| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 1152045 | 110 (1.350) | 5 (0.070) | 3/88 | NT | 5.2% | coding (741/930 nt) | fabD | malonyl‑CoA‑[acyl‑carrier‑protein] transacylase |
| ? | AP009048 | = 1152069 | 83 (1.140) | coding (765/930 nt) | fabD | malonyl‑CoA‑[acyl‑carrier‑protein] transacylase | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
CAACAGTTCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGTAGAA > AP009048/1151975‑1152114 | aaCAGTTCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTgg > 1:7040486/1‑71 (MQ=255) aaCAGTTCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTgg > 1:4536077/1‑71 (MQ=255) aaCAGTTCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTgg < 1:6065600/71‑1 (MQ=255) aCAGTTCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTgg > 1:7329488/1‑70 (MQ=255) tCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTG > 1:3864510‑M1/1‑64 (MQ=255) tCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTG > 1:6763808‑M1/1‑64 (MQ=255) ccTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTG < 1:2735395‑M1/63‑1 (MQ=255) tgttgtGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAg > 1:7597919/1‑70 (MQ=255) ttgtGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGtt < 1:2357381/70‑1 (MQ=255) ttgtGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGtt < 1:3510527/70‑1 (MQ=255) tgtgAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAAACAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTg > 1:350927/1‑70 (MQ=255) gtgAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGt > 1:6998277/1‑63 (MQ=255) gtgAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGt < 1:7219628/70‑1 (MQ=255) tgAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGtat < 1:1189124/71‑1 (MQ=255) gAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGtat > 1:6909933/1‑70 (MQ=255) gAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGtat > 1:1297937/1‑70 (MQ=255) gAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGtat < 1:1246845/70‑1 (MQ=255) aaTAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATaa < 1:1071055/71‑1 (MQ=255) aTAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGtat < 1:1238891/68‑1 (MQ=255) tAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAAcc > 1:7096201/1‑71 (MQ=255) tAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAAcc < 1:2116233/71‑1 (MQ=255) tAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAAcc < 1:2933117/71‑1 (MQ=255) aCGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCg > 1:4906474/1‑71 (MQ=255) aCGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCg > 1:3196937/1‑71 (MQ=255) ttGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGtt > 1:1024557/1‑71 (MQ=255) tGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGtt > 1:6195213/1‑70 (MQ=255) tGATGTGAAATGCGAAACAAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGtt > 1:7477591/1‑70 (MQ=255) gATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCg > 1:7813408/1‑66 (MQ=255) gATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCg > 1:3947748/1‑66 (MQ=255) gATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGtt > 1:4299207/1‑69 (MQ=255) aTGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGta > 1:2552426/1‑58 (MQ=255) aTGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTca > 1:3054756‑M2/1‑68 (MQ=255) gtgAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCgg < 1:5841060/64‑1 (MQ=255) tgAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtg < 1:1491009‑M1/70‑30 (MQ=255) tgAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcagtg < 1:2553809‑M2/70‑6 (MQ=255) aaaTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGtt < 1:5771827/63‑1 (MQ=255) aaaTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGAc < 1:3657236/71‑1 (MQ=255) aaaTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGAc < 1:7214114/71‑1 (MQ=255) aaTGGGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACg < 1:6237877/71‑1 (MQ=255) aaTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACg < 1:3810181/71‑1 (MQ=255) aaTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACg < 1:6406450/71‑1 (MQ=255) aTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCa > 1:6818787/1‑45 (MQ=255) aTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCa > 1:4169323/1‑45 (MQ=255) aTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcag > 1:1513756‑M2/1‑61 (MQ=255) aTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACg > 1:6972803/1‑70 (MQ=255) aTGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACg < 1:2539275/70‑1 (MQ=255) gCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAg > 1:1533476/1‑71 (MQ=255) gCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAg > 1:535938/1‑71 (MQ=255) cGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagt > 1:364212‑M1/1‑34 (MQ=255) cGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGt < 1:5592796/71‑1 (MQ=255) gAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagt < 1:4603446‑M1/61‑29 (MQ=255) gAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTca < 1:2440408‑M2/59‑3 (MQ=255) gAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTc < 1:6277226/71‑1 (MQ=255) aaaCCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTCGACGAAGTCt < 1:501791/71‑1 (MQ=255) aaCCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcagt < 1:7611332‑M2/59‑5 (MQ=255) ccAATGGTGATGCCATCCGTGACGTACCAGTGCGTc < 1:843494/36‑1 (MQ=16) aTGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAg > 1:535675/1‑71 (MQ=255) ggTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTa > 1:6589037/1‑71 (MQ=255) ggTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTa > 1:1881671/1‑71 (MQ=255) ggTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTa > 1:6448907/1‑71 (MQ=255) gTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTAc < 1:4637696/71‑1 (MQ=255) aTGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACAt < 1:3280389/70‑1 (MQ=255) aTGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATg > 1:1786278/1‑71 (MQ=255) tGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACg > 1:551412/1‑52 (MQ=255) ccATCTGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCa < 1:7802753/71‑1 (MQ=255) cATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcag < 1:5170920‑M2/43‑4 (MQ=255) cATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcag < 1:6857926‑M2/43‑4 (MQ=255) ccGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCa < 1:4700590/67‑1 (MQ=255) cGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGCTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCa < 1:986047/71‑1 (MQ=255) cGTGACGCACTAGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCa < 1:3391028/71‑1 (MQ=255) gTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAg < 1:5169763/56‑1 (MQ=255) gTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAg < 1:4225997/56‑1 (MQ=255) gTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTAc < 1:5988311/59‑1 (MQ=255) gTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCaa < 1:6564660/71‑1 (MQ=255) tGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAg < 1:43895/55‑1 (MQ=255) aCGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGc > 1:4982698/1‑61 (MQ=255) aCGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGc > 1:2283820/1‑71 (MQ=255) aCGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGc > 1:5620537/1‑71 (MQ=255) gCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGt < 1:1294295/71‑1 (MQ=255) cACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttcac < 1:5507329‑M1/71‑67 (MQ=255) cACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttcac < 1:4863800‑M1/71‑67 (MQ=255) cACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttcac < 1:4371279‑M1/71‑67 (MQ=255) cACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttca < 1:7047385‑M1/70‑66 (MQ=255) cACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttaa > 1:6402329‑M1/1‑5 (MQ=255) cACTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttc > 1:4245564‑M1/1‑5 (MQ=255) cACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttca < 1:2179914‑M2/70‑42 (MQ=255) cACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcatttca < 1:1491009‑M2/70‑42 (MQ=255) cACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGt < 1:7403289/70‑1 (MQ=255) aCTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtt < 1:3632964‑M1/59‑56 (MQ=255) aCTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttc < 1:4603446‑M2/61‑34 (MQ=255) aCTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTcagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttc < 1:4051032‑M2/61‑34 (MQ=255) aCTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGtt > 1:2944059/1‑46 (MQ=255) aCTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCg > 1:4845091/1‑68 (MQ=255) aCTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGTa < 1:6909754/70‑1 (MQ=255) cTGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttcgcat > 1:7198465‑M1/1‑3 (MQ=255) tGaaccgggttatacaactgacgtaccagtgcgtcacggatggcatcaccattggtttc < 1:576790‑M1/59‑58 (MQ=255) tGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGTAGaa > 1:3982604/1‑71 (MQ=255) tGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGTAGaa > 1:635091/1‑71 (MQ=255) ggTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGt < 1:7696096/47‑1 (MQ=255) ggTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATgg > 1:1641905/1‑53 (MQ=255) | CAACAGTTCCTGTTGTGAATAACGTTGATGTGAAATGCGAAACCAATGGTGATGCCATCCGTGACGCACTGGTACGTCAGTTGTATAACCCGGTTCAGTGGACGAAGTCTGTTGAGTACATGGCAGCGCAAGGCGTAGAA > AP009048/1151975‑1152114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |