New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 4579907 | 103 (1.190) | noncoding (73/77 nt) | symR | sRNA antisense regulator destabilizing divergent and overlapping symE mRNA | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GAATACGGCTGTAATCCGGGTAGCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAA > NC_000913/4579729‑4580025 | gAATACGGCTGTAATCCGGGTAGCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCG > 1:1249237‑M1/1‑149 (MQ=255) aaTACGGCTGTAATCCGGGTAGCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGc > 2:1530481‑M1/1‑148 (MQ=255) ggCTGTAATCCGGGTAGCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCgg < 1:1569025/149‑1 (MQ=255) 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attgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTAt > 2:425460/1‑149 (MQ=255) ttgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaatcacaaacactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccagcaaataaccgtcaagtca < 2:754479‑M2/149‑108 (MQ=255) ttgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATg < 2:1314174/149‑1 (MQ=255) tgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGa < 1:274083/149‑1 (MQ=255) gtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCTGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGAt > 2:85746/1‑149 (MQ=255) tgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccg < 1:808637‑M2/149‑111 (MQ=255) tgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGAtt > 1:457169/1‑149 (MQ=255) gattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgt < 1:1530481‑M2/149‑112 (MQ=255) ttAGCGcggtgcggatgtgcgccaacacgcccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcg < 2:1558867‑M1/149‑144 (MQ=255) ttAGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtca < 1:1171430‑M1/138‑133 (MQ=255) ttAGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtca > 2:1171430‑M1/1‑6 (MQ=255) ttAGCGATGCGGGTTTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGc < 1:35847/149‑1 (MQ=255) ttAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGc < 1:579274/149‑1 (MQ=255) tAGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcgg > 1:367347‑M1/1‑5 (MQ=255) tAGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcgg > 2:863420‑M1/1‑5 (MQ=255) aGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgctcaaccgttcgaagaagaagtctccccggcaaatcaccgtcatgtcagcgtcggt > 1:610543‑M1/1‑4 (MQ=255) aGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggt < 2:1511983‑M1/149‑146 (MQ=255) aGCGcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgaatgactcgcattctattgcacaaccgatcgaatcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggt < 2:92711‑M1/149‑146 (MQ=255) aGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGACTAAACTGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGt < 2:1127003/149‑1 (MQ=255) cGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGctaatcacaatcactatacctggagaatagcagttatgactcacacgcattctattgcacacccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggttagg < 2:979278‑M2/149‑118 (MQ=255) gcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggttat < 1:937407‑M1/149‑149 (MQ=255) gcggtgcggatgtgcgccaacacacccgcatcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggttat > 1:145871‑M1/1‑1 (MQ=255) | GAATACGGCTGTAATCCGGGTAGCGACTCGCATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAA > NC_000913/4579729‑4580025 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |