| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 1082426 | 32 (0.540) | 2 (0.040) | 3/88 | NT | 6.7% | intergenic (‑258/+197) | ydhY/ydhZ | predicted 4Fe‑4S ferridoxin‑type protein/hypothetical protein |
| ? | minE | = 1082435 | 28 (0.550) | intergenic (‑267/+188) | ydhY/ydhZ | predicted 4Fe‑4S ferridoxin‑type protein/hypothetical protein | |||||
AACATTGATCGTTATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGAAAATAAAAATAACA > minE/1082365‑1082495 | aaCATTGATCGTTATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTg > 1:1291510/1‑70 (MQ=255) cATTGATCGTTATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAaa < 1:1715300‑M2/71‑3 (MQ=255) aTCGTTATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAaataaat < 1:3682136‑M2/71‑8 (MQ=255) ttATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATc < 1:1127650/54‑1 (MQ=255) aTCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCAtt < 1:1974648/55‑1 (MQ=255) aTCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCAtt < 1:1246854/55‑1 (MQ=255) aTCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCAtt < 1:1251292/55‑1 (MQ=255) aTTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTtcaaatgataataa < 1:731332‑M1/59‑15 (MQ=255) ttAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATT‑TCAAATGAtaataaatatca < 1:1018434‑M2/64‑13 (MQ=255) tAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGc > 1:1183565/1‑70 (MQ=255) aaaaTTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGa > 1:2223880/1‑71 (MQ=255) aaaTTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCAt > 1:3532897/1‑46 (MQ=255) aaaTTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCAt > 1:2398128/1‑46 (MQ=255) tACAAATCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAATCGACaa < 1:1985883/69‑1 (MQ=255) tACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTtcaaatgataataaa > 1:2084327‑M1/1‑37 (MQ=255) cAAAGCTAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTg > 1:1862063/1‑43 (MQ=255) cAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAatta < 1:2155690/70‑1 (MQ=255) aaGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTAttt < 1:1991464/71‑1 (MQ=255) cAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTtgtg < 1:1998107/71‑1 (MQ=255) aGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGAc > 1:1323907/1‑71 (MQ=255) aaaTTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTTAaataaat > 1:1651247‑M2/1‑35 (MQ=255) aaaTTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAAc > 1:3422562/1‑47 (MQ=255) aaTTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAatta > 1:1642829/1‑60 (MQ=255) ataAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCAt < 1:1523356/70‑1 (MQ=255) taAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCAt < 1:398985/69‑1 (MQ=255) gTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTAttt < 1:847467/55‑1 (MQ=255) gTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTAttt < 1:3702940/55‑1 (MQ=255) tGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTAttttt > 1:1487588/1‑54 (MQ=255) tGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTAttttt > 1:265789/1‑54 (MQ=255) gAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAatt > 1:722590/1‑49 (MQ=255) gAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAatt > 1:668163/1‑49 (MQ=255) gAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAatt > 1:2132810/1‑49 (MQ=255) gAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAatt > 1:3348121/1‑49 (MQ=255) tGATATTTATTatcatttgaaataaatatcagttcacttataatttcttgctttgtaattttaa < 1:1018434‑M1/64‑54 (MQ=255) atatTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataa > 1:3301818/1‑70 (MQ=255) atatTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataa < 1:1573894/70‑1 (MQ=255) atatTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataa < 1:1678305/70‑1 (MQ=255) atatTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaata < 1:3305505/69‑1 (MQ=255) atttatttcaaatgataataaatatcagttcacttataatttcttgctttgtaattttaattgataacgat < 1:3682136‑M1/71‑65 (MQ=255) atttatttaaaatgataataaatatcagttcacttataattt > 1:1651247‑M1/1‑7 (MQ=255) atttattATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataaaaa > 1:1619064/1‑71 (MQ=255) atttattATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataaaaa > 1:1710219/1‑71 (MQ=255) tttattATCATTTGAaataaatatcagttcacttataatttcttgctttgta > 1:2084327‑M2/1‑15 (MQ=255) tttattATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataaaaat < 1:2837043/71‑1 (MQ=255) tttattATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGaaaataaaaat < 1:2109559/71‑1 (MQ=255) ttattaTCATTTGAaataaatatcagttcacttataatttcttgctttgtaattttaat < 1:731332‑M2/59‑46 (MQ=255) tttcaaatgataataaatatcagttcacttataatttcttgctttgtaattttaattgataacgatcaatg < 1:1715300‑M1/71‑70 (MQ=255) | AACATTGATCGTTATCAATTAAAATTACAAAGCAAGAAATTATAAGTGAACTGATATTTATTATCATTTGAAATAAATTTAACTTAAGCGACAATTATTTGTGACTTTCATTGCAGAAAATAAAAATAACA > minE/1082365‑1082495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |