| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 752867 = | 100 (1.010) | 8 (0.090) | 6/256 | NT | 8.5% | intergenic (‑72/+318) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase |
| ? | NC_000913 | 752916 = | 80 (0.880) | intergenic (‑121/+269) | ybgD/gltA | putative fimbrial‑like adhesin protein/citrate synthase | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTT > NC_000913/752718‑753013 | aaaaagaatagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataat < 1:1268543‑M1/1‑1 (MQ=255)aaaaagaatagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataat < 2:1435006‑M1/1‑1 (MQ=255)aaaaagaatagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttaatggtagtctcatttaaaaccctatgaaaatgacgtctatctaaacacccctatatttaattcatcatacaacaaattcatgataccaataat < 1:1500125‑M1/1‑1 (MQ=255)aaaaagaatagaacagctcaaaatatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggaagtcgcatttataaccctatgaaaattacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataat < 1:1203896‑M1/1‑1 (MQ=255) cttcaGCAGCATAAACTGGTGCAGTGAACAGCATAGATTCGGCCATTGCGGCCATTGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGATTTGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagttttt < 1:737222/148‑1 (MQ=255) aaagaatagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatgcccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataattt < 2:827742‑M1/3‑1 (MQ=255) aaagaatagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataattt > 2:1270834‑M1/148‑150 (MQ=255) aagaatagaacagctcaaattatcagcaactcaatactttcaattaaaaacttcatggttgtcgcattcataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgaaaccaataaTTTa < 2:776647‑M1/4‑1 (MQ=255) gaatagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataaTTTAGt < 2:38367‑M1/6‑1 (MQ=255) agcagcATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttagtt > 1:833365/1‑150 (MQ=255) tagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataaTTTAGtttt < 1:349902‑M1/9‑1 (MQ=255) tagaacagctcaaattatcagcaacccaatactttcaattaaaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataaTTTAGtttt > 2:1200765‑M1/142‑150 (MQ=255) cagcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCtagtttttagtttt > 2:479150/1‑150 (MQ=255) gcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCTATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGc > 1:1587149/1‑150 (MQ=255) gcaTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGc > 2:1488413/1‑150 (MQ=255) caTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCt < 1:1362206/150‑1 (MQ=255) caTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCt < 1:1280504/150‑1 (MQ=255) caTAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCt < 2:537412/150‑1 (MQ=255) tAAACAGGTGGAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTa < 1:895309/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTaaa < 2:900315/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGAACATCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAata < 1:1312289/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAata < 1:565450/150‑1 (MQ=255) gTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAatat < 2:1029669/150‑1 (MQ=255) 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cagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTttatt < 2:217714/150‑1 (MQ=255) cagAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTttatt > 1:776647/1‑150 (MQ=255) agagATAAGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCATTTAAGGATATAGAATAGGTGTATAGCTACGCCATAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTttatta < 1:102258/150‑1 (MQ=255) gagaTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTaa > 1:1429929/1‑150 (MQ=255) gagaTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAATTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTaa < 2:1333657/150‑1 (MQ=255) aTACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATATGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTCTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATg < 1:1591261/150‑1 (MQ=255) tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGc < 2:736090/150‑1 (MQ=255) tACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAG‑TTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCa < 2:772511/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCaaa < 2:56252/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCaaaa > 1:1216520/1‑150 (MQ=255) 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aaaacttcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataaTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAat > 2:1088881‑M1/101‑150 (MQ=255) tcatggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataaTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTgg > 2:884450‑M1/95‑150 (MQ=255) catggtagtcgcatttataaccctatgaaaatgacgtctatctatacccccctatattttattcatcatacaacaaattcatgataccaataaTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGt > 2:1463712‑M1/94‑150 (MQ=255) tttttGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGTGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCa < 1:907394/150‑1 (MQ=255) tttttGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCa > 1:1624004/1‑150 (MQ=255) 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cAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAgg < 2:321218/150‑1 (MQ=255) tCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATaa < 2:1660352/150‑1 (MQ=255) aTTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGc < 1:941953/150‑1 (MQ=255) tttGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCg < 1:1419086/150‑1 (MQ=255) tGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGAc > 1:1247433/1‑150 (MQ=255) tGATTATTGCTAGTATTTAGTTTTGCTTAAAAAAATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGTGGGGTATAGATATACGTCATATTCATAGGGTTATAAATgataa > 1:1477931/1‑146 (MQ=255) gATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACt < 2:439224/150‑1 (MQ=255) tattGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTAcc > 2:1547649/1‑150 (MQ=255) tattGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTAcc < 2:1269035/150‑1 (MQ=255) agtttttagttttGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGTTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGt < 2:833365/150‑1 (MQ=255) gtttttagttttGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGTGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGtt > 1:1519158/1‑150 (MQ=255) | TTCATCAGCAGCATAAACAGGTGCAGTGAACAGCAGAGATACGGCCAGTGCGGCCAATGTTTTTTGTCCTTTAAACATAACAGAGTCCTTTAAGGATATAGAATAGGGGTATAGCTACGCCAGAATATCGTATTTGATTATTGCTAGTTTTTAGTTTTGCTTAAAAATATTGTTAGTTTTATTAAATGCAAAACTAAATTATTGGTATCATGAATTTGTTGTATGATGAATAAAATATAGGGGGGTATAGATAGACGTCATTTTCATAGGGTTATAAATGCGACTACCATGAAGTT > NC_000913/752718‑753013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |