| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2989729 = | 121 (1.490) | 11 (0.160) | 4/84 | NT | 9.8% | intergenic (+73/‑195) | ygeF/ygeG | hypothetical protein/predicted chaperone |
| ? | W3110S.gb | 2989750 = | 99 (1.420) | intergenic (+94/‑174) | ygeF/ygeG | hypothetical protein/predicted chaperone | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
AATGGCAATTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACC > W3110S.gb/2989660‑2989796 | aaTGGCAATTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAAc > 1:6573906/1‑71 (MQ=255) tggtatatttttcattattggtaaaagtactgttcactacaaactaataacatcattagttgttttACtaa < 1:17849‑M1/5‑1 (MQ=255) tggtatatttttcattattggtaaaagtactgttcactacaaactaataacatcattagttgttttACtaa < 1:1602567‑M1/5‑1 (MQ=255) gtatatttttcattattggtaaaagtactgttcactacaaactaataacatcattagttgttttACtaata > 1:6151691‑M1/65‑71 (MQ=255) cAATTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACtaata < 1:7857658/71‑1 (MQ=255) aaTTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATaa < 1:4879961/64‑1 (MQ=255) aaTTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATaa < 1:6487848/64‑1 (MQ=255) aTTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAg < 1:1711317/71‑1 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACtaat < 1:3360138/67‑1 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACtaat < 1:1550699/67‑1 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAgg < 1:32174/71‑1 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAgg > 1:1222247/1‑71 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAgg > 1:2475575/1‑71 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAgg > 1:5384505/1‑71 (MQ=255) ttGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAgg > 1:2182151/1‑71 (MQ=255) tGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGt > 1:3239453/1‑71 (MQ=255) tGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGt > 1:6827673/1‑71 (MQ=255) tcattattggtaaaagtactgttcactacaaactaataacatcattagttgtttta < 1:3801934‑M1/1‑1 (MQ=255) cTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAata > 1:7779593/1‑71 (MQ=255) aTGAATCCAGGTCATACATATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAAc > 1:6258000/1‑55 (MQ=255) aTGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAAc > 1:3851668/1‑55 (MQ=255) tGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAatat < 1:1961606/69‑1 (MQ=255) tGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAatat < 1:4069556/69‑1 (MQ=255) tGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAatat < 1:4503167/69‑1 (MQ=255) tGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAACATAACTAATAAGGTGAatat < 1:408570/69‑1 (MQ=255) ggTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGt < 1:5319195/55‑1 (MQ=255) ggTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGt < 1:4561599/55‑1 (MQ=255) ggTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaaca < 1:6987766/71‑1 (MQ=255) gTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTg < 1:2534391/55‑1 (MQ=255) gTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaacaa < 1:7091637/71‑1 (MQ=255) gTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaacaa < 1:3573475/71‑1 (MQ=255) gTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaacaa > 1:5033049/1‑71 (MQ=255) gTCATACACATTAACGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAAc < 1:2696769/45‑1 (MQ=255) tCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGa < 1:4841306/55‑1 (MQ=255) cATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGt > 1:1457570/1‑62 (MQ=255) aTACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTCAGATaa < 1:1020133/41‑1 (MQ=255) acacATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTaa > 1:1315816/1‑70 (MQ=255) acacATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:4991646/1‑71 (MQ=255) ctgttcactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatg > 1:1018975‑M1/38‑71 (MQ=255) cacaTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAata > 1:731618/1‑53 (MQ=255) cacaTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:2280997/1‑70 (MQ=255) cacaTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:7170315/1‑70 (MQ=255) acaTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAat > 1:1113111/1‑51 (MQ=255) gttcactacaaactaataacatcattagttgttttACt > 1:4638913‑M1/36‑38 (MQ=255) caTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatgat < 1:3432255/71‑1 (MQ=255) ttcactacaaactaataacatcattagttgttttACtaata < 1:2035588‑M1/7‑1 (MQ=255) ttcactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAg > 1:7482013‑M1/35‑54 (MQ=255) ttcactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAg > 1:3309812‑M1/35‑54 (MQ=255) tAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGt > 1:761461/1‑70 (MQ=255) tAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGt > 1:6434032/1‑70 (MQ=255) cactacaaactaataacatcattagttgttttACtaa > 1:5352473‑M1/33‑37 (MQ=255) cactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTa < 1:4358309‑M1/22‑1 (MQ=255) cactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTa < 1:463129‑M1/22‑1 (MQ=255) ctacaaactaataacatcattagttgttttACtaata < 1:4269804‑M1/7‑1 (MQ=255) ctacaaactaataacatcattagttgttttACtaata < 1:7243923‑M1/7‑1 (MQ=255) aGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTaaa > 1:1433445/1‑54 (MQ=255) aGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatgat < 1:4407054/66‑1 (MQ=255) aGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttat < 1:3836263/71‑1 (MQ=255) tacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGt > 1:5734591‑M1/30‑50 (MQ=255) tacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGt > 1:7669012‑M1/30‑50 (MQ=255) gCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttat > 1:7047806/1‑69 (MQ=255) gCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttat > 1:7208314/1‑69 (MQ=255) cATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatgat < 1:7407546/63‑1 (MQ=255) aTTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGt < 1:4774585/71‑1 (MQ=255) aTTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGt < 1:1250116/71‑1 (MQ=255) tttATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAatat < 1:7225636/42‑1 (MQ=255) ttATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGttt > 1:6235854/1‑71 (MQ=255) ttATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGtt > 1:3541759/1‑70 (MQ=255) tATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:3735172/1‑71 (MQ=255) tATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:3669153/1‑71 (MQ=255) tATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:2763218/1‑71 (MQ=255) gTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAg > 1:7881122/1‑71 (MQ=255) aaTGTCGTAATTAAGATAACTAATAATGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg < 1:7692966/66‑1 (MQ=255) aaTGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGttt > 1:2079459/1‑65 (MQ=255) aTGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTg < 1:863247/70‑1 (MQ=255) aTGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTg > 1:7176347/1‑70 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg < 1:4217557/64‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg < 1:1915128/64‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:3970214/1‑66 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:5535388/1‑66 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGaa > 1:2665582/1‑71 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGaa < 1:6595953/71‑1 (MQ=255) tCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACa < 1:7646517/71‑1 (MQ=255) tCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACa < 1:2859550/71‑1 (MQ=255) gTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGt < 1:5609492/71‑1 (MQ=255) tAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat < 1:601067/44‑1 (MQ=255) tAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat < 1:209685/44‑1 (MQ=255) aTTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttatt > 1:370522/1‑51 (MQ=255) aTTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttatt > 1:1348459/1‑51 (MQ=255) aTTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTAc < 1:1722237/70‑1 (MQ=255) ttAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACtt > 1:1971994/1‑71 (MQ=255) ttAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACtt > 1:1177171/1‑71 (MQ=255) aaGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGt > 1:1983597/1‑44 (MQ=255) aaGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACttt > 1:5335631/1‑70 (MQ=255) aGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACtttt < 1:6741186/70‑1 (MQ=255) gATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTAc > 1:6554504/1‑71 (MQ=255) aTAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTAc < 1:1383423/70‑1 (MQ=255) aTAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTAc < 1:4441656/70‑1 (MQ=255) tAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatga > 1:5872087/1‑37 (MQ=255) tAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTAcc > 1:4798329/1‑70 (MQ=255) | AATGGCAATTGATACTATGAATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACC > W3110S.gb/2989660‑2989796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |