| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 147275 = | 49 (0.830) | 4 (0.080) | 3/90 | NT | 7.6% | coding (431/2430 nt) | hrpB | predicted ATP‑dependent helicase |
| ? | Exported | 147295 = | 54 (1.040) | coding (451/2430 nt) | hrpB | predicted ATP‑dependent helicase | |||||
GCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCG > Exported/147225‑147364 | gcgcAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTa < 1:2085125/71‑1 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTaaa > 1:2749124/1‑65 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTaaa > 1:161199/1‑65 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActgct > 1:1538793/1‑70 (MQ=255) tGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActgct > 1:1613455/1‑70 (MQ=255) ggCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTa > 1:2719523/1‑71 (MQ=255) gCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTAt > 1:3026301/1‑71 (MQ=255) ggcgttggcgCTTTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt < 1:999947/70‑1 (MQ=255) cgttggcgCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTa > 1:3626109/1‑60 (MQ=255) cgttggcgCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTa > 1:3643423/1‑60 (MQ=255) cagggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAAct > 1:388909‑M1/28‑52 (MQ=255) ttggcgCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCt < 1:3324452/71‑1 (MQ=255) gggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActgc < 1:2323282‑M1/27‑1 (MQ=255) gggtagccgacataatcagcagtttAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAActg < 1:847100‑M1/26‑1 (MQ=255) cgcTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:1921419/1‑70 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTc > 1:1619996/1‑55 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCt > 1:3642965/1‑59 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:2679445/1‑65 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACaa > 1:1563632/1‑70 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc > 1:3561811/1‑71 (MQ=255) tGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc > 1:188586/1‑71 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAccc < 1:2360514/59‑1 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 1:711204/1‑58 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 1:1464044/1‑58 (MQ=255) aCTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAcc > 1:3222183/1‑58 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:1959501/1‑60 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:3105535/1‑60 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGAcc < 1:353146/70‑1 (MQ=255) cTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCg < 1:1866029/71‑1 (MQ=255) cTCGATATGCAACAAGGTGTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCt > 1:480079/1‑59 (MQ=255) gATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATTACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCtt < 1:800137/71‑1 (MQ=255) 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1:847100‑M2/25‑1 (MQ=255) agtaacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgc < 1:1639965/66‑1 (MQ=255) agtttaaggtcatcacgcagaccttAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTg > 1:388909‑M2/26‑52 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:3620203/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:3242184/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:313532/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:2159317/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGa > 1:1732996/1‑53 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc < 1:2538919/63‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGc < 1:3496222/63‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:763928/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:3512896/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:3359864/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagca < 1:3014298/71‑1 (MQ=255) caacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagc < 1:633392/70‑1 (MQ=255) aacaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagc > 1:2580623/1‑69 (MQ=255) acaaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCaaa > 1:2571013/1‑71 (MQ=255) caaGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAt < 1:1992009/71‑1 (MQ=255) aaggtcatcacgcagaccttAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAt < 1:921677‑M2/50‑1 (MQ=255) AAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAtg > 1:2050234‑M1/1‑71 (MQ=255) AGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAtgc > 1:2455564‑M1/1‑71 (MQ=255) AGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAAtgc > 1:2873952‑M1/1‑71 (MQ=255) 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gTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACaa > 1:3460738/1‑43 (MQ=255) gTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACaa > 1:719789/1‑43 (MQ=255) atgaCCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAgcg > 1:2955703/1‑71 (MQ=255) atgaCCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAgcg > 1:84077/1‑71 (MQ=255) tgaCCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTAACCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAgcgc > 1:3345812/1‑71 (MQ=255) gaccttAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCtt > 1:3468129‑M2/7‑47 (MQ=255) ttAAACTGCTGATTATGTCGGGTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAgcgc > 1:3549897‑M2/3‑66 (MQ=255) ttAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAAc < 1:2198502‑M2/33‑1 (MQ=255) ttAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagc < 1:3370243‑M2/46‑1 (MQ=255) ttAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTgcagc < 1:302206‑M2/46‑1 (MQ=255) tAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTc > 1:406353‑M2/2‑70 (MQ=255) tAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCg > 1:2372234‑M2/2‑71 (MQ=255) aaaCTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGa > 1:1364923/1‑35 (MQ=255) | GCGCAGCTTGCAGGCGGATTTGGCGTTGGCGCTGTTACTCGATGTGCAACAAGGTCTGCGTGATGACCTTAAACTGCTGATTATGTCGGCTACCCTGGACAACGACCGCTTGCAGCAAATGCTGCCAGAAGCGCCTGTCG > Exported/147225‑147364 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |