| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 924547 | 112 (1.380) | 10 (0.130) | 5/94 | NT | 8.3% | coding (862/2277 nt) | clpA | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity |
| ? | W3110S.gb | = 924563 | 114 (1.460) | coding (878/2277 nt) | clpA | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
TTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAAT > W3110S.gb/924493‑924632 | ttGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:4849127/71‑1 (MQ=255)ttGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:6195489/71‑1 (MQ=255) tGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc > 1:4146917/1‑70 (MQ=255) tCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCgg > 1:3366990‑M2/1‑67 (MQ=255) cAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:2573803/1‑71 (MQ=255) cAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:7805512/1‑71 (MQ=255) aatcagcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGc < 1:6321640/68‑1 (MQ=255) aaGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:445945/1‑70 (MQ=255) agcagcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:6372119/1‑69 (MQ=255) agcTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCGTTATCGGTGCGGGTGCAGc < 1:5216558/70‑1 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTg > 1:7587003/1‑62 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGt > 1:6842912/1‑68 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtg > 1:6790422/1‑71 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtg > 1:3818949/1‑71 (MQ=255) ggAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtg > 1:1385834/1‑71 (MQ=255) gAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgg < 1:3251829/71‑1 (MQ=255) gAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgg < 1:2597667/71‑1 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa > 1:1965820/1‑60 (MQ=255) cAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCAACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgg < 1:6251550/68‑1 (MQ=255) aGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTggtggt > 1:1757588/1‑71 (MQ=255) ggACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGc < 1:6278905/60‑1 (MQ=255) ggACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTggtggt > 1:5553023/1‑70 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa < 1:5567322/57‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCa < 1:1815299/57‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt < 1:1567309/63‑1 (MQ=255) gACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt < 1:2967761/63‑1 (MQ=255) acacTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg < 1:6607947/71‑1 (MQ=255) acacTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg < 1:5115070/71‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGc < 1:1702440/46‑1 (MQ=255) cTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCt > 1:4945382/1‑59 (MQ=255) tAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCg > 1:3068582‑M2/1‑45 (MQ=255) tAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCg > 1:1606935‑M2/1‑45 (MQ=255) tAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGGAGCGTCTGGTGGTCAGGTc > 1:7508538/1‑70 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCgg < 1:6498586‑M2/46‑3 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCgg < 1:2976427‑M2/46‑3 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCgg < 1:7185758‑M2/46‑3 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCg > 1:2162216‑M2/1‑44 (MQ=255) aaCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGa > 1:4463753/1‑71 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtgg > 1:1149122/1‑58 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCTAt > 1:1580972/1‑71 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:5588408/1‑71 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:1717917/1‑71 (MQ=255) aCAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:513486/1‑71 (MQ=255) cAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGAt > 1:1706918/1‑70 (MQ=255) aTCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGc > 1:208855/1‑71 (MQ=255) tCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg < 1:7259122/59‑1 (MQ=255) tCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGc > 1:2805649/1‑70 (MQ=255) ccTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGa < 1:2459397/63‑1 (MQ=255) cTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGt > 1:2775508/1‑59 (MQ=255) cTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGt > 1:2673391/1‑59 (MQ=255) cTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTa < 1:311850/70‑1 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGc < 1:3869060/39‑1 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGc < 1:5866939/39‑1 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAAcc > 1:4354391/1‑71 (MQ=255) gTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAAcc > 1:4345273/1‑71 (MQ=255) ttGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAAt < 1:7918323/70‑1 (MQ=255) tgatgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggtg > 1:3150276/1‑44 (MQ=255) tgatgaGATCAACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCtggt > 1:2378298/1‑43 (MQ=255) gatgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCgg > 1:2402894/1‑58 (MQ=255) atgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCa > 1:4095531/1‑46 (MQ=255) tgaGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAg > 1:2747708/1‑46 (MQ=255) gagaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCAGCTAACCTAATCAAAcc > 1:4167673/1‑71 (MQ=255) gagaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGAGGCTAACCTAATCaaa > 1:441957/1‑69 (MQ=255) agaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAAcc < 1:6916541/70‑1 (MQ=255) gaTCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt < 1:4329615/71‑1 (MQ=255) aTCCACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagct > 1:5267621‑M2/1‑20 (MQ=255) aTCCACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagct > 1:5822869‑M2/1‑20 (MQ=255) aTCCACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagct > 1:858815‑M2/1‑20 (MQ=255) tCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAAc > 1:6927305/1‑66 (MQ=255) tCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGtt > 1:4884293/1‑70 (MQ=255) tCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTg > 1:6124697/1‑71 (MQ=255) tCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTg > 1:6134121/1‑71 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagctgc < 1:5378250‑M2/65‑48 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctc < 1:3461645‑M2/58‑41 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGc > 1:5395663/1‑48 (MQ=255) ccACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt > 1:5975837/1‑68 (MQ=255) cacaCCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctg < 1:5278106‑M2/54‑38 (MQ=255) cacCATTATCGGTGCggatctcatcaataaacaggatgctgttagtgtcctgctccagctgcttgagcaac > 1:6523422‑M2/1‑15 (MQ=255) cacCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTg > 1:1053345/1‑67 (MQ=255) cacCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTg > 1:7253046/1‑67 (MQ=255) ccATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGct > 1:5330829/1‑67 (MQ=255) ccATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGct > 1:3697700/1‑67 (MQ=255) ccATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGct > 1:6218766/1‑67 (MQ=255) ccATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCtctc > 1:923517/1‑70 (MQ=255) ccATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCtctc > 1:839936/1‑70 (MQ=255) ccATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCtctc > 1:1967983/1‑70 (MQ=255) ttATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt > 1:2095547/1‑60 (MQ=255) ttATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt > 1:7713141/1‑60 (MQ=255) ttATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGt > 1:1919523/1‑60 (MQ=255) ttATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCAAGc > 1:3237513/1‑71 (MQ=255) aTCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGc > 1:1012702/1‑41 (MQ=255) aTCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTaa > 1:6796322/1‑44 (MQ=255) cGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGt > 1:1445967/1‑70 (MQ=255) cGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGt > 1:1110017/1‑70 (MQ=255) ggTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTaa < 1:2063295/71‑1 (MQ=255) ggTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTaa < 1:3849644/71‑1 (MQ=255) ggTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTaa < 1:5889766/71‑1 (MQ=255) ggTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTa > 1:6751128/1‑70 (MQ=255) gTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGAGGTaa > 1:4655468/1‑70 (MQ=255) cGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAAt < 1:3655369/70‑1 (MQ=255) | TTGCTCAAGCAGCTGGAGCAGGACACTAACAGCATCCTGTTTATTGATGAGATCCACACCATTATCGGTGCGGGTGCAGCGTCTGGTGGTCAGGTCGATGCGGCTAACCTAATCAAACCGTTGCTCTCCAGCGGTAAAAT > W3110S.gb/924493‑924632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |