New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4579877 | 96 (1.060) | 5 (0.060) | 5/262 | NT | 4.9% | noncoding (43/77 nt) | symR | sRNA antisense regulator destabilizing divergent and overlapping symE mRNA |
? | NC_000913 | = 4579907 | 103 (1.190) | noncoding (73/77 nt) | symR | sRNA antisense regulator destabilizing divergent and overlapping symE mRNA | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
ATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAGGTGCGCC > NC_000913/4579760‑4580055 | aTAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGc < 1:937407‑M2/149‑2 (MQ=255) aCCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgct > 2:298305‑M2/1‑145 (MQ=255) aCCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGCTGTGCAATAGACTGCGGGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgct > 1:223498‑M2/1‑145 (MQ=255) aCCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGATTCGATCGGTTGTGCAATAGAATGCGAGTCATTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgct < 2:92711‑M2/149‑5 (MQ=255) aCCGACGCTGACATGACGGTGATTTGCCGGGGAGACTTCTTCTTCGAACGGTTGAGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgct > 1:610543‑M2/1‑145 (MQ=255) ccGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgcta > 2:863420‑M2/1‑144 (MQ=255) cGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGCGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaa < 2:1558867‑M2/149‑7 (MQ=255) aCGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAAt > 1:898914/1‑149 (MQ=255) tGACATGACGGTTCTTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTCTTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCt < 2:228462/149‑1 (MQ=255) gACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTg < 2:937407/149‑1 (MQ=255) aTGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGtat > 1:120088/1‑149 (MQ=255) tGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaa < 1:1171430‑M2/138‑7 (MQ=255) aCGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGATGGCGCACATCCGCACCGAGCTAAATACCTGtatata > 1:274986/1‑149 (MQ=255) ggTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATatc > 1:591766/1‑149 (MQ=255) ggTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATatc > 2:112133/1‑149 (MQ=255) ggTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATatc > 1:1477614/1‑149 (MQ=255) gTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATatca > 2:1458230/1‑149 (MQ=255) ttATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATatcat < 1:340660/149‑1 (MQ=255) tATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATatcatc < 1:1596152/149‑1 (MQ=255) cGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAat > 2:405769/1‑149 (MQ=255) cTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGt > 1:1555996/1‑149 (MQ=255) tGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTc < 1:449289/149‑1 (MQ=255) ttCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAg > 1:1582615/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAg > 2:1134924/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAg > 2:625321/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTCTCAGTCATAACTGCTATACTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCAAg > 1:35768/1‑149 (MQ=255) tCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGc < 2:1249237/149‑1 (MQ=255) gatgtgCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTTATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAAt < 1:281245/147‑1 (MQ=255) gTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATTGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAAt < 1:1155739/149‑1 (MQ=255) gtgCAATAGAATGCGTGTCAGTCTTAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGTTGCGGTTGTGTTTGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGa < 1:1502303/149‑1 (MQ=255) aaTAGAATGTGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATaa > 2:274083/1‑149 (MQ=255) aaTAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATaa > 2:653695/1‑149 (MQ=255) aaTAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATaa < 1:182834/149‑1 (MQ=255) tAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATaaaa > 1:1546182/1‑149 (MQ=255) gAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATACGCACCGCGCTAAATACCTGTATAAATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAAAAAAATg > 2:233520/1‑149 (MQ=255) gtgtCAGTCATAACTTCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAAt < 2:152819/149‑1 (MQ=255) cagtcaTAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCt < 1:1458230/149‑1 (MQ=255) cagtcaTAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCt < 1:642098/149‑1 (MQ=255) gtcaTAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCttg > 2:169657/1‑147 (MQ=255) gtcaTAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTgg > 2:467845/1‑149 (MQ=255) tcaTAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGa > 2:579274/1‑149 (MQ=255) tAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATg > 1:1314174/1‑149 (MQ=255) tAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATg > 1:1306989/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGa > 1:617558/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGa > 1:1366801/1‑149 (MQ=255) aCTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAt < 1:1551072/149‑1 (MQ=255) cTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATGTGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAtt < 2:591766/149‑1 (MQ=255) cTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAtt < 2:1477614/149‑1 (MQ=255) cTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAtt < 2:120088/149‑1 (MQ=255) tGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAttt > 1:1470514/1‑149 (MQ=255) tGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAttt > 2:969482/1‑149 (MQ=255) tGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAttt > 2:360728/1‑149 (MQ=255) tGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAttt > 2:677176/1‑149 (MQ=255) tGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGAttt > 2:85028/1‑149 (MQ=255) tATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCTTCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTaaa < 2:1190487/149‑1 (MQ=255) tATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTaaa < 1:625321/149‑1 (MQ=255) ttCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAata > 2:38174/1‑149 (MQ=255) ttCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAata > 2:1471228/1‑149 (MQ=255) ccAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCAACGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATAtt < 2:760058/149‑1 (MQ=255) ggAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTAt < 1:743114/149‑1 (MQ=255) aaTAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTAtgt < 1:504446/149‑1 (MQ=255) tAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTgg < 1:1134924/149‑1 (MQ=255) aGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTggg < 2:1575166/149‑1 (MQ=255) tgattgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGtt > 2:564327/1‑149 (MQ=255) tgattgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGtt < 1:537783/149‑1 (MQ=255) gattgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTa < 1:696306/149‑1 (MQ=255) gattgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTa < 1:677176/149‑1 (MQ=255) gattgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTa < 1:85028/149‑1 (MQ=255) attgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTAt > 2:425460/1‑149 (MQ=255) ttgtgattAGCGATGCGTGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATg < 1:279289/149‑1 (MQ=255) ttgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaatcacaaacactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccagcaaataaccgtcaagtca < 2:754479‑M2/149‑108 (MQ=255) ttgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGATAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATg < 1:1258283/149‑1 (MQ=255) tgtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGa < 1:274083/149‑1 (MQ=255) gtgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCTGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGAt > 2:85746/1‑149 (MQ=255) tgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccg < 1:808637‑M2/149‑111 (MQ=255) tgattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGAtt > 1:457169/1‑149 (MQ=255) gattAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgt < 1:1530481‑M2/149‑112 (MQ=255) ttAGCGATGCGGGTTTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGc < 1:35847/149‑1 (MQ=255) aGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGACTAAACTGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGt < 2:1127003/149‑1 (MQ=255) cGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGctaatcacaatcactatacctggagaatagcagttatgactcacacgcattctattgcacacccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggttagg < 2:979278‑M2/149‑118 (MQ=255) gggTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAattaat > 1:13246/1‑149 (MQ=255) gtgtgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAAtaataa > 2:854477/1‑149 (MQ=255) gtgtgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAAtaataa > 1:951290/1‑149 (MQ=255) tgtgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATaaa < 2:1306989/149‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTTGGTTATGATTGGAGTGAAATAATaaaa > 2:767366/1‑149 (MQ=255) tgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATaaaaa < 2:555174/149‑1 (MQ=255) tgtTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATaaaaa < 2:3747/149‑1 (MQ=255) ggCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAgcgc < 2:951290/149‑1 (MQ=255) gcgcACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCa > 2:1052898/1‑149 (MQ=255) gcACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCAcc > 1:521442/1‑149 (MQ=255) gcACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCAcc > 1:1493158/1‑149 (MQ=255) cacaTCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCg < 2:235113/149‑1 (MQ=255) tacGCACCGAGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGaaa < 1:1558867/147‑1 (MQ=255) tCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGaaa > 2:1371498/1‑149 (MQ=255) tCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGaaa > 2:1092637/1‑149 (MQ=255) ccGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACAGGAAAg > 1:26420/1‑149 (MQ=255) gCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGTGCAATTTCTGGAAAGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAGGt > 2:763440/1‑149 (MQ=255) gCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAGGt < 1:360728/149‑1 (MQ=255) gCAACGCGCTAAATAACTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAGGt < 2:1214459/149‑1 (MQ=255) gcgctaatcacaatcactattcctggagaatagcagttatgactgacacgcattctattgcacaaccgttcgaagcagaagtctccccggcaaataaccgtcatgtcaccgtcggttatgcgagtcgctacccggattacagccgtatt > 2:1530481‑M2/1‑1 (MQ=255) | ATAACCGACGGTGACATGACGGTTATTTGCCGGGGAGACTTCTGCTTCGAACGGTTGTGCAATAGAATGCGTGTCAGTCATAACTGCTATTCTCCAGGAATAGTGATTGTGATTAGCGATGCGGGTGTGTTGGCGCACATCCGCACCGCGCTAAATACCTGTATATATCATCAGTAAATATGGGGAAAGTCCAGCTAAAAATAGAATAAAATGGGCAATTTCTGGAATGATTTAAATATATTTATGTGGGTTATGATTGGCGTGAAATAATAAAAAGCGCACCGGAAAGGTGCGCC > NC_000913/4579760‑4580055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |