New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | = 3298748 | 110 (0.810) | coding (99/636 nt) | yraR | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GCTGCGCGCCCAGTCGCCGCCCGGTTAATGCGGTATCCACTACCAGCGTGTAATCGGCATGAATAAACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGT > NC_000913/3298534‑3298828 | gctgcGCGCCCAGTCGCCGCCCGGTTAATGCGGTATCCACTACCAGCGTGTAATCGGCATGAATAAACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAAcg > 1:996600/1‑150 (MQ=255) gctgcGCGCCCAGTCGCCGCCCGGTTAATGCGGTATCCACTACCAGCGTGTAATCGGCATGAATAAACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAAcg > 2:729975/1‑150 (MQ=255) gctgcGCGCCCAGTCGCCGCCCGGTTAATGCGGTATCCACTACCAGCGTGTAATCGGCATGAATAAACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAAcg > 2:72730/1‑150 (MQ=255) 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ccTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCggcgcaggtcaccgatcccatcgacattgtgttttgttgtctcggcaccacgcggcgagaagcggggagcaaa < 1:221743‑M2/150‑74 (MQ=255) ccTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTg > 1:2226080/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTg > 1:917834/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGGCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCTTTg < 2:2328983/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCgacgcgacgtccgttgggcgatatgcccggggtgtttaatccccatgatccgcaactgagtgacgcgttggcgcaggtcaccgatcccatcgacattgtgttttgttgtctcggcaccacgcggcgagaagcggggagcaaag > 1:51403‑M1/1‑7 (MQ=255) cTGCGCCgacgcgacgtccgttgggcgatatgcccggggtgtttaatccccatgatccgcaactgagtgacgcgttggcgcaggtcaccgatcccatcgacattgtgttttgttgtctcggcaccacgcggcgagaagcggggagcaaag > 2:1613879‑M1/1‑7 (MQ=255) cTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCggcgcaggtcaccgatcccatcgacattgtgttttgttgtctcggcaccacgcggcgagaagcggggagcaaag < 2:1261758‑M2/150‑75 (MQ=255) tGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTgcg > 2:356413/1‑150 (MQ=255) tGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTgcg < 1:366670/150‑1 (MQ=255) gcgcCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTgcgc < 1:1704363/150‑1 (MQ=255) cgcCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGcc < 1:1875858/150‑1 (MQ=255) ccAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCAGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTg < 1:1474627/150‑1 (MQ=255) | GCTGCGCGCCCAGTCGCCGCCCGGTTAATGCGGTATCCACTACCAGCGTGTAATCGGCATGAATAAACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGT > NC_000913/3298534‑3298828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |