| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 47 (1.890) | 4 (0.180) | 4/242 | NT | 8.8% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 40 (1.760) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG | |||||
GGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTC > NC_000913/1464950‑1465234 | ggTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATta > 2:166657/1‑143 (MQ=255)aatcataattaaaattcaagtgaaaaaaaaaaaaacatgaaacatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaa > 2:249765‑M1/143‑143 (MQ=255) tGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATtata < 1:167838/143‑1 (MQ=255) tGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTCACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATtata > 1:351696/1‑143 (MQ=255) gCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGGCATTGCGGGCAATAGTTGTGATCATGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATaa < 1:485626/143‑1 (MQ=255) cacaattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgataaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataa < 2:231718‑M1/4‑1 (MQ=255) cTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTACGGGAAATTGAACCTGGCAGGAGACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTGTGTCACTTTAATTATaaa > 2:391408/1‑143 (MQ=255) acaagtataagtcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaataaa > 2:282413‑M1/139‑143 (MQ=255) aattataattcaggtgaataaaaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGc < 1:28014‑M1/7‑1 (MQ=255) gACACGCTGTAAGCAGACGTGACATGAAGTCGAGCCATTGCGGTAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCaga < 2:93480/143‑1 (MQ=255) acacGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGCACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAATATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCagag > 1:112432/1‑143 (MQ=255) aaaattaaggagaataaaaaaagacaatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCagag > 2:13121‑M1/133‑143 (MQ=255) tGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGTAGGAAACGCCTGGTATTTGAGGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATGATTTAGTCCCTTTAATTATAAagaagatgaatgt > 1:7652/1‑136 (MQ=255) aaGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTa > 1:290925/1‑143 (MQ=255) gCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAg < 1:23908/143‑1 (MQ=255) aCGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAGGCAGAGTTATGTTTAAGctct > 1:9289/1‑143 (MQ=255) aaaaagaccatgaaatatataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGc > 2:35168‑M1/116‑143 (MQ=255) tCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATCAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttatt > 2:271958/1‑143 (MQ=255) tCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTCATGTTTAAGCTCTGCtttatt > 1:91856/1‑143 (MQ=255) cAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtgtattt > 2:68758/1‑143 (MQ=255) catgaaatatataaattttgtaaacaatataacttactaacaaaaacctcattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttattta > 2:342514‑M1/108‑143 (MQ=255) aataaataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGa > 2:456563‑M1/103‑143 (MQ=255) aTTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTAtt < 2:319695/143‑1 (MQ=255) ttGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTCTAACAATACGGAATGTTTATGGTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTa < 1:205093/143‑1 (MQ=255) aaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTaa > 2:301692‑M1/96‑143 (MQ=255) 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2:9751/1‑143 (MQ=255) tATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAAttatttat > 1:125334/1‑143 (MQ=255) aTTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTACTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTtata > 2:239994/1‑143 (MQ=255) aTTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTtata < 1:167819/143‑1 (MQ=255) tgtgatgaGGATCAGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATaa < 1:192100/141‑1 (MQ=255) gagaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAGTgagca > 1:449979/1‑141 (MQ=255) 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tCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTgg > 2:49224/1‑143 (MQ=255) gCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATCTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTACTTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATACTTTATACTCAGA‑ATGTGGttg > 1:323389/1‑142 (MQ=255) gACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTa > 1:404284/1‑143 (MQ=255) aCCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCCTCATATCATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTaa < 1:489924/143‑1 (MQ=255) ccGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCACTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTGTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATAACG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAAt > 2:311093/1‑143 (MQ=255) 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tAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCa < 2:464109/143‑1 (MQ=255) aTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATg < 2:351696/143‑1 (MQ=255) ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTc > 1:115145‑M1/1‑143 (MQ=255) | GGTGCTGGTGACACGCTGTAAGCAGACGTTACATCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTC > NC_000913/1464950‑1465234 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |