| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 2989729 = | 121 (1.490) | 11 (0.160) | 4/84 | NT | 9.8% | intergenic (+73/‑195) | ygeF/ygeG | hypothetical protein/predicted chaperone |
| ? | W3110S.gb | 2989750 = | 99 (1.420) | intergenic (+94/‑174) | ygeF/ygeG | hypothetical protein/predicted chaperone | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
ATCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAATATACCATAA > W3110S.gb/2989680‑2989818 | aTCCAGGTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTa < 1:1119917/71‑1 (MQ=255) ggTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaaca < 1:6987766/71‑1 (MQ=255) gTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaacaa < 1:3573475/71‑1 (MQ=255) gTCATACACATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAaacaa < 1:7091637/71‑1 (MQ=255) acacATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:333569/1‑71 (MQ=255) acacATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:4991646/1‑71 (MQ=255) acacATTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:4164285/1‑71 (MQ=255) ctgttcactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatg > 1:1018975‑M1/38‑71 (MQ=255) cacaTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAat > 1:7170315/1‑70 (MQ=255) caTTAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatgat < 1:4065336/71‑1 (MQ=255) ttAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGt > 1:6294505/1‑71 (MQ=255) tAAGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGt > 1:761461/1‑70 (MQ=255) cactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTa < 1:3693858‑M1/22‑1 (MQ=255) cactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTa < 1:6936308‑M1/22‑1 (MQ=255) cactacaaactaataacatcattagttgttttACTAATAAGGTGAATATTAGTa < 1:7230425‑M1/22‑1 (MQ=255) aGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatgat < 1:4407054/66‑1 (MQ=255) aGGCATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttat < 1:3836263/71‑1 (MQ=255) cATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAatgat < 1:7407546/63‑1 (MQ=255) cATTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAg > 1:3411901/1‑71 (MQ=255) aTTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGt < 1:4774585/71‑1 (MQ=255) aTTTATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGt < 1:1250116/71‑1 (MQ=255) tATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:2763218/1‑71 (MQ=255) tATGTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:3669153/1‑71 (MQ=255) tGTAATGTCGTAATTGAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGt < 1:1432133/70‑1 (MQ=255) gTAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAg > 1:7881122/1‑71 (MQ=255) tAATGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAg > 1:7667894/1‑70 (MQ=255) aaTGTCGTAATTAAGATAACTAATAATGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg < 1:7692966/66‑1 (MQ=255) aaTGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGt > 1:2514495/1‑70 (MQ=255) aTGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTg < 1:3822986/70‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg < 1:4217557/64‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg < 1:1915128/64‑1 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:6448214/1‑66 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:4457836/1‑66 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:5535388/1‑66 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGaa > 1:5032552/1‑71 (MQ=255) tGTCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGaa < 1:6595953/71‑1 (MQ=255) tCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACa < 1:7646517/71‑1 (MQ=255) tCGTAATTAAGATAACTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACa < 1:2859550/71‑1 (MQ=255) cattagttgttttactaatattcaccttattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAg > 1:1018975‑M2/35‑71 (MQ=255) 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(MQ=255) aaCTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttat < 1:805163/42‑1 (MQ=255) actaatattcaccttattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:5734591‑M2/22‑50 (MQ=255) actaatattcaccttattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:7669012‑M2/22‑50 (MQ=255) ctaatattcaccttattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGaa > 1:7374125‑M2/21‑54 (MQ=255) ctaatattcaccttattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGaa > 1:7482013‑M2/21‑54 (MQ=255) CTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGttatta < 1:1341320‑M1/42‑1 (MQ=255) CTAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCaata > 1:233585‑M1/1‑71 (MQ=255) TAATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCaataa < 1:2644328‑M1/71‑1 (MQ=255) ATAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATg > 1:4714750‑M1/1‑71 (MQ=255) TAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:1996831‑M1/1‑43 (MQ=255) TAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTg > 1:4446878‑M1/1‑43 (MQ=255) TAAGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGa > 1:4339463‑M1/1‑71 (MQ=255) aGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:5181923/1‑43 (MQ=255) aGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:1546385/1‑43 (MQ=255) aGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:3480273/1‑43 (MQ=255) aGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTa > 1:4421397/1‑43 (MQ=255) aGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGaaa < 1:4569976/71‑1 (MQ=255) aGGTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTATGTa > 1:6677858/1‑43 (MQ=255) ggTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGaaaa < 1:7873204/71‑1 (MQ=255) ggTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGaaaa < 1:6771525/71‑1 (MQ=255) ggTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGaaaa < 1:1499631/71‑1 (MQ=255) gTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCaataa > 1:2363707/1‑64 (MQ=255) gTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCaataa > 1:650110/1‑64 (MQ=255) gTGAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGaaaaa < 1:1582225/71‑1 (MQ=255) gAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAata > 1:705230/1‑71 (MQ=255) gAATATTAGTAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAata > 1:2294031/1‑71 (MQ=255) tattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAATATAc > 1:3292339‑M2/8‑71 (MQ=255) tattagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAATATAc > 1:6151691‑M2/8‑71 (MQ=255) ttagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTg > 1:5352473‑M2/6‑37 (MQ=255) ttagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAATATACCa < 1:17849‑M2/66‑1 (MQ=255) tagtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAATATACCa > 1:7203882‑M2/5‑70 (MQ=255) agtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAAc > 1:3911338‑M2/4‑38 (MQ=255) agtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAAc > 1:4638913‑M2/4‑38 (MQ=255) agtAAAACAACTAATGATGTTATTAGTTTGTAGTGAACAGTACTTTTACCAATAATGAAAAATATACCAt > 1:1970110‑M2/4‑70 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |