| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | 436259 = | 74 (0.970) | 335 (4.780) | 88/92 | NT | 84.4% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | = 2706018 | 56 (0.800) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 511 total aligned reads displayed.
GGCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCGCC > minE/2705948‑2706088 | ggcACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTTTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:282478/71‑1 (MQ=255) gCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:1147553‑M2/71‑2 (MQ=255) cacaCGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa > 1:4402966‑M2/1‑69 (MQ=255) acacGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAatt > 1:1285205‑M2/1‑68 (MQ=255) cGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:1347192‑M2/71‑7 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:2353267‑M2/70‑7 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:4040746‑M2/65‑2 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCTAAAAAATAattcagct < 1:2958723‑M2/69‑9 (MQ=255) aaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:3429866‑M2/1‑60 (MQ=255) aaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:2465430‑M2/1‑59 (MQ=255) aaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga < 1:3654835‑M2/71‑13 (MQ=255) ggTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa < 1:1445220‑M2/67‑11 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:402061‑M2/71‑16 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac < 1:3963413‑M2/71‑16 (MQ=255) gTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:1082882‑M2/1‑56 (MQ=255) tGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:2677089‑M2/1‑55 (MQ=255) tGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattca < 1:1698958‑M2/60‑6 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactg > 1:312261‑M2/1‑53 (MQ=255) gACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:4325561‑M2/1‑53 (MQ=255) aCGAACTGCTGGCTTTTTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:276813/52‑1 (MQ=255) aCGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa > 1:4083294‑M2/1‑52 (MQ=255) gAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacac > 1:3361293‑M2/1‑50 (MQ=255) aaCTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATtctc < 1:2034404/55‑1 (MQ=255) tgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:2995530‑M2/1‑46 (MQ=255) tgctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa > 1:2312301‑M2/1‑46 (MQ=255) gctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgca < 1:67121‑M2/64‑20 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggatta > 1:11706‑M2/1‑44 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggatt > 1:1119018‑M2/1‑44 (MQ=255) ctgGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggat < 1:2872067‑M2/69‑26 (MQ=255) gCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggatt < 1:1039125‑M2/67‑27 (MQ=255) tttGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagat < 1:1235969‑M2/70‑32 (MQ=255) tttGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaaga > 1:4131214‑M2/1‑39 (MQ=255) tttGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCAGCGAAAAAATAa > 1:727844‑M2/1‑39 (MQ=255) ttGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:945125‑M2/1‑38 (MQ=255) tGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga < 1:3239207‑M2/49‑13 (MQ=255) gTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa > 1:3488146‑M2/1‑36 (MQ=255) gTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa > 1:1307983‑M2/1‑36 (MQ=255) gTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa < 1:4500516‑M2/70‑35 (MQ=255) gTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaa < 1:1003671‑M2/70‑35 (MQ=255) cAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac < 1:2173174‑M2/70‑38 (MQ=255) cAAACCAGGAGTCGTTTCACCCCCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaac > 1:4554596‑M2/1‑33 (MQ=255) aaaCCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacga > 1:542770‑M2/1‑32 (MQ=255) cAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattga > 1:3904557‑M2/1‑28 (MQ=255) cAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattga > 1:572327‑M2/1‑28 (MQ=255) aGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:254717‑M2/1‑27 (MQ=255) ggAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaag > 1:1860287‑M2/1‑26 (MQ=255) gAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagt < 1:261758‑M2/71‑47 (MQ=255) gAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagt < 1:3012994‑M2/71‑47 (MQ=255) gAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaa > 1:819459‑M2/1‑25 (MQ=255) aGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg < 1:1634398‑M2/66‑43 (MQ=255) gTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg > 1:3556599‑M2/1‑23 (MQ=255) gTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt < 1:3275989‑M2/70‑48 (MQ=255) gTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt < 1:751779‑M2/70‑48 (MQ=255) gTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagtt < 1:3814975‑M2/70‑48 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg > 1:315346‑M2/1‑22 (MQ=255) tCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttat > 1:2062362‑M2/1‑22 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:1790281‑M2/1‑20 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat < 1:2386439‑M2/70‑51 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat < 1:3191068‑M2/70‑51 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:2145391‑M2/1‑20 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:3338631‑M2/1‑20 (MQ=255) gTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat > 1:874340‑M2/1‑20 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:3630561‑M2/1‑19 (MQ=255) tttCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:1957644‑M2/1‑19 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:192326‑M2/70‑54 (MQ=255) tCACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgat < 1:1664542‑M2/70‑54 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:4218361‑M2/1‑16 (MQ=255) cACCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagat > 1:3687703‑M2/1‑16 (MQ=255) aCCCGCGAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatg > 1:120586‑M2/1‑15 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCt > 1:2923059/1‑70 (MQ=255) ccGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTg < 1:305543/71‑1 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:1381137‑M2/71‑60 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:1811388‑M2/71‑60 (MQ=255) cgcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatga < 1:4054074‑M2/67‑56 (MQ=255) cgcgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACATTAttt < 1:2649457/44‑1 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactct > 1:3531525‑M2/1‑11 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:625652‑M2/70‑60 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactc < 1:2220294‑M2/70‑60 (MQ=255) gcgAAAAAATAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaa < 1:1777424‑M2/67‑57 (MQ=255) gcgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAg > 1:2582745/1‑38 (MQ=255) gcgAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAt < 1:1589895/71‑1 (MQ=255) aaaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:1498483‑M2/1‑8 (MQ=255) aaaaaaTAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTg < 1:483049/41‑1 (MQ=255) aaaaaaTAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGAtttt < 1:2259294/71‑1 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacag > 1:3610377‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacag < 1:4684337‑M2/71‑65 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaa > 1:2706245‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:1426950‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattg > 1:2278058‑M2/1‑7 (MQ=255) aaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagc < 1:3713685‑M2/71‑66 (MQ=255) aaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagc < 1:1569738‑M2/71‑66 (MQ=255) aaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgat < 1:4598211‑M2/56‑51 (MQ=255) aaaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagt > 1:4165855‑M2/1‑6 (MQ=255) aaaaTAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTc < 1:4146269/50‑1 (MQ=255) aaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagct > 1:4455434‑M2/1‑5 (MQ=255) aaaTAattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttg > 1:4258911‑M2/1‑5 (MQ=255) aataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagcta > 1:2414797‑M2/1‑4 (MQ=255) ataattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctat > 1:2506630‑M2/1‑3 (MQ=255) taattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattga > 1:464309‑M2/1‑2 (MQ=255) aattcagctaagacactgcactggattaagatgaaaacgattgaagttgatgatgaactctacagctatat < 1:373757‑M2/71‑71 (MQ=255) | GGCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCCGCC > minE/2705948‑2706088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |