| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 799594 = | 135 (0.830) | 7 (0.050) | 4/260 | NT | 5.5% | intergenic (+13/+28) | pgl/ybhD | 6‑phosphogluconolactonase/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | 799618 = | 113 (0.740) | intergenic (+37/+4) | pgl/ybhD | 6‑phosphogluconolactonase/putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
AGTATCTGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTA > NC_000913/799445‑799743 | aataatacgccgtaaagatgccgtactttctccagcagcagaacgcttatttgccttgctgattaatatatcgactgacgataaagacaaattgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacacccgttacaggagataggataatacac > 2:1668772‑M1/150‑150 (MQ=255) tATCTGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCg < 1:1080863/150‑1 (MQ=255) tATCTGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCg < 2:2011588/150‑1 (MQ=255) aTCTGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCgg > 2:1243665/1‑150 (MQ=255) tCTGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGgc < 2:1329064/150‑1 (MQ=255) ttcgccgtaaagatgccgtactttctccagcagcagaacgcttttttgccttgctgattaatttatggactgacgataaagacaatttgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacacgcgttacaggagataggttaatacaCCGgcg < 2:1069499‑M1/6‑1 (MQ=255) tGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGgcgc > 1:1964119/1‑150 (MQ=255) gATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCa < 1:2021317/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCa < 1:1668950/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCa > 2:2657844/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGt < 2:2594533/150‑1 (MQ=255) cgccgGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAACTTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGtctct < 2:1892794/150‑1 (MQ=255) gccgGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGtctctc > 1:2628283/1‑150 (MQ=255) cgGGCAAAAATCTCACCAACACTCGGTATACGAAATTTTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACTCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCt < 2:1332345/150‑1 (MQ=255) gCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTgcg > 1:2541352/1‑150 (MQ=255) gCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTgcg > 2:604420/1‑150 (MQ=255) cAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTgcgc > 1:2403554/1‑150 (MQ=255) gtactttctccagcagcagaacgcttttttgccttgctgattaatttatggactgacgataaagacaatttgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacacgcgttacaggagataggttaatacaCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCg > 2:1976552‑M1/128‑150 (MQ=255) 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aCGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCaaaaaa < 2:919635/150‑1 (MQ=255) cacTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTATCGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCAAAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGtt < 1:1538678/150‑1 (MQ=255) ccGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTctgctg > 2:2209785/1‑150 (MQ=255) cGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTctgctgc < 2:2584682/150‑1 (MQ=255) gCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTctgctgct > 1:706771/1‑150 (MQ=255) gCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTctgctgct > 2:1689911/1‑150 (MQ=255) gCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTctgctgct > 1:1577156/1‑150 (MQ=255) tGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTgg < 1:731187/150‑1 (MQ=255) tGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCAGTTTTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTATCTGGCGTTCGACTATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTgg < 1:138688/150‑1 (MQ=255) gATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGga < 1:2413195/150‑1 (MQ=255) 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CCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTa < 1:468531‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCAGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTa < 1:1351145‑M1/150‑1 (MQ=255) | AGTATCTGATTGCCGCCGGGCAAAAATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTA > NC_000913/799445‑799743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |