| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 74 (0.970) | 335 (4.780) | 88/92 | NT | 84.4% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 56 (0.800) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 541 total aligned reads displayed.
GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > minE/436189‑436329 | gcacacgtaaataggaggtcgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaatataa > 1:3644813‑M1/71‑71 (MQ=255)gcacacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:2958298‑M1/71‑71 (MQ=255) cacacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataat > 1:199940‑M1/70‑71 (MQ=255) acgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataAtt < 1:4053879‑M1/3‑1 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAg > 1:4561692/1‑71 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:1688854‑M1/6‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtgaacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgattcacccgcgaaaaaataa < 1:2468081‑M1/1‑1 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:2353267‑M1/6‑1 (MQ=255) tCTGCAAGCCAGGCTT‑ACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt < 1:3114280/70‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:3942249‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcaccagcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:2853709‑M1/62‑71 (MQ=255) gCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCt > 1:3018996/1‑68 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:4157817‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:4213650‑M1/61‑70 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTa < 1:1419574/68‑1 (MQ=255) aaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgtaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:2663313‑M1/60‑71 (MQ=255) aaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc > 1:377905‑M1/60‑66 (MQ=255) acgaactgctggctttgtacaaaccatgagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCACCTAAGaca > 1:2584900‑M1/53‑66 (MQ=255) acgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:4083294‑M1/53‑53 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcac > 1:483246‑M1/52‑71 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:209142‑M1/22‑1 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:2312301‑M1/47‑47 (MQ=255) gctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:3182926‑M1/25‑1 (MQ=255) gCTATCCGCTGCCTGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:1735532/45‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:1119018‑M1/45‑70 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:1958600‑M1/26‑1 (MQ=255) ctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTa > 1:2642656‑M1/45‑71 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:646730‑M1/26‑1 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:1039125‑M1/26‑1 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc > 1:108275‑M1/40‑43 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc > 1:2705293‑M1/40‑57 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcaccagcgaaaaaataa > 1:727844‑M1/40‑40 (MQ=255) tgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa < 1:3239207‑M1/12‑1 (MQ=255) gtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa > 1:1878325‑M1/37‑46 (MQ=255) gtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:1003671‑M1/34‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataat < 1:446313‑M1/2‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca < 1:838567‑M1/14‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca < 1:587767‑M1/14‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:1257326‑M1/37‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:3063465‑M1/37‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:2200565‑M1/37‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACg > 1:3380527‑M1/34‑71 (MQ=255) gggATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAt < 1:514432/71‑1 (MQ=255) accaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:3350259‑M1/41‑1 (MQ=255) aggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:254717‑M1/28‑69 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcac > 1:750835/1‑45 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:3620898/70‑1 (MQ=255) ttCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt < 1:1333254/70‑1 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGacac > 1:1928105‑M1/23‑37 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:1841751‑M1/23‑48 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAg > 1:2253965‑M1/23‑51 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:1177834‑M1/23‑64 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:1439651‑M1/23‑65 (MQ=255) tCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcac > 1:4251348/1‑42 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGacac > 1:2604490/1‑36 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:4032356‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:1140923‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:3552191‑M1/21‑70 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:975785‑M1/21‑70 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:3302346‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:2386439‑M1/50‑1 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:1790281‑M1/21‑70 (MQ=255) gttccacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGa < 1:1298294‑M1/30‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg < 1:2782662‑M1/51‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGAACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:3520298‑M1/53‑1 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACGCTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:4625168‑M1/54‑1 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:4402563‑M1/17‑70 (MQ=255) tCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:2507741/68‑1 (MQ=255) ccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:4135913‑M1/14‑47 (MQ=255) ccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:1227694‑M1/14‑67 (MQ=255) ccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTCCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:1351129‑M1/14‑67 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:1381137‑M1/59‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:1811388‑M1/59‑1 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAc < 1:4355531/69‑1 (MQ=255) gcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:1768105‑M1/12‑58 (MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatg < 1:343594‑M1/51‑1 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:2914621/1‑70 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:1498483‑M1/9‑50 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga > 1:3975176‑M1/9‑60 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTg > 1:2278058‑M1/8‑49 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGaa > 1:2986510‑M1/8‑51 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc > 1:545703‑M1/8‑66 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACa < 1:3603737‑M1/63‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg < 1:4684337‑M1/64‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:3829240‑M1/7‑52 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:1598667‑M1/7‑71 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc < 1:903142‑M1/65‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc < 1:3713685‑M1/65‑1 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:3154030‑M1/6‑39 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:1655398‑M1/6‑55 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtg > 1:2133271‑M1/6‑53 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc < 1:690011‑M1/65‑1 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCt > 1:45430‑M1/6‑71 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:3685848/58‑1 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGTATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:1552894‑M1/5‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:2414797‑M1/5‑71 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa < 1:1163883‑M1/56‑1 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAct < 1:2047665‑M1/58‑1 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGa > 1:464309‑M1/3‑45 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat < 1:4280170/70‑1 (MQ=255) | GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > minE/436189‑436329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |