New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4412348 = | 213 (1.970) | coding (370/399 nt) | yjfL | conserved inner membrane protein YjfL |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
ACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCA > NC_000913/4412199‑4412494 | cTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAt < 2:102121/150‑1 (MQ=255) caaaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAtttt < 1:1123456‑M1/26‑1 (MQ=255) ttCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAttttt < 1:1718086/150‑1 (MQ=255) aaaaggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTAttttt > 1:504377‑M1/124‑150 (MQ=255) tCGCCTGGCGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTa > 2:1881005/1‑150 (MQ=255) aggattattcggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAAc > 1:1899117‑M1/121‑150 (MQ=255) tgattatttggtctaagaatgcaactaatcgcttcgtgaccaattttactgttatttattgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACg > 2:861213‑M1/120‑150 (MQ=255) ccTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACg < 1:1154958/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACg > 2:1786729/1‑150 (MQ=255) ggggCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAg < 2:1389217/150‑1 (MQ=255) cggtctaccaatgcgactaatcgctccgtgaccaattttactgttatttcttgatttgcgttttctggccatgatcgtccattaccatgtcatacaagctgcgttaaaaatACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGt > 2:1123456‑M1/112‑150 (MQ=255) gCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACa > 2:992727/1‑150 (MQ=255) gCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACa > 1:911373/1‑150 (MQ=255) 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ggAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGaat < 2:1850857/150‑1 (MQ=255) ggAATGTTTATGGGAACCGCCGAGCTGTCTGGCGGTATTTTTAACGCAGTTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGTCCAGAAAACTCAAATCAAGAAATAAAAGTAAAATTGGTCAAGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGAACGaat > 2:51375/1‑150 (MQ=255) aTGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGaataat < 1:698913/150‑1 (MQ=255) gTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATcc > 2:715583/1‑150 (MQ=255) cgttaaaaataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATcc > 2:894949‑M2/32‑150 (MQ=255) tttATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACCCAGCTTGTATGACATCGTAATGCACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCt > 2:13089/1‑150 (MQ=255) taaaaataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCttt > 1:355685‑M2/29‑150 (MQ=255) aaaaataccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt > 1:1080433‑M2/28‑150 (MQ=255) aTGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt > 1:239919/1‑150 (MQ=255) aTGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCtttt > 1:147124/1‑150 (MQ=255) tgtgAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGTCGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTg < 1:139187/147‑1 (MQ=255) ggAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGaa > 2:804008/1‑150 (MQ=255) taccgccagccagcgcggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAAcc > 1:491242‑M2/23‑150 (MQ=255) aaCCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAAcc < 1:1565175/150‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACAGAATAATCCTTTTGAAcc > 2:446014/1‑150 (MQ=255) CCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGt > 1:1574257‑M1/1‑125 (MQ=255) CCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGt < 1:1981876‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGc < 2:825508‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACgg < 1:423185‑M1/103‑1 (MQ=255) CGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGt > 1:137281‑M1/1‑121 (MQ=255) cgcTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCa < 2:138694/150‑1 (MQ=255) ggctggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCg < 2:669569/150‑1 (MQ=255) ggctggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCg > 1:1593300/1‑150 (MQ=255) gctggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGc < 2:111137/150‑1 (MQ=255) tggcGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTa < 1:783616/150‑1 (MQ=255) ggcggtATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTAc > 2:1709025‑M2/7‑150 (MQ=255) | ACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCTGGTGTCAGACTTTATATGCCCGCATTAAGCGAAAAAATTATTAATCACAATACCGCAGCAGGAATGTTTATGGGAACCGCCGCGCTGGCTGGCGGTATTTTTAACGCAGCTTGTATGACATGGTAATGGACGATCATGGCCAGAAAACGCAAATCAAGAAATAACAGTAAAATTGGTCACGGAGCGATTAGTCGCATTGGTAGACCGAATAATCCTTTTGAACCGTGCCGCAATCGCTACGCA > NC_000913/4412199‑4412494 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |