| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 924547 | 112 (1.380) | 10 (0.130) | 5/94 | NT | 8.3% | coding (862/2277 nt) | clpA | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity |
| ? | W3110S.gb | = 924563 | 114 (1.460) | coding (878/2277 nt) | clpA | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
ACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCT > W3110S.gb/924480‑924617 | aCGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCcaca > 1:7519657/1‑71 (MQ=255) ttAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCAt > 1:544466/1‑70 (MQ=255) ttAAAGCGTGGCTCAAGCAGATGGATAAGGAAACTAACAGCATCCTTTTTATTGATGAGATCCACACCAt < 1:6922061/70‑1 (MQ=255) tAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCAt < 1:6913094/69‑1 (MQ=255) aaGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCcaca > 1:5153063/1‑63 (MQ=255) aaGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCa < 1:3278102/66‑1 (MQ=255) gCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCgg > 1:7035974/1‑71 (MQ=255) cGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGt < 1:3518127/71‑1 (MQ=255) cGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGt > 1:4043588/1‑71 (MQ=255) ttGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:6195489/71‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:6757252/71‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGAACCACACCATTATCGGTGc < 1:3385109/71‑1 (MQ=255) cAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:7805512/1‑71 (MQ=255) cAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:2573803/1‑71 (MQ=255) aatcagcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGc < 1:6321640/68‑1 (MQ=255) aaGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:445945/1‑70 (MQ=255) agcagcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:6372119/1‑69 (MQ=255) gcagcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCgcaccgataatggtgtgg < 1:5378250‑M1/65‑19 (MQ=255) cagcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGc < 1:4391222/71‑1 (MQ=255) agcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCca > 1:7723671/1‑46 (MQ=255) agcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCgcaccgataatggtgtggat > 1:5822869‑M1/1‑45 (MQ=255) agcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCgcaccgataatggtgtggat > 1:858815‑M1/1‑45 (MQ=255) agcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCGTTATCGGTGCGGGTGCAGc < 1:5216558/70‑1 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGt > 1:6842912/1‑68 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtg > 1:1385834/1‑71 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtg > 1:3818949/1‑71 (MQ=255) gAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgg < 1:2597667/71‑1 (MQ=255) gAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt < 1:4516674/69‑1 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCgcaccgataatggtgtg < 1:5278106‑M1/54‑18 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCgcaccgataatggtgtg < 1:6305344‑M1/54‑18 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCgcaccgataatggtgtg < 1:2778869‑M1/54‑18 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa > 1:1965820/1‑60 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggtgg > 1:889332/1‑71 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCAACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgg < 1:6251550/68‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa < 1:5662382/57‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa < 1:5567322/57‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa < 1:1815299/57‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt < 1:1567309/63‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt < 1:2967761/63‑1 (MQ=255) acacTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGc < 1:5280601/55‑1 (MQ=255) acacTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg < 1:6607947/71‑1 (MQ=255) acacTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg < 1:5115070/71‑1 (MQ=255) cacTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAgg > 1:6631418/1‑71 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATc < 1:6186995/41‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATc < 1:2723604/41‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:1103926/46‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:7747062/46‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt > 1:4945382/1‑59 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTc > 1:856206/1‑71 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTc < 1:4737033/71‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACAATTAt > 1:1637978/1‑40 (MQ=255) tAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCg > 1:3068582‑M2/1‑45 (MQ=255) tAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggtg > 1:7274984/1‑62 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCgg < 1:6498586‑M2/46‑3 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCgg < 1:7185758‑M2/46‑3 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCg > 1:2162216‑M2/1‑44 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGa > 1:6802512/1‑71 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:1717917/1‑71 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:5836362/1‑71 (MQ=255) cAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:1706918/1‑70 (MQ=255) gCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCg > 1:5566771/1‑71 (MQ=255) aTCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGc > 1:208855/1‑71 (MQ=255) tCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg < 1:7259122/59‑1 (MQ=255) tCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGc > 1:2805649/1‑70 (MQ=255) ccTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGa < 1:2459397/63‑1 (MQ=255) cTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGt > 1:2775508/1‑59 (MQ=255) cTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTa < 1:311850/70‑1 (MQ=255) tGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAAc > 1:6958918/1‑71 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGc < 1:3869060/39‑1 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAAcc > 1:1684583/1‑71 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAAcc > 1:4345273/1‑71 (MQ=255) tttATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGCTCAGGTCGATGCGGCTAACCt < 1:5899404/71‑1 (MQ=255) tATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggtg > 1:1135457/1‑47 (MQ=255) tATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgggg > 1:7522777/1‑45 (MQ=255) aTTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTaa < 1:3239706/70‑1 (MQ=255) ttGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAAt < 1:7918323/70‑1 (MQ=255) tgatgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggtg > 1:3150276/1‑44 (MQ=255) tgatgaGATCAACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggt > 1:2378298/1‑43 (MQ=255) atgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCa > 1:5245765/1‑46 (MQ=255) atgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCa > 1:4095531/1‑46 (MQ=255) gagaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCAGCTAACCTAATCAAAcc > 1:4167673/1‑71 (MQ=255) gagaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGAGGCTAACCTAATCaaa > 1:441957/1‑69 (MQ=255) agaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAAcc < 1:2428872/70‑1 (MQ=255) gaTCCACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagctgcttg > 1:1708400‑M2/1‑21 (MQ=255) gaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt < 1:4329615/71‑1 (MQ=255) aTCCACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagct > 1:5267621‑M2/1‑20 (MQ=255) aTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGtt > 1:6897900/1‑71 (MQ=255) aTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt < 1:6259825/70‑1 (MQ=255) tCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGtt > 1:4884293/1‑70 (MQ=255) tCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTg > 1:6134121/1‑71 (MQ=255) ccgcaccgataatggtgtggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagctgcttga > 1:3366990‑M1/1‑2 (MQ=255) ccgcaccgataatggtgtggatctcatcaataaacaggatgctgtt < 1:2976427‑M1/46‑45 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagctgc < 1:5378250‑M2/65‑48 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctc < 1:3461645‑M2/58‑41 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt > 1:5975837/1‑68 (MQ=255) cgcaccgataattgtgtggatctcatcaataaacaggatgctgtt < 1:2989156‑M1/45‑45 (MQ=255) cgcaccgataatggtgtggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagctgcttgagca < 1:3489908‑M1/71‑71 (MQ=255) cgcaccgataatggtgtggatctcatcaataaacaggatgctgtta > 1:3068582‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcaccgataatggtgtggatctcatcaataaacaggatgctgtta > 1:1606935‑M1/1‑1 (MQ=255) cgcaccgataatggtgtggatctcatcaataaacaggatgctgtt > 1:2162216‑M1/1‑1 (MQ=255) | ACGTTTTAAAGCGTTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCT > W3110S.gb/924480‑924617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |