| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4594863 = | 106 (1.170) | 4 (0.050) | 4/262 | NT | 3.7% | intergenic (‑141/+74) | lgoT/lgoR | putative L‑galactonate:H+ symporter/putative transcriptional activator for L‑galactonate catabolism |
| ? | NC_000913 | 4594911 = | 107 (1.240) | intergenic (‑189/+26) | lgoT/lgoR | putative L‑galactonate:H+ symporter/putative transcriptional activator for L‑galactonate catabolism | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAA > NC_000913/4594765‑4595058 | tgCATTACGAAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCACGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTaaa > 1:803270/1‑148 (MQ=255) aTTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAATGGTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAATACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTGATCTTTTGATATAACCGTGCACCCGCTAATAGt > 1:99434/1‑149 (MQ=255) aTTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGt > 1:338804/1‑149 (MQ=255) tACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGttt < 2:144885/149‑1 (MQ=255) catttgaattcagctaaacaatcaatgaatcgatccattaatgagaacacgcgttattctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCGGTAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg > 1:68815‑M1/93‑149 (MQ=255) aCGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg > 1:496237/1‑149 (MQ=255) aCGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTg < 1:1415640/149‑1 (MQ=255) aaGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGt > 2:293482/1‑149 (MQ=255) gTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGtttt < 2:686830/149‑1 (MQ=255) gTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGtttt > 1:1351371/1‑149 (MQ=255) ttcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTaa > 1:364528‑M1/85‑134 (MQ=255) ttcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTaa < 2:364528‑M1/50‑1 (MQ=255) ttcagctaaacaatcaatgattcgatccattaatgagaacacgcgttatgctcattaagtacggattaaaaacagcaaactattAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGttttt > 2:582351‑M1/85‑149 (MQ=255) gACATTACCGGCAGGGTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGTGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAATCCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTaa < 1:1118548/149‑1 (MQ=255) aCATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTATTAGTTTGCTGTTTTTAAt > 1:171115/1‑149 (MQ=255) aTTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTTCTGTTTTTAATcc > 2:926980/1‑149 (MQ=255) aTTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATcc > 2:1144260/1‑149 (MQ=255) aTTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATcc > 1:544754/1‑149 (MQ=255) 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gTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGa < 1:161982/149‑1 (MQ=255) ttAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAg > 1:680134/1‑149 (MQ=255) tAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGc < 1:1517191/149‑1 (MQ=255) tAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGc < 1:1364411/149‑1 (MQ=255) aaaGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCa > 1:1290315/1‑149 (MQ=255) 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ctAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCTCAAGGGTGGCAACAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTgaga > 1:348961‑M2/3‑149 (MQ=255) tAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGaa < 2:338804‑M2/148‑1 (MQ=255) | TGCATTACGCAAGGTTGACATTAACGGCAGGTTAAAGTTTTAGGACTTTACTACCGCTCACAAAAACATTTTTAGTCGACTGATTGTGAGCATAGGTAAGCGGGAATTTCCCGGTATTTATCTTTTGATAAAACCGTGCACCCGCTAATAGTTTGCTGTTTTTAATCCGTACTTAATGAGCATAACGCGTGTTCTCATTAATGGATCGAATCATTGATTGTTTAGCTGAATTCAAATGGTTACGGAGCGCAAGGGTGGCATCAAGGTCACTGCGGCAAATCAGAGCGCTGAGAA > NC_000913/4594765‑4595058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |