| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4594863 = | 106 (1.170) | 4 (0.050) | 4/262 | NT | 3.7% | intergenic (‑141/+74) | lgoT/lgoR | putative L‑galactonate:H+ symporter/putative transcriptional activator for L‑galactonate catabolism |
| ? | NC_000913 | 4594911 = | 107 (1.240) | intergenic (‑189/+26) | lgoT/lgoR | putative L‑galactonate:H+ symporter/putative transcriptional activator for L‑galactonate catabolism | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TTTTCCACGCCGGACTCCTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGG > NC_000913/4594715‑4595009 | ttctcagcgctctgatttgccgcagtgaccttgatgccacccttgcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactatta < 2:338804‑M1/1‑1 (MQ=255) tctcagcgctctgatttgccgcagtgaccttgttgccacccttgagctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAg > 1:348961‑M1/148‑149 (MQ=255) ctcagcgctctgatttgccgcagtgaccttgatgccacccttgcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGc > 2:953093‑M1/147‑149 (MQ=255) tcagcgctctgatttgccgcagtgaccttgatgccacccttgcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCg < 2:539888‑M1/4‑1 (MQ=255) tcagcgctctgatttgccgcagtgaccttgatgccacccttgcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCg < 2:1429629‑M1/4‑1 (MQ=255) tCCACGCCGGACTCCTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAATAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCg > 2:1132045/1‑149 (MQ=255) ccagcgctctgatttgcctcagagaccttgaagccacccaagcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaaagattccatccaataatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCg > 2:789534‑M1/146‑149 (MQ=255) cagcgctctgatttgccgcagtgaccttgatgccacccttgcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCgg > 1:1256188‑M1/145‑149 (MQ=255) cagcgctctgatttgccgcagtgaccttgatgccacccttgcgctccgtaaccatttgaattcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCgg > 1:39770‑M1/145‑149 (MQ=255) cACGCCGGACTCCTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCggg < 2:1412695/149‑1 (MQ=255) aCGCCGGACTCATGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACTCAAGGTTGACAATAACGGCAGGTTAAAGATTTAGGACTTTACTACATATAATATATACATTTTTATTCGAATGATTCTGAGCATAGGTAAGCGGGa > 2:1089874/1‑149 (MQ=255) cTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTa > 2:833946/1‑149 (MQ=255) cTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTa > 1:508800/1‑149 (MQ=255) cTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTCTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTa < 1:610061/149‑1 (MQ=255) tGTTTTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACCTTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCTTAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTAt < 1:633550/149‑1 (MQ=255) tATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAAATTCCCgcttacc < 1:220049/149‑7 (MQ=255) tataATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCt > 2:493361/1‑149 (MQ=255) tataATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCt > 1:107036/1‑149 (MQ=255) ataattataattGCTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACCGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCtt < 2:302190/149‑1 (MQ=255) ataATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTACCGGTATTTATCtt < 2:462753/149‑1 (MQ=255) ttttAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGATGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGGCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGa < 1:634620/149‑1 (MQ=255) aTTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATaaaa < 2:8371/149‑1 (MQ=255) aaTTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCg > 2:790029/1‑149 (MQ=255) 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catttgaattcagctaaacaatcaatgaatcgatccattaatgagaacacgcgttattctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCGGTAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg > 1:68815‑M1/93‑149 (MQ=255) aCGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg < 1:1415640/149‑1 (MQ=255) aCGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg > 1:496237/1‑149 (MQ=255) aCGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg < 2:562934/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCt > 1:539888/1‑149 (MQ=255) 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tGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGa > 2:579807/1‑149 (MQ=255) gATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGaa < 2:803270/149‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGaa < 2:1351371/149‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGaa < 2:294676/149‑1 (MQ=255) gATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGaa < 2:1384560/149‑1 (MQ=255) aTTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAAt > 2:1345819/1‑149 (MQ=255) tgtgAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTc < 1:1029890/149‑1 (MQ=255) tgAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaa > 2:1367699/1‑149 (MQ=255) gAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTATTAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCaaa < 2:171115/149‑1 (MQ=255) cATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCGCCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGTATTCAAATgg > 1:161464/1‑149 (MQ=255) aGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa < 2:510002/149‑1 (MQ=255) aGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTa < 2:107036/149‑1 (MQ=255) | TTTTCCACGCCGGACTCCTGTATTTATAATTTTAATTGTTTACGTAATTGTGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGG > NC_000913/4594715‑4595009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |