| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3298679 | 117 (0.820) | 6 (0.040) | 4/262 | NT | 5.1% | coding (168/636 nt) | yraR | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase |
| ? | NC_000913 | = 3298748 | 110 (0.810) | coding (99/636 nt) | yraR | putative nucleoside‑diphosphate‑sugar epimerase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
AACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACC > NC_000913/3298599‑3298896 | aaCGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGAcgtcgcgtc > 2:2010590/1‑150 (MQ=255) ctctTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCggcgc > 1:1925290‑M2/1‑145 (MQ=255) ctTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCggcgcag > 1:51403‑M2/1‑143 (MQ=255) ttcgCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCgcagc < 1:1312856/147‑1 (MQ=255) ttGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCgcagca > 2:963123/1‑150 (MQ=255) tgatCCCCTCTTCTAGCCGAGTCGTGCCGAAACAACAAAAAAAAATTTCGATCCGATAGGTGACATACACCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCaa > 2:1947600/4‑150 (MQ=255) cTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACCCCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATg > 2:1737933/1‑150 (MQ=255) cTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATg > 1:359635/1‑150 (MQ=255) cTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATg > 2:754580/1‑150 (MQ=255) tCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATgg > 2:629793/1‑150 (MQ=255) ccccGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGc < 2:100324/150‑1 (MQ=255) cccGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCg < 2:1538300/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCg < 2:1093473/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCACAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGtt < 2:1621208/150‑1 (MQ=255) cgccgcGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTc < 1:729975/150‑1 (MQ=255) cgccgcGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTc < 2:1253664/150‑1 (MQ=255) ccgcGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCgg > 1:1744448/1‑150 (MQ=255) cgcgTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGt > 1:414120/1‑150 (MQ=255) 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gagaCAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACGCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCaa < 2:2245083/150‑1 (MQ=255) agaCAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAAc < 2:1116389/150‑1 (MQ=255) gaCAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACa < 1:800453/150‑1 (MQ=255) acaaAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCg > 1:836955/1‑150 (MQ=255) acaaAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCg > 1:550926/1‑150 (MQ=255) caaAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCgc > 2:266305/1‑150 (MQ=255) aaaCACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCgcag > 2:1129026/1‑150 (MQ=255) caATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGt < 2:674472/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTGAGTTGAGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCggcgcaggtcaccgatcccatcgacattgtgttttgttgtctcggcaccacgcggc < 1:1383103‑M2/150‑57 (MQ=255) aTGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGccc < 1:573541/150‑1 (MQ=255) 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ccccGGGCATATAGACCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCATGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAAtt > 2:101270/1‑150 (MQ=255) ccagggCATATCGAACAACGGACGTCGCGTAGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTg > 2:198607/4‑150 (MQ=255) ggCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTg > 2:1310565/1‑150 (MQ=255) gCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGc < 2:2226080/150‑1 (MQ=255) atatCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCt > 1:2392413/1‑150 (MQ=255) atCGCCCAAGGGACGTCGCGTAGGCGCAGCAATGGCTTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGTTGACCGCCCACCAGCCCCTTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTg < 2:951310/150‑1 (MQ=255) atCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTg > 2:289026/1‑150 (MQ=255) tCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTgc < 2:1255620/150‑1 (MQ=255) gCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCATTTACACAATTGTCTGCCTTgcgc > 1:656319/1‑150 (MQ=255) cGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACg > 1:337138/1‑150 (MQ=255) 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cgtcgGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCa > 1:266846/1‑150 (MQ=255) tcgGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCAcc < 2:2312050/150‑1 (MQ=255) | AACGCCTCTTTGCTCCCCGCTTCTCGCCGCGTGGTGCCGAGACAACAAAACACAATGTCGATGGGATCGGTGACCTGCGCCAACGCGTCACTCAGTTGCGGATCATGGGGATTAAACACCCCGGGCATATCGCCCAACGGACGTCGCGTCGGCGCAGCAATGGCGTTAACTTTCGGTTCGTTAATCAACATCCGCAGCAGGTGACCGCCCACCAGCCCCGTTGCGCCTGTAATCAGTACCTGACTCATCTTCGCTCCTTTACAGAATTGTCTGCCTTGCGCTCCACGGCTCATGCACC > NC_000913/3298599‑3298896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |