| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | minE | = 436833 | 100 (1.450) | 62 (0.900) | 37/104 | NT | 40.4% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | minE | 1803907 = | 83 (1.200) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATT > minE/1803838‑1803975 | tatataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCg > 1:3548822/1‑71 (MQ=255)atcgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaac < 1:1384256‑M2/1‑1 (MQ=255) cgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGc > 1:631197‑M2/68‑71 (MQ=255) cgaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGc > 1:2938422‑M2/68‑71 (MQ=255) ataACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCt > 1:1751059/1‑71 (MQ=255) taACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCt > 1:3986954/1‑70 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGaa < 1:1993102/71‑1 (MQ=255) aCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa > 1:2479597/1‑70 (MQ=255) catcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:1560985‑M2/10‑1 (MQ=255) acaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:3070461/66‑1 (MQ=255) catgcagtcgatgcaattcccggctgaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:2161441‑M2/59‑71 (MQ=255) caAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:3357666/1‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:1128559‑M2/58‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:41784‑M2/58‑71 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:2793220/1‑71 (MQ=255) aGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:3319352/71‑1 (MQ=255) aGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATg < 1:1650886/71‑1 (MQ=255) gAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:3041479/66‑1 (MQ=255) cagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAg > 1:2841274‑M2/55‑71 (MQ=255) agtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:2442606‑M2/11‑1 (MQ=255) tCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:3157542/71‑1 (MQ=255) gtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:3715021‑M2/19‑1 (MQ=255) tcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:2879337‑M2/15‑1 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:2245720/1‑71 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:2771862/1‑71 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:884650/60‑1 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:1748442/60‑1 (MQ=255) tttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt < 1:1605060/71‑1 (MQ=255) ttttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATAGGCTGAAATTaa > 1:613695/1‑61 (MQ=255) ttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:439104/1‑60 (MQ=255) ttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:2194338/1‑71 (MQ=255) ttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:2608714/1‑71 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:2357064‑M2/11‑1 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:3369203‑M2/11‑1 (MQ=255) aattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCa < 1:483697‑M2/21‑1 (MQ=255) ttcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt > 1:444051‑M2/43‑64 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAt < 1:1854034‑M2/10‑1 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:3253215‑M2/41‑71 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:255917‑M2/41‑71 (MQ=255) aaCAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:324346/71‑1 (MQ=255) ccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:115409‑M2/11‑1 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:3694871‑M2/38‑50 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:2721064/43‑1 (MQ=255) aTACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:2383645/43‑1 (MQ=255) ggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGt < 1:3950244‑M2/37‑1 (MQ=255) cATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAt > 1:786486/1‑43 (MQ=255) aattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTc > 1:1111582‑M2/33‑71 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTg < 1:3481280/37‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTg < 1:4027622/37‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:3398008/71‑1 (MQ=255) attgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:3327781‑M2/40‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:2308587‑M2/41‑1 (MQ=255) ttgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:346099‑M2/41‑1 (MQ=255) ttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:2941886/1‑59 (MQ=255) ttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:400923/1‑59 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGa < 1:1502800/36‑1 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:2042725/1‑71 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:3565893/1‑41 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa < 1:613162/61‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:2816677/70‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:120649/54‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt < 1:3430607/70‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt < 1:3049303/70‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt < 1:1795629/70‑1 (MQ=255) cTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCCTTTa < 1:1901899/71‑1 (MQ=255) attgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGttt < 1:2493163‑M2/43‑1 (MQ=255) tttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAg > 1:1876062/1‑62 (MQ=255) ttGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:1615276/1‑71 (MQ=255) aaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:1308454‑M2/22‑71 (MQ=255) aaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:2797909‑M2/22‑71 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:2366981/1‑71 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt < 1:2954051‑M2/41‑1 (MQ=255) cACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTg > 1:1468992/1‑70 (MQ=255) aCTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1674600/58‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3701144/41‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3739741/41‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:2773825/41‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1230578/1‑58 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaa < 1:749357/70‑1 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:3100255/69‑1 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACa < 1:2633095/69‑1 (MQ=255) ggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaaa < 1:640217‑M2/59‑1 (MQ=255) gTTACTATATCGGCTGAATTTAATGAGGTCATACCCa < 1:2227563/37‑1 (MQ=255) gTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3686063/37‑1 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATg > 1:3880396‑M2/11‑71 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc > 1:1075302‑M2/9‑57 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg < 1:2455525‑M2/31‑1 (MQ=255) tatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCt > 1:4060083‑M2/8‑70 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGTTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGc > 1:521673/1‑69 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGt > 1:142893‑M2/7‑47 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:2866618‑M2/7‑50 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACg > 1:4020503‑M2/7‑52 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAAt > 1:3635461‑M2/7‑66 (MQ=255) tctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaa > 1:793210‑M2/6‑70 (MQ=255) tataTCGTCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:407278/43‑1 (MQ=255) gatatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1712795/46‑1 (MQ=255) atatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa > 1:3803381/1‑71 (MQ=255) tCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1014314/43‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAg > 1:64932‑M2/2‑37 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAg > 1:1921372‑M2/2‑37 (MQ=255) | TATATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATT > minE/1803838‑1803975 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |