| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 279335 | NA (NA) | 108 (0.790) | 70/150 | 0.5 | 23.7% | coding (252/339 nt) | b4505 | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 370982 = | 347 (2.540) | coding (535/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase | |||||
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
GAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGA > NC_000913/279262‑279410 | agaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagca > 2:1034039/1‑76 (MQ=32) agaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagca > 1:1235819/1‑76 (MQ=32) aaaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACagcagc < 1:2615331/76‑1 (MQ=35) aGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtt < 1:3850436/76‑1 (MQ=39) gACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCCGCttt > 2:191066/1‑76 (MQ=21) gACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCttt > 1:2962161/1‑76 (MQ=40) acacTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttt > 2:2906052/1‑76 (MQ=255) cacTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCttttt > 2:542209/1‑76 (MQ=39) 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< 1:4399704/76‑1 (MQ=255) aaGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAAGCTACAGCAGCTTTTTTTAat < 2:95891/76‑1 (MQ=255) gTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAatat > 2:2822688/1‑76 (MQ=255) gtCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAatata < 2:724859/75‑2 (MQ=255) tCAAAACACCGGAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGt > 2:4004101/1‑76 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGt < 1:2827238/76‑1 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGt > 2:1829314/1‑76 (MQ=255) aaaaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTcc > 1:589933/1‑76 (MQ=255) aaaaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTcc > 2:1418514/1‑76 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGtt < 1:2574283/76‑1 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGtt > 2:1689451/1‑76 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGtt > 1:3676854/1‑76 (MQ=255) acCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtc < 2:3168059/76‑1 (MQ=255) acCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtc > 2:4551873/1‑76 (MQ=255) acCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtc < 2:255387/76‑1 (MQ=255) acCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGGGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGCCCCGTtc > 2:4601202/1‑76 (MQ=255) ccGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGCtcg > 2:566246/1‑76 (MQ=255) cGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgt > 2:3821787/1‑76 (MQ=255) gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGAGAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc < 2:4382158/76‑1 (MQ=255) gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc < 2:450793/76‑1 (MQ=255) gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtc < 2:4460449/76‑1 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg > 2:841765/1‑76 (MQ=255) aaGAGATAATTGAAAGGGGCGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCgg > 2:2683526/1‑76 (MQ=255) aaGAGATAAGTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCgg < 2:297221/76‑1 (MQ=255) agagATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGt > 1:1044382/1‑76 (MQ=255) agagATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGt < 1:446792/76‑1 (MQ=255) gagaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTa > 1:3885644/1‑76 (MQ=255) gagaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTa < 1:3618260/76‑1 (MQ=255) aTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAcc > 2:3307644/1‑76 (MQ=255) aaTTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCg < 1:4669429/76‑1 (MQ=255) ttGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGtt > 1:2885781/1‑76 (MQ=255) tGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGttt < 2:1602167/76‑1 (MQ=255) gAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTc < 2:910588/76‑1 (MQ=255) gAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTc < 1:4528506/76‑1 (MQ=255) aaaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCa > 2:135738/1‑76 (MQ=255) aaaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCa < 1:1637068/76‑1 (MQ=255) aaaGGGGTGGTGCATTGACAGAGTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGGAACCCGGTTCa > 1:716586/1‑76 (MQ=255) aaGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCAGTTCGTCGGTAACCCGTATCAg > 1:1818432/1‑76 (MQ=255) 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2:520925/75‑1 (MQ=255) cATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGga > 1:4077719/1‑76 (MQ=255) cATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGga > 1:332884/1‑76 (MQ=255) aTTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGgag > 2:3601262/1‑76 (MQ=255) ttGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTGTTAATATGTCCCGTGCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGgaga < 2:1505736/76‑1 (MQ=255) tGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAc < 1:3447027/76‑1 (MQ=255) tGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAc > 1:3127258/1‑76 (MQ=255) gACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcg > 1:3200048/1‑76 (MQ=255) gACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGAcg > 1:4686396/1‑76 (MQ=255) aCAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGGGAcgg > 2:2774457/1‑76 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |