New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1437105 = | 84 (2.530) | 9 (0.270) | 8/262 | NT | 15.3% | intergenic (‑212/‑16) | ompN/micC | outer membrane porin N/small regulatory RNA MicC |
? | NC_000913 | = 1455347 | 16 (0.490) | coding (184/747 nt) | paaC | phenylacetyl‑CoA 1,2‑epoxidase, structural subunit |
AAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTGGATAATC > NC_000913/1436964‑1437245 | tgcctgctgctctcccagcgtctgggtgcatggtgcggtcacgccccggaactggaaagcgatctcgcactggcaaacattggcctcgatttattaggtcaggcacgcaacttcttatcgtatgccgctgaattagcgggaga > 2:401959‑M1/143‑143 (MQ=255) aaGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATGTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTGAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATAc < 1:488669/143‑1 (MQ=255) ttCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGACAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGtt > 2:623995/1‑143 (MQ=255) tCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTa < 1:254317/143‑1 (MQ=255) tCAGTGAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTa < 1:555243/143‑1 (MQ=255) gatagataTCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCgg < 1:495967/143‑1 (MQ=255) tAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAACCCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAAAGATAATAAGCCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGt < 1:12202/143‑1 (MQ=255) aaaTATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGtt < 2:547559/143‑1 (MQ=255) gttgggtgaatggtgcggtcacgcaccggaactggaaatcgatctcgcactggcaaacattggcctcgatttattaggtcaggcacgcaacttcttatcgtatgccgctgaattagcgggagACGTTATTCTGCGCGGGTtat < 1:235400‑M1/21‑1 (MQ=255) tCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATg > 2:353016/1‑143 (MQ=255) tCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATg > 2:437907/1‑143 (MQ=255) tCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGGTATATg > 2:77212/1‑143 (MQ=255) cATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGc < 2:59465/143‑1 (MQ=255) cATTTGTTACGCCCTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGc < 1:208611/143‑1 (MQ=255) cATTTGGTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGc < 1:342165/143‑1 (MQ=255) tttGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATCCATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGACt > 1:160294/1‑143 (MQ=255) aCGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTg < 1:293926/143‑1 (MQ=255) tgcggtcacgcaccggaactggaaatcgatctcgcactggcaaacattggcctcgatttattaggtcaggcacgcaacttcttatcgtatgccgctgaattagcgggagACGCTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGt < 1:264196‑M1/34‑1 (MQ=255) ccTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTca > 1:597233/1‑143 (MQ=255) tAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGattt < 1:608788/143‑1 (MQ=255) caccggaactggatagcgagcccgccgtggcaaactttggcctctatttattaggtcaggcacgcaacttcttatcggatgccgctgaattagcgggagACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGatttt > 2:108818‑M1/100‑143 (MQ=255) aCCCTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGattttatt < 1:19652/143‑1 (MQ=255) cTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGgttgtatttt > 2:11898/1‑143 (MQ=255) cTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAAT‑AGTGTACTCATAATTAACGAAGATAATACATACAAAATATAATTTATATTATTAATTTGCGGCACGGTATACTGCTCGTAACATAGGCCTTTATTGTAACAGattttatttt > 2:232860/1‑143 (MQ=255) tCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTATCAGATATTTTATTTTCTGtt > 2:153182/1‑143 (MQ=255) aataatTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTggg > 2:655302/1‑143 (MQ=255) tCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCcattg > 2:556225/1‑143 (MQ=255) ccTCTGAAAGGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCcattgc < 1:133991/143‑1 (MQ=255) ctctGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCcattgca > 2:100030/1‑143 (MQ=255) tctGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCcattgcat > 2:483543/1‑143 (MQ=255) tctGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCcattgcat > 1:248354/1‑143 (MQ=255) tctGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCAAAGATTTTATTTTCTGTTGGGCcattccat > 2:452535/1‑143 (MQ=255) gAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTTACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCattgcattgc > 2:97049/1‑143 (MQ=255) aaaTGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACACAATAAAAATTATACTTTTAATGTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGACTTTATTGTCACAGATTTTATTCTCGGTTGGGCCATTGCATTGcc > 2:612263/1‑143 (MQ=255) aaggATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGGTATATGCCTTTAATGTCCCCAATTCTACTTTCCGTTGGGCCATTACCTTGccc > 2:631413/4‑142 (MQ=255) aTGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTTCCAc > 2:251014/1‑143 (MQ=255) ggcaaacatcggcctcgctttcttatgtcaggcacgcaacttcttatcgtatgccgctgaattagcgggagACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCAc > 2:257201‑M1/72‑143 (MQ=255) ataataAGTCTCGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAACTAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGa < 1:627866/143‑1 (MQ=255) taataaGTCTGGTGA‑TTGCACTGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGAt < 2:489425/143‑1 (MQ=255) aataatTATGGTGA‑ATGTATCGAAGAGAATACATACAATATAAAGCTTATCCTTTTAATTTGCTATACGTTATTGTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGAtt < 2:263821/143‑1 (MQ=255) aataaGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGAtt < 1:466930/143‑1 (MQ=255) ataaGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTTCCACTGAttt > 2:583194/1‑143 (MQ=255) ataaGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGAttt > 2:587875/1‑143 (MQ=255) taaGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGAtttt < 2:32823/143‑1 (MQ=255) aaGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTc > 1:229272/1‑143 (MQ=255) aGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTcc < 1:380245/143‑1 (MQ=255) aGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTcc < 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tctttattgggtcaggcactcaactgcttatcgtatgccgctgaattagcgggagACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACatat > 2:587926‑M1/56‑143 (MQ=255) gA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCCCTGATTTTCCCACAtata > 1:34770/1‑143 (MQ=255) tGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATaaaa < 1:564639/143‑1 (MQ=255) tGTATCGAAGATAAGACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCGGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATaaaa < 1:255518/143‑1 (MQ=255) ttaggtcaggcacgcaacttcttatcgtatgccgctgaattagcgggagACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTCTTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACAtataaagcg < 2:478131‑M1/94‑4 (MQ=255) tATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATGGCATTGCCACTGATTTTCCAACCTATAAAAAg 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1:656541/143‑1 (MQ=255) cTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTa < 2:290330/143‑1 (MQ=255) cTTTTAATTTGCGATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTa < 1:197062/143‑1 (MQ=255) ttttATGTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTGATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGAGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACACGCCGGGACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAg < 2:80599/143‑1 (MQ=255) ttttAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAg > 2:65768/1‑143 (MQ=255) ttttAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCACGAAAAATCGTCCCGGCTTTTTTTTCAg > 2:45602/1‑143 (MQ=255) ttAATTCGCTAGACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAGCATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGaa < 2:238724/143‑1 (MQ=255) tAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAAt < 1:537904/143‑1 (MQ=255) tgcgcgggggGCGTTAGTCTGCGCGGGTTATGTGCCTTTCTTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCCTTGCAGTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAAtt > 1:412690‑M1/11‑143 (MQ=255) aTTTGCTATACGTTATTCTGCGCTGCTTATATGCATTTATTGTCACCGATTTTAGTTACTGTAGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCGAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTg < 2:33068/143‑1 (MQ=255) aTTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGCACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTATAAttc > 2:450832/1‑142 (MQ=255) tttGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCACCATATGAATAGACACACCCGAACAGGCGTCCGGGCTTTTTTTTTCGAATTgg > 2:217006/1‑143 (MQ=255) tttGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTgg < 2:476958/143‑1 (MQ=255) tttGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTgg < 1:190149/143‑1 (MQ=255) tttGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGCCCGGGCTTTTTTTTTAGTAtttg > 2:177379/1‑141 (MQ=255) agcgggagACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTgg > 2:29291‑M1/9‑143 (MQ=255) ttGCTATACTTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTGGa < 1:523880/143‑1 (MQ=255) tataCGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTGGATAAt > 1:651075/1‑143 (MQ=255) tataCGGTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTGGATAAt < 1:523434/143‑1 (MQ=255) ttaCGTTATTCTGCGCGGGTTATCGGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGCTGGGCCATTGCATCGCCACTGATTTTCCATTATCTCAAAAGGCGTGGCAGAACATTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTGGATAATc < 2:141336/142‑1 (MQ=255) | AAGTTCAGTTAGCCGATAAATATCATTTGTTACGCCTTAAGTAAAACCTTAATCAAATAATTCCTCTGAAATGATAATAAGTCTGGTGA‑ATGTATCGAAGATAATACATACAAAATAAAAATTATACTTTTAATTTGCTATACGTTATTCTGCGCGGGTTATATGCCTTTATTGTCACAGATTTTATTTTCTGTTGGGCCATTGCATTGCCACTGATTTTCCAACATATAAAAAGACAAGCCCGAACAGTCGTCCGGGCTTTTTTTTTAGAATTGGATAATC > NC_000913/1436964‑1437245 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |