| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 147275 = | 49 (0.830) | 4 (0.080) | 3/90 | NT | 7.6% | coding (431/2430 nt) | hrpB | predicted ATP‑dependent helicase |
| ? | Exported | 147295 = | 54 (1.040) | coding (451/2430 nt) | hrpB | predicted ATP‑dependent helicase | |||||
ATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATG > Exported/147205‑147345 | cgacaggcgcttctggcagcatttgctgcaagcggtcgttgtccagggtagccgacataatcagcagttta > 1:2372234‑M1/71‑71 (MQ=255)aTCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGcaaca < 1:940824/71‑1 (MQ=255) gacaggcgcttctggcagcatttgctgcaagcggtcgttgtccagggtagccgacataatcagcagttta > 1:406353‑M1/70‑70 (MQ=255) ccTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAg > 1:99467/1‑71 (MQ=255) ccTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAg > 1:2330503/1‑71 (MQ=255) ccTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAg > 1:3688702/1‑71 (MQ=255) ccTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAg > 1:1178038/1‑71 (MQ=255) gcgcttctggcagcatttgctgcaagcggtcgttgtccagggtacccgacataatcagcagtttaa > 1:3549897‑M1/65‑66 (MQ=255) gatgaATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt < 1:3162370/69‑1 (MQ=255) gatgaATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt < 1:3081509/69‑1 (MQ=255) gatgaATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt < 1:2850729/69‑1 (MQ=255) gatgaATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGt < 1:3499302/69‑1 (MQ=255) aTTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGt > 1:1913886/1‑70 (MQ=255) tttCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtga > 1:2294081/1‑71 (MQ=255) cATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgatg < 1:1631902/70‑1 (MQ=255) cATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgatg < 1:2516388/70‑1 (MQ=255) gAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCt > 1:1215737/1‑71 (MQ=255) gAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCt > 1:2450789/1‑71 (MQ=255) gcgcAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTa < 1:2085125/71‑1 (MQ=255) atttgctgcaagcggtcgttgtccagggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCtt < 1:921677‑M1/20‑1 (MQ=255) gctgcaagcggtcgttgtccagggtagccgacataatcagcagtttaa < 1:3370243‑M1/2‑1 (MQ=255) gctgcaagcggtcgttgtccagggtagccgacataatcagcagtttaa < 1:302206‑M1/2‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGtgatg < 1:3039128/58‑1 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTaaa > 1:2749124/1‑65 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTaaa > 1:161199/1‑65 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActgct > 1:1613455/1‑70 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActgct > 1:1538793/1‑70 (MQ=255) gCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGAc > 1:2049109/1‑58 (MQ=255) aagcggtcgttgtccagggtagccgacataatcagcagtttAAGGTc > 1:3468129‑M1/42‑47 (MQ=255) 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cagggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAAct > 1:388909‑M1/28‑52 (MQ=255) ttggcgCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCt < 1:3324452/71‑1 (MQ=255) gggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActgc < 1:2323282‑M1/27‑1 (MQ=255) gggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActg < 1:847100‑M1/26‑1 (MQ=255) cgcTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:1921419/1‑70 (MQ=255) gcTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTTATGACCt < 1:3330813/39‑1 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTc > 1:1619996/1‑55 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt > 1:3642965/1‑59 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:2679445/1‑65 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACaa > 1:1563632/1‑70 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc > 1:3561811/1‑71 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc > 1:188586/1‑71 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAccc < 1:2360514/59‑1 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 1:3222183/1‑58 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 1:711204/1‑58 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 1:1464044/1‑58 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:3105535/1‑60 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:1959501/1‑60 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGAcc < 1:353146/70‑1 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCg < 1:1866029/71‑1 (MQ=255) cTCGATATGCAACAAGGTGTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCt > 1:480079/1‑59 (MQ=255) gATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATTACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCtt < 1:800137/71‑1 (MQ=255) 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caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:313532/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:2159317/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:3242184/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:1732996/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:3620203/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc < 1:3496222/63‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc < 1:2538919/63‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:3359864/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:3512896/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:763928/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:3014298/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagc < 1:633392/70‑1 (MQ=255) aacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagc > 1:2580623/1‑69 (MQ=255) acaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCaaa > 1:2571013/1‑71 (MQ=255) caaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAt < 1:1992009/71‑1 (MQ=255) AAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAtg > 1:2050234‑M1/1‑71 (MQ=255) | ATCCTTGATGAATTTCATGAGCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATG > Exported/147205‑147345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |