| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 752867 = | 100 (1.010) | 8 (0.090) | 6/256 | NT | 8.5% | intergenic (‑72/+318) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| ? | NC_000913 | 752916 = | 80 (0.880) | intergenic (‑121/+269) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
ACTTTCAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/753026‑752867‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcaaaactaaaTTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT > NC_000913/752916‑753064 ACTTTCAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAG < 1:1283922/150‑1ACTTTCAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAG < 2:1401588/150‑1 TTTCAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCTTTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCGTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCA < 2:1631146/150‑1 TTCAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAAAAATATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACATTATTTTTAAGCAA < 1:1140376/150‑1 CAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTAAAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTATATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGATTAGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAA > 1:29902/1‑150 AATTAAAAACTTCATTGTAGTCGCATTTATAAACCTATGAAAATGACTTCTATCTATACACCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAAC < 1:205104/150‑1 AATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAAC < 2:214404/150‑1 ATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACT > 2:1216447/1‑150 TTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTA < 1:1008472/150‑1 TAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAA > 2:129397/1‑150 TAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAA > 1:1704032/1‑150 TTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGA > 2:1281733/1‑150 TTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTATTAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGA > 2:635260/1‑150 ACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATG > 2:1463712/1‑150 CCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGA > 2:884450/1‑150 ATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTT > 2:1088881/1‑150 ATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTAAAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTAGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCAATTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTT > 2:411912/1‑150 ACTATCAATATTTTTTAGCATATCTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTTTAGATAGACGTCATTTTCATTGGGTTATAAATGCGACTACCATGATGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCT < 1:411912/150‑1 AACAATATTTTTAAGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGAT < 1:1463712/150‑1 GCAAAAGTAAATTTTTGGGATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAATATATAGGGGTGTATAGATAGACGTCATTTTGATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTTATGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTC < 2:474565/150‑1 GCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTC < 2:271634/150‑1 CAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGTGGGGTATAGATAGACTTCATTTTCATAGGGTTATAAATTCGACTAACATGAAGTTTTTAATTTAAAGTATTGGTTTGATGATAATTTTAGATGTTat > 1:317157/1‑148 CAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCT > 1:1374538/1‑150 AAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTA > 2:1200765/1‑150 AAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTA < 1:349902/150‑1 AAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTAT > 1:38367/1‑150 ACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTC < 2:38367/150‑1 TAAATTATTGGTTTCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATGAATGCGACAACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGAGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTT < 2:776647/150‑1 AAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTT > 2:1270834/1‑150 AAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGCATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTT < 2:827742/150‑1 ATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATTAAATATAGGGGTGTTTAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTTTAAATGAGACTACCATTAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT < 1:1500125/150‑1 ATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT < 2:1435006/150‑1 ATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT < 1:1268543/150‑1 ATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT < 2:429440/150‑1 ATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTAATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTTCCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATATTTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT < 1:1203896/150‑1 ACTTTCAATTAAAAACTTCATGGTAGTCGCATTTATAACCCTATGAAAATGACGTCTATCTATACCCCCCTATATTTTATTCATCATACAACAAATTCATGATACCAATAATTTAGTTTTGCATTTAATAAAACTAACAATATTTTTAAGCAAAACTAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/753026‑752867‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcaaaactaaaTTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTTTTTAATTGAAAGTATTGGGTTGCTGATAATTTGAGCTGTTCTATTCTTTTT > NC_000913/752916‑753064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |