‑1 ACTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAA > 1:498827/1‑76 CTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC > 1:4858974/1‑76 CTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC > 1:915941/1‑76 CTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC > 1:181563/1‑76 CTTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC < 2:2138455/76‑1 CTTATACATGTAGGGTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCGGATATGAGATCATGGTTGTCATCTGGAGCCATAGAAC < 2:2173419/76‑1 TTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA > 2:1658738/1‑76 TTATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACA > 1:1398126/1‑76 TATACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAG > 1:225853/1‑76 TACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGG < 1:1252432/76‑1 ACATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGGCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGc > 2:1544098/1‑75 ACATTTATGTTAAGGAAGGGGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGT > 2:4220187/1‑76 CATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTT < 2:2518786/76‑1 CATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTT < 1:3997898/76‑1 ATTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTC < 2:2732811/76‑1 TTTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCA > 1:3714695/1‑76 TTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCAT > 1:362570/1‑76 TTATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCAT < 2:4503702/76‑1 TATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATC > 2:1139708/1‑76 TATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAGCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATC < 1:2424249/76‑1 ATGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCA > 1:2572375/1‑76 TGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCTGAGAATAGGGTTGATCAT > 1:406967/1‑76 TGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCAT < 2:3891173/76‑1 TGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCAT > 2:3135024/1‑76 TGTTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCAT < 1:1804227/76‑1 CTTGCTAGCGTAGCGAAAAACTTTTTAACAGATTGAAATACACCCAAAACAAAAGTATGACTTATACATTTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1977368‑1977295 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCAT < NC_000913/2100969‑2100896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |