New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3726897 | 36 (0.790) | 3 (0.070) | 3/242 | NT | 8.1% | intergenic (+15/+27) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase WecH/conserved inner membrane protein YiaA |
? | NC_000913 | = 3726905 | 35 (0.830) | intergenic (+23/+19) | wecH/yiaA | O‑acetyltransferase WecH/conserved inner membrane protein YiaA |
CCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCAGTC > NC_000913/3726756‑3727039 | ccGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTcac > 2:558817/1‑143 (MQ=255) ggggAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACAt > 1:190671/1‑143 (MQ=255) ggggAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAAACGATTAGTGTGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACAt > 1:644508/1‑143 (MQ=255) gggAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAACAGCCCGGTCACAtt > 1:222786/1‑143 (MQ=255) aaTTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGa < 1:585356/143‑1 (MQ=255) ttGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAATAAAAGCCCGGTCACATTGGACt < 2:732574‑M2/143‑2 (MQ=255) cTTAAACATTGGCCAATACTGGATATTAGTTGGATCTTTGGCGCGCCGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCCATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACtgaccg > 2:418556‑M2/1‑137 (MQ=255) cTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCGATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACtgaccg > 2:71583‑M2/1‑137 (MQ=255) ttAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACtgaccgg < 1:661306‑M2/143‑8 (MQ=255) aaaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCCTGTGCGCGACGTTTGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCAgtccaatgtgaccgggctt < 1:335438‑M1/143‑20 (MQ=255) aaTTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTa > 1:150367/1‑143 (MQ=255) tGGCCAACACTGGATATTATTTGGATCGTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAGCGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGt < 1:54805/143‑1 (MQ=255) cTGGAGATTATTTGGCTTTGTTGCGCGTCGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAATATCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTc < 2:97736/143‑1 (MQ=255) ggATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGc > 1:496420/1‑143 (MQ=255) atatTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGTGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCAgtccaatgtgaccgggcttttacttaactcactaat < 1:731885‑M1/143‑37 (MQ=255) attattTGGATCTGTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCAgtccaatgtgaccgggcttttacttaactcactaatct < 1:304317‑M1/143‑39 (MQ=255) attTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTAttc > 1:716007/1‑143 (MQ=255) ggATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTcc > 1:499306/1‑143 (MQ=255) tCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTgg > 1:210857/1‑143 (MQ=255) tCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTgg > 1:734012/1‑143 (MQ=255) cgACGTTGGCAGCGAGTTTATTACTGTCTATGCTGGTACAACGAAGCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGAACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTCCATTCTTCGTGAGTGACgtgt > 2:238742/1‑143 (MQ=255) gACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCtgtg > 1:694552/1‑143 (MQ=255) cAGCGAGTTTGTTACTTGCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCtttt < 2:866262/143‑1 (MQ=255) aGCGGGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTCAGTAAAAGCCCGGTCTCATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTtg < 2:448938/143‑1 (MQ=255) aGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATGCGCTGTACTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTtg > 2:630760/1‑143 (MQ=255) cGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTtggt < 2:661306/143‑1 (MQ=255) aGTGTGTTAGTTTCTGTGCTGGGACAACGACTCGACAGAAACAGATTAGTGGGTTAAGTAAACGCCCTGTCCCATAGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTtggtgg < 2:455288/143‑1 (MQ=255) tttGTTACTGTCTATGCTGGTACCACGAATCGACAGAAACAGATGAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGt < 2:97437/143‑1 (MQ=255) aCTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTc > 1:732849/1‑143 (MQ=255) tttCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAACCAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCg < 2:712488/143‑1 (MQ=255) tGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGa > 2:656702/1‑143 (MQ=255) tGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATGCCGGCATCACGa > 2:167299/1‑143 (MQ=255) aCGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCGTTTGGTGGGTTTATTCGGGCATCCAGAATAtatt > 2:708436/1‑143 (MQ=255) aaTCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCt < 1:438865/143‑1 (MQ=255) aCAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGAGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTACTGcccg > 2:309373/1‑140 (MQ=255) aaCAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTAc > 2:894934/1‑143 (MQ=255) aCAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACt > 1:403977/1‑143 (MQ=255) aCAGATTAGGGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACt < 1:775015/143‑1 (MQ=255) aGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACtgaccgggcttttacttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatagaaagtaacaaactcgctgccaacgtcgcgcaacagatccaaataat < 1:304317‑M2/143‑106 (MQ=255) aTTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACtgaccgggcttttacttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatagaaagtaacaaactcactgccaacgtcgcgcaaaagatccaaataatat < 1:731885‑M2/143‑108 (MQ=255) tAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGATACTGGActa > 1:682939/1‑141 (MQ=255) gTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCaaa < 1:94557/143‑1 (MQ=255) tGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAAc > 1:304486/1‑143 (MQ=255) gtggTTAAGGAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTAGTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGCGGGTTTATTCCGGCATCATGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAAc < 2:477298/140‑1 (MQ=255) gTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaa > 2:233798/1‑143 (MQ=255) gTAAAAGCACGGTCGCATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaa < 1:386196/143‑1 (MQ=255) tAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTaag < 2:732849/143‑1 (MQ=255) aaGCCCGGTCACATTGGACtgaccgggcttttacttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatagaaagtaacaaactcgctgcaaacgtcgcgcacaggatccaaataatatccagtattggccaattt < 1:335438‑M2/143‑125 (MQ=255) cccGGTCACATTTGACTGCTCGTGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTTGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGaaa < 2:694552/143‑1 (MQ=255) cccGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTGTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAACCACGCTTAAGAAGaaa > 2:747145/1‑143 (MQ=255) ccGGTCAgtccaatgtgaccgggcttttacttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatagaaagtaacaaactcgctgccaacgtcgcgcaaaagatccaaataatatccagtattggccaatttttaa < 1:661306‑M1/143‑137 (MQ=255) cGGTCAgtccaatgtgaccgggcttttacttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatggaaagtaacaaactcgctgccaacggcgcgccaaagatccaactaatatccagtattggccaatgtttaag > 2:418556‑M1/1‑6 (MQ=255) cGGTCAgtccaatgtgaccgggcttttacttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatcgaaagtaacaaactcgctgccaacgtcgcgcaaaagatccaaataatatccagtattggccaatttttaag > 2:71583‑M1/1‑6 (MQ=255) ggTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCATTTGGTGGGTTTATTCCGGCAACACGAATATTGTTCTGCAACGCTACTGCACCAAACAGGCTTAAGaagcaagcg > 2:284709/1‑142 (MQ=255) agtccaatgtgaccgggcttttatttaactcactaatctgtttctgtcgattcgttgtaccagcatagaaagtaacaaactcgctgccaacgtcgcgcaaaagatccaaataatatccagtattggccaatttttaagctcaa < 2:732574‑M1/143‑143 (MQ=255) | CCGGGGAATTGAGCTTAAAAATTGGCCAATACTGGATATTATTTGGATCTTTTGCGCGACGTTGGCAGCGAGTTTGTTACTTTCTATGCTGGTACAACGAATCGACAGAAACAGATTAGTGAGTTAAGTAAAAGCCCGGTCACATTGGACTGACCGGGCTTACGTGAGTTATTCGCTGTATTCTTCCTGGGTAACCTGTGTTTCTTTTGGTGGGTTTATTCCGGCATCACGAATATTTTTCTGCACCGCTACTGCACCAAACAAGCTTAAGAAGAAAGCCAGTC > NC_000913/3726756‑3727039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |