| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 799594 = | 135 (0.830) | 7 (0.050) | 4/260 | NT | 5.5% | intergenic (+13/+28) | pgl/ybhD | 6‑phosphogluconolactonase/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | 799618 = | 113 (0.740) | intergenic (+37/+4) | pgl/ybhD | 6‑phosphogluconolactonase/putative DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
AATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTACGGCGAATTATTC > NC_000913/799469‑799767 | actttctccagcagcagaacgcttttttgccttgctgattaatttatggactgacgataaagacaatttgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacacgcgttacaggagataggttaatacaCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGgt > 1:2202082‑M1/126‑150 (MQ=255)actttctccagcagcagaacgcttttttgccttgctgattaatttatggactgacgataaagacaatttgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacacgcgttacaggagataggttaatacaCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGgt > 1:1545347‑M1/126‑150 (MQ=255)aaTCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGgt < 1:2694979/150‑1 (MQ=255) ctcACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTa < 1:1955988/150‑1 (MQ=255) ctcACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTa > 2:1466939/1‑150 (MQ=255) ccacATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTaa > 1:2228333/1‑150 (MQ=255) cacaTCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAAc < 2:1222442/150‑1 (MQ=255) caTCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCt < 1:126213/150‑1 (MQ=255) tctcGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTAt > 2:1350732/1‑150 (MQ=255) cGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTAtctc < 2:2517745/150‑1 (MQ=255) gggataCGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTcc < 2:2129647/147‑1 (MQ=255) accgcttttttgcgttgcttattaatttatggacgtacgataaagacattttgtggaccaatatcgtcgaacgccagtgacacgcgttacaggagttaggttaatacaCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTTTATTAACCTATCTCCt > 1:2608580‑M1/109‑150 (MQ=255) tataCGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTg > 2:1335876/1‑150 (MQ=255) taaaagAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACAGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGAGGGAGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATATACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAAACTATCTCCTg > 2:613478/6‑150 (MQ=255) gAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAAcg > 2:1789129/1‑150 (MQ=255) gAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAAcg > 2:1164415/1‑150 (MQ=255) aaaTTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAAcgc < 2:1638590/150‑1 (MQ=255) aaaTTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAAcgc > 1:137941/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAAcgcg > 1:2241273/1‑150 (MQ=255) tgttgGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCgtgt < 2:2684965/150‑1 (MQ=255) tgttgGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCgtgt < 2:2030792/150‑1 (MQ=255) tgctgattaatttatggactgacgataaagacaatttgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacacgcgttacaggagataggttaatacaCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTctct > 2:1717296‑M1/94‑150 (MQ=255) ggctgattaatttatggactgccgataaagacaatttgtggaccaatatcgtcgaacgccagagacccgcgttacaggagataggttaatacaCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTctct > 2:1717448‑M1/94‑150 (MQ=255) 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cccGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAATCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGt > 2:2405118/1‑150 (MQ=255) accggcgcaggagagactgcgccggTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGt > 1:2420914‑M2/26‑150 (MQ=255) accggcgcaggagagactgcgccggTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGt > 1:2202082‑M2/26‑150 (MQ=255) CCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTa < 1:1770192‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTa < 1:468531‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCAGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTa < 1:1351145‑M1/150‑1 (MQ=255) cggcgcaggagagactgcgccggTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTAc > 2:1976552‑M2/24‑150 (MQ=255) CGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTAc < 2:887554‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACg > 1:971216‑M1/1‑150 (MQ=255) tctcCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTa > 1:2269717/1‑150 (MQ=255) tctcCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTa > 1:363515/1‑150 (MQ=255) tctcCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTa > 1:2665378/1‑150 (MQ=255) ctcCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTAc < 2:1492160/150‑1 (MQ=255) tcCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTACg > 2:207190/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTACgg < 1:2313073/150‑1 (MQ=255) gTGTATTATCCTATCTCCTGTAACGGGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAATTTGTCTTTATCGTCAGTCGATATATTAATCAGCAAGGCAAATAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTACGGCGTattatt > 2:1668772‑M2/2‑150 (MQ=255) tgtATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTACGGCGAATTATTc < 2:1540758/150‑1 (MQ=255) | AATCTCACCACATCTCGGTATACGAAATTGTTGGCGAGCAGGGGCTACTGCATGAAAAAGGCCGCTATGCGGTCGGGCAGGGACCAATGTGGGTGGTGGTTAACGCACACTAACCGCTGATTTACCCGGCGCAGTCTCTCCTGCGCCGGTGTATTAACCTATCTCCTGTAACGCGTGTCTCTGGCGTTCGACGATATTGGTCCACAAATTGTCTTTATCGTCAGTCCATAAATTAATCAGCAAGGCAAAAAAGCGTTCTGCTGCTGGAGAAAGTACGGCATCTTTACGGCGAATTATTC > NC_000913/799469‑799767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |