New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP006881 | 1668917 = | 58 (0.960) | 10 (0.170) | 9/230 | NT | 13.4% | coding (60/780 nt) | U712_08600 | Flagellar biosynthetic protein fliR |
? | CP006881 | = 1669509 | 72 (1.200) | coding (652/780 nt) | U712_08600 | Flagellar biosynthetic protein fliR |
CAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCGGTGTTTCTTAATG > CP006881/1669384‑1669639 | cAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTGCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTGTAATGATCGCTGt > 4:88304/1‑139 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGt > 7:256784/1‑137 (MQ=255) aTGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGt > 8:152932/1‑137 (MQ=255) tttATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGtt < 6:226883/139‑1 (MQ=255) tttATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGt < 6:308940/138‑1 (MQ=255) tattatCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGttt > 6:134379/1‑138 (MQ=255) cGCTTTTCAATTGTCAGCTCCGGTTGTGTCCAGTTTGTTTCTAGTTGACTTAGCATTAGGTATCGTTGCTCGAACTGTTCAGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCATTATCATTATg < 2:308648/139‑1 (MQ=255) gCTTTTAAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGACAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTATGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg < 8:119633/138‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTTCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 8:180705/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCGTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATTCt > 3:183205/1‑139 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATgac > 1:240257/1‑137 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGc > 3:226389/1‑138 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 5:134379/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 3:326093/1‑139 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 8:166958/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 1:269861/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 1:215269/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 7:83895/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 4:64298/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 3:226000/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 4:326093/139‑1 (MQ=255) cTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCAGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGGCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 8:221371/139‑1 (MQ=255) ttgaaaTGTCAGAGCCTGTTGTGGCCAGTATGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATAGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 8:196782/135‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 3:127031/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 4:226389/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 1:134996/138‑1 (MQ=255) ttCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGGTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCa < 1:47586/138‑1 (MQ=255) cAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCAtt < 5:243365/138‑1 (MQ=255) aaaTGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgt < 8:322405/139‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGGATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgta < 8:61248/139‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgtatgta < 3:241844/139‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgtatgta < 1:288016/139‑1 (MQ=255) aGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGTTTTAGCTTTAGGTATCGGGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCAGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTgtatgtat < 8:236796/138‑1 (MQ=255) aGCGCCGGTTGTGGCCAGGTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTgtatgtat < 8:977/138‑1 (MQ=255) ccGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGtt < 6:329186/112‑1 (MQ=255) ccGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGtt > 5:329186/1‑112 (MQ=255) gTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTa > 3:99408/1‑139 (MQ=255) ttGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgtt > 3:43750‑M2/1‑90 (MQ=255) tttgtttCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcatag < 7:201359‑M2/139‑60 (MQ=255) tttgtttCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGtt > 5:142282/1‑139 (MQ=255) tttCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTcc < 3:127199/139‑1 (MQ=255) aTTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGtttt < 8:256784/139‑1 (MQ=255) aTTTAGCATTAGGTATCGAGGCTCGAACTGTTACGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTttatattgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccacctgttcatcgcatagttattgcttatat < 6:331821‑M2/138‑73 (MQ=255) aGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAAc > 1:305159/1‑138 (MQ=255) ggTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg > 4:55849/1‑71 (MQ=255) ggTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAg < 3:55849/71‑1 (MQ=255) ggTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGa > 4:303821/1‑139 (MQ=255) cGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgctttttttcttgcggtcatt > 8:279783‑M2/1‑50 (MQ=255) cGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgctttttttcttgcggtcatt < 7:279783‑M2/135‑86 (MQ=255) aaCTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 8:327642/1‑69 (MQ=255) aaCTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt > 3:240402/1‑69 (MQ=255) aaCTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 4:240402/69‑1 (MQ=255) aaCTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCt < 7:327642/69‑1 (MQ=255) aaCTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCgg < 4:99408/139‑1 (MQ=255) aCTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGa < 6:142282/139‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgctttttttcttgcggtcatt < 8:212342‑M2/121‑86 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgctttttttcttgcggtcatt > 7:212342‑M2/1‑36 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCt > 3:172112/1‑47 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCt < 4:172112/47‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg < 5:86352/62‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATg > 6:86352/1‑62 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCt > 1:170390/1‑139 (MQ=255) ttCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGAGGAATCt > 3:305970/1‑139 (MQ=255) aaaTGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgcttgttttcttgcggtcatttgtttcagcaccatttataaaccgccct < 1:129250‑M2/139‑114 (MQ=255) aaaTGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTg > 2:269472/1‑139 (MQ=255) aTGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGt < 1:269472/139‑1 (MQ=255) aTGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGt < 7:152932/139‑1 (MQ=255) aTGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGt < 3:303821/139‑1 (MQ=255) aTGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGt < 5:265658/139‑1 (MQ=255) tATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTTTGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCgg > 6:118543/1‑139 (MQ=255) ttGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCGgtgt > 7:104898/1‑139 (MQ=255) gtgGTCGGTCTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgctttttttcttgcggtcatttgtttcagcaccattgataaaccgccctctttggaga > 8:201359‑M2/1‑16 (MQ=255) gtgGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgtatgta > 2:199489/1‑55 (MQ=255) gtgGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATtgtatgta < 1:199489/55‑1 (MQ=255) cggtcTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCtttt < 3:2925/117‑1 (MQ=255) cggtcTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCtttt > 4:2925/1‑117 (MQ=255) gtcTGCCTTtttttttgtaacgattccgctatttggacatcgaaatgtgccagctgttcatcgcataggttttgctttttttcttgcggtcatttgtttcagcaccattgataaaccgccctctttggagatagatgag > 6:158580‑M2/1‑9 (MQ=255) gtcTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGa > 2:185244/1‑75 (MQ=255) gtcTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGa < 1:185244/75‑1 (MQ=255) gtcTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCGGTGTTTCTTAATg < 2:37018/139‑1 (MQ=255) gtcTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCGGTGTTTCTTAATg < 7:330059/139‑1 (MQ=255) gtcTGACCTTCAAGATCGCTGTCAGTATCATTATGCTCTTTGTATGGATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCGGTGTTTCTTAATg < 8:287590/139‑1 (MQ=255) | CAATGTTTATTATCGCTTTTCAAATGTCAGCGCCGGTTGTGGCCAGTTTGTTTCTAGTTGATTTAGCATTAGGTATCGTGGCTCGAACTGTTCCGCAGTTAAATGTATTTGTGGTCGGTCTGCCTTTAAAGATCGCTGTCAGTTTCATTATGCTCATTGTATGTATGTCCGTTATCTTCGTCGTTGTCCGGAATGTTTTCAGTTTAACGATTGAAACGATGCGGAATCTTTTAGCATTGGTCGGTGTTTCTTAATG > CP006881/1669384‑1669639 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |