New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1465092 = | 47 (1.890) | 4 (0.180) | 4/242 | NT | 8.8% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG |
? | NC_000913 | 1465125 = | 40 (1.760) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG |
ATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465243‑1465092 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAAT > NC_000913/1465125‑1465266 ATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACT < 1:148882/143‑1 AAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCT > 1:424855/1‑143 AAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTG > 2:480930/1‑143 AAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGC > 2:125334/1‑143 AAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATAGAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGC > 1:182959/1‑143 GACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT > 1:115145/1‑143 TTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTT > 2:301692/1‑143 TCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATTTATT > 2:456563/1‑143 TAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGAGGTTTTTGTTAGTAAGTTATATTGTTTACAAAATTTATATATTTCATG > 2:342514/1‑143 GCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTT > 2:35168/1‑143 CTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATTGTCTTTTTTTATTCTCCTTAATTtt > 2:13121/1‑141 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATT < 1:28014/143‑1 TTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGACTTATACTTGT > 2:282413/1‑143 TTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTG < 2:231718/143‑1 TTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATGTTTCATGTTTTTTTTTTTTTCACTTGAATTTTAATTATGAtt > 2:249765/1‑141 ATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465243‑1465092 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAAT > NC_000913/1465125‑1465266 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |