| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | W3110S.gb | = 713954 | 33 (1.180) | 60 (2.140) | 28/100 | NT | 56.1% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | W3110S.gb | 2809398 = | 61 (2.180) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAA > W3110S.gb/2809329‑2809464 | tatataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCg > 1:1842695/1‑71 (MQ=255) tcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCgg > 1:1083952‑M2/69‑71 (MQ=255) tcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCgg > 1:2623312‑M2/69‑71 (MQ=255) tcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCg > 1:2584280‑M2/69‑70 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:172051‑M2/7‑1 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:1603336/70‑1 (MQ=255) catcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:926862‑M2/10‑1 (MQ=255) cacaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:427626/71‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:612201‑M2/11‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1867812‑M2/11‑1 (MQ=255) caAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:1187336/1‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgctattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:441068‑M2/58‑70 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:1047306‑M2/58‑70 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:2369201/1‑71 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:1222550‑M2/15‑1 (MQ=255) gAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATc > 1:1833861/1‑56 (MQ=255) gAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATc > 1:1685225/1‑56 (MQ=255) cagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAg > 1:2634303‑M2/55‑71 (MQ=255) gtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:1737372‑M2/19‑1 (MQ=255) tcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:2077346‑M2/52‑70 (MQ=255) tcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:2026951‑M2/52‑70 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAgg > 1:2488444/1‑69 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:684633/1‑70 (MQ=255) cATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt > 1:936836/1‑70 (MQ=255) cgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:2553229‑M2/51‑71 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:529448/1‑71 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:1900623/1‑71 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:248324/1‑71 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTAGAATATCGGCt > 1:2428265/1‑54 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt < 1:1093302/63‑1 (MQ=255) tttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGa > 1:1463510/1‑63 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:2306662‑M2/47‑71 (MQ=255) caattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:2528426‑M2/46‑58 (MQ=255) caattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:1473416‑M2/46‑58 (MQ=255) caattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGCCTGAAATTaa > 1:2446647‑M2/46‑58 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1521376‑M2/11‑1 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:597187‑M2/27‑1 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:2456940‑M2/27‑1 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:2405841‑M2/27‑1 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:676303‑M2/43‑71 (MQ=255) tcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAAt > 1:1940019‑M2/42‑71 (MQ=255) aaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:1660485/71‑1 (MQ=255) ccgtcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:2160296‑M2/31‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:1899414‑M2/31‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:2212539‑M2/31‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:174025‑M2/31‑1 (MQ=255) aaTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:1636711/1‑70 (MQ=255) aaTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:1761335/1‑70 (MQ=255) aCATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:2317566/41‑1 (MQ=255) aCATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGt > 1:709131/1‑71 (MQ=255) gaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:1859837‑M2/34‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:1172026‑M2/7‑1 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:69687‑M2/7‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:1461383‑M2/40‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:1656399‑M2/41‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:1728528‑M2/31‑71 (MQ=255) tgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:804529‑M2/19‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:220139‑M2/29‑63 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATa > 1:324663‑M2/29‑63 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:690007/70‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:132797/1‑70 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2494605/70‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:1397418/1‑70 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1503709/70‑1 (MQ=255) tttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGTATAGTTCGtt < 1:169013/68‑1 (MQ=255) tttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:2264119/60‑1 (MQ=255) tttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGAt < 1:1782159/60‑1 (MQ=255) tttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:692231/68‑1 (MQ=255) ttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1746575/67‑1 (MQ=255) tttGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc < 1:1033719/70‑1 (MQ=255) gaaggtttgctgaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc > 1:1833766‑M2/23‑70 (MQ=255) gaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGcc > 1:1706941‑M2/23‑70 (MQ=255) tGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGa > 1:875838/1‑36 (MQ=255) tGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGa > 1:1097172/1‑36 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:1900970‑M2/21‑60 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg > 1:405236‑M2/21‑60 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:846179/1‑71 (MQ=255) tCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:756616/1‑70 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTg > 1:65423‑M2/18‑70 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:525764/41‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:1384761/41‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:510853/41‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:899443/41‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:1659871‑M2/57‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa > 1:664095‑M2/14‑70 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:1548378‑M2/57‑1 (MQ=255) cggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa > 1:1088608‑M2/14‑70 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1162770/1‑56 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaaa > 1:387065/1‑71 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:466076/69‑1 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:312966/69‑1 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2106475‑M2/42‑1 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt > 1:413353/1‑70 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTa > 1:546901‑M2/7‑70 (MQ=255) atctaaAGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTa > 1:74206‑M2/7‑70 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:2122049‑M2/32‑1 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg < 1:1678796‑M2/32‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa > 1:309547/1‑70 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:497536‑M2/42‑1 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc < 1:1346595/50‑1 (MQ=255) | TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAA > W3110S.gb/2809329‑2809464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |