| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1411899 = | 88 (1.450) | 62 (1.250) | 47/230 | 0.0 | 49.6% | coding (50/936 nt) | ttcA | tRNA cytosine(32) 2‑sulfurtransferase TtcA |
| ? | NC_000913 | = 1434958 | 54 (1.090) | pseudogene (51/51 nt) | ttcC | putative tRNA 2‑thiocytidine (s(2)C32) synthase | |||||
Only 100 of 172 total aligned reads displayed.
CTGCAAATTGCGCAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTTCTCTGGTACTAAATGGGGCAAATTGGGGGCAAACTTTGCAACTACGATAACCGCGCATTCAACATGGCTATCTGTTCGTCGT > NC_000913/1411760‑1412040 | ggcaaaacgctgcaaaaggggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttactt > 1:120170‑M1/142‑143 (MQ=255) aacgctgcaaaaggggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCa < 1:259855‑M1/7‑1 (MQ=255) acgctgcaaaaggggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAg > 1:436350‑M1/136‑143 (MQ=255) gcaaaaggggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGt > 1:540606‑M1/131‑143 (MQ=255) cAGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTAtt < 1:1092502/143‑1 (MQ=255) aGAATCTCCAGCATGGTATAGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAATCATTTTGCTTTTTCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTg < 1:936842/143‑1 (MQ=255) aaagtggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTAtt > 2:919923‑M1/128‑143 (MQ=255) aaggggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTg < 2:522710‑M1/17‑1 (MQ=255) aggggcaaaaaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagcgagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAggttgtgttct < 1:1043594‑M1/18‑6 (MQ=255) 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aaaggggcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTctttcttt > 1:769874‑M1/117‑143 (MQ=255) ataGCTGTCTTTACCCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAAttt < 1:285614/143‑1 (MQ=255) tcgCTGTCTTTCCGCCCGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGATGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGTCGCATACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATttg < 2:334480/141‑1 (MQ=255) gcaaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAAtt < 1:611974‑M1/33‑1 (MQ=255) caaaaaaagagtggattatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAAttt < 1:650988‑M1/34‑1 (MQ=255) 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ccGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTCCTTTGTAATTTGTGGATTTTCTTGCat > 2:1059131/1‑143 (MQ=255) cGGAGAGGCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCatt > 1:145390/1‑143 (MQ=255) tatcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttatcacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCat > 2:866579‑M1/94‑143 (MQ=255) tagcgtagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCat > 2:874365‑M1/94‑143 (MQ=255) gagGCAAACCATGATGTGATCCCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCGATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGTCGCAGACGTTTTTGTATTTTTTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTTATTTTCTTGCATTAttt < 2:506032/143‑1 (MQ=255) tagcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTAttt > 1:807125‑M1/89‑143 (MQ=255) ggCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCa < 2:1064974/143‑1 (MQ=255) ggCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCACATTGATGTCTGCAATGGCTTCGCCCACGGTTTGGGGATCACGAGTTCCAGTCATATCTACA‑‑TTCTTTGTTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCa < 1:820377/143‑1 (MQ=255) gCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGCTCGTTCTTTGTAGTTCGTTGCTTTTCTTGCATTATTTctg > 2:154171/1‑141 (MQ=255) gCAAACCATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGCACGTGTTGTTCTTTCTTATTACTTTTTTGATTTTCTTGAATTATTTCAg > 2:1028897/1‑143 (MQ=255) gcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtttaatttttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCa < 1:212800‑M1/57‑1 (MQ=255) gcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCa > 1:710707‑M1/87‑143 (MQ=255) gcttattgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCa > 1:56385‑M1/87‑143 (MQ=255) ttgttgtcgctgatgatatttaacacattgaaaaataagtaaaatacttatgagtcagagagttgtgatttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTtct > 2:195573‑M1/82‑143 (MQ=255) cATGATGCGATCGCCTTCTTCAATCATATTGAAGTCAGCAATGGCTTCGCCCACG‑‑TTACGACGCAGACGTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCAGTATTTCGGGTctct > 1:87885/1‑143 (MQ=255) 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< 1:423162‑M1/127‑1 (MQ=255) atttttgcccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTTCTCTGGTACTAAATGGGGCAAATTGGGGGCACACTTTGCAACTACCATAACCACGCCTTCAACCTGgcc < 2:776110‑M1/129‑2 (MQ=255) gTTTTTGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTTCTCTGGTACTAAATGGGGCAAATTGGGGGCAAACTTTGCAACTACGATAACCGCGCATTCAACATGGCTATc > 2:279511/1‑143 (MQ=255) ttttGTAATTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTTCTCTGGTACTAAATGGGGCAAATTGGGGGCAAACTTTGCAACTACGATAACCGCGCATTCAACATGGCTATCTg < 2:141651/143‑1 (MQ=255) cccttacTTGTTCAGGTTGTATTGTTCTTTCTTTGTCATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTTCTCTGTTACTAGATGGGTCAAATTGTGGTCAAACTTTTCAACTACGATAACCACGCATTCAACATGTCTATCTGtt < 2:80517‑M1/136‑1 (MQ=255) ccttccttGTGCAGTTTTTACTGTTCCTTCTTTGTAATTTGTTGATTTTCTTGCATTATTTCAGTTCTCTGGTACTAAATGGGGCAAATTGGGCGCATACCTTGCAACTACGATAACCGCGCATTCAACATGGCTATCTGTtc < 2:611974/137‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |