| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | 205097 = | 42 (0.880) | 58 (1.650) +TTATAACATTTTA |
15/76 | NT | 64.0% | intergenic (+8/‑29) | rnhB/dnaE | ribonuclease HII, degrades RNA of DNA‑RNA hybrids/DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | W3110S.gb | 4139149 = | 46 (0.970) | coding (2/1023 nt) | frlB | fructoselysine‑6‑P‑deglycase | |||||
AGACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/205131‑205097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGAT > W3110S.gb/4139149‑4139166 ||||||||||||| ggtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:3671014/4‑63ggtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:3589929/4‑63ggtCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2818490/4‑63 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:1718658/53‑1 tCATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTT < 1:1364864/34‑1 CATCTTCAGATTCCGGTTTTCTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:1187807/1‑53 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtta > 1:2038406/1‑60 CATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:2125531/1‑53 ATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACAT < 1:1972367/40‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtta < 1:603664/61‑4 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:1310281/60‑3 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2552015/60‑3 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCC < 1:376075/57‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC < 1:1745387/54‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT < 1:2685479/52‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT < 1:2897097/52‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:2806428/51‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:3824017/51‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:1245076/48‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT < 1:243183/47‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:1958506/1‑44 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:1163942/42‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:2693837/42‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:2216378/42‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTT < 1:3219377/42‑1 TCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACA < 1:4280203/38‑1 CTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAA > 1:3390314/1‑35 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:3251255/57‑2 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:3595250/1‑56 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC > 1:1221798/1‑52 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:347948/1‑51 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:4422833/1‑51 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:4204243/49‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:981460/49‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT > 1:3206933/1‑48 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT < 1:895121/45‑1 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATT > 1:2389824/1‑44 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATT > 1:2417706/1‑44 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:3099712/1‑43 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:3591509/1‑43 TTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA > 1:1608817/1‑41 TTCAGATTACGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:15420/1‑51 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:2200183/1‑50 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:1853246/1‑42 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAAT > 1:1266552/1‑42 TCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA < 1:390598/41‑1 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:469980/1‑47 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT > 1:1349237/1‑46 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:1348346/1‑45 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTA > 1:4354201/1‑45 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATT > 1:577657/1‑42 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAA > 1:2165504/1‑40 CAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATATTAAT > 1:1629783/1‑41 GATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC < 1:2433816/48‑1 GATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT > 1:3089399/1‑45 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:1866519/44‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:844888/41‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTT < 1:3670622/41‑1 ATTCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTA < 1:3573363/36‑1 TCCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:1782568/42‑1 CCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:132835/1‑48 CCGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTT < 1:3889728/37‑1 CGGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTAT < 1:2605750/39‑1 CGGTTTACATAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCC > 1:935439/1‑46 GGTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:2726575/44‑1 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:1258400/47‑3 GTTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:188698/47‑3 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2296901/46‑3 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:3843933/45‑2 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:2853349/1‑44 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCA > 1:4393216/1‑44 TTTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATT < 1:3241088/37‑1 TTACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2136620/45‑3 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:4070488/1‑37 TACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTT > 1:1943860/1‑37 ACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCat > 1:2599792/1‑39 ACTTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTT < 1:1376091/35‑1 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:2145310/41‑3 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:4175247/37‑1 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTC < 1:3703937/37‑1 TTAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTC < 1:1255926/35‑1 TAATCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAtt < 1:1796686/40‑3 TCTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:3752173/36‑2 CTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:40114/35‑2 CTCGACTTATAACATTTTAATTTTATTTTCTCCAt < 1:1614367/35‑2 ||||||||||||| AGACATCTTCAGATTCCGGTTTACTTAATCTCGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < W3110S.gb/205131‑205097‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATTTTATTTTCTCCAGAT > W3110S.gb/4139149‑4139166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |