New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4412348 = | 213 (1.970) | coding (370/399 nt) | yjfL | conserved inner membrane protein YjfL |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
TCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACC > NC_000913/4412178‑4412475 | tcaatGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGaa > 2:1758427/1‑150 (MQ=255) tgcgtagcgattgcggcacggttcaaaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatAcc < 2:884863‑M1/3‑1 (MQ=255) gCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAAccgcc > 1:1389217/1‑150 (MQ=255) 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cAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCg > 2:1587163/1‑150 (MQ=255) ggttcaaaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTa > 1:491242‑M1/129‑150 (MQ=255) cTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAt > 1:1300538/1‑150 (MQ=255) tATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAtt > 1:914446/1‑150 (MQ=255) tATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAtt > 1:1976244/1‑150 (MQ=255) 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gcagGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCg > 1:669569/1‑150 (MQ=255) gcagGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCg > 2:1463279/1‑150 (MQ=255) cagGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGa > 1:1751579/1‑150 (MQ=255) ggAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAATAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTATTCGCATTGGTAGACCGaat < 2:271311/150‑1 (MQ=255) ggAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGaat > 1:831753/1‑150 (MQ=255) ggAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGaat > 2:1235509/1‑150 (MQ=255) ggAATGTTTATGGGAACCGCCGAGCTGTCTGGCGGTATTTTTAACGCAGTTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGTCCAGAAAACTCAAATCAAGAAATAAAAGTAAAATTGGTCAAGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGAACGaat > 2:51375/1‑150 (MQ=255) aTGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGaataat < 1:698913/150‑1 (MQ=255) gTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGAcc < 1:1414208/141‑1 (MQ=255) tttATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACCCAGCTTGTATGACATCGTAATGCACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCt > 2:13089/1‑150 (MQ=255) aTGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt > 1:239919/1‑150 (MQ=255) aTGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt < 2:610948/150‑1 (MQ=255) tcggAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTGTTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGACCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTg < 2:668091/148‑1 (MQ=255) tGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTg < 2:730512/150‑1 (MQ=255) ggAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGaa > 1:1452230/1‑150 (MQ=255) | TCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACC > NC_000913/4412178‑4412475 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |