New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1465092 = | 47 (1.890) | 4 (0.180) | 4/242 | NT | 8.8% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG |
? | NC_000913 | 1465125 = | 40 (1.760) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | 2‑hydroxycyclohepta‑1,4,6‑triene‑1‑carboxyl‑CoA thioesterase/uncharacterized protein YnbG |
TCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATT > NC_000913/1464983‑1465267 | tCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATCAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttatt > 2:271958/1‑143 (MQ=255) tCAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTCATGTTTAAGCTCTGCtttatt > 1:91856/1‑143 (MQ=255) cAAGTCGAGCCATTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtgtattt > 2:68758/1‑143 (MQ=255) catgaaatatataaattttgtaaacaatataacttactaacaaaaacctcattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCtttattta > 2:342514‑M1/108‑143 (MQ=255) aataaataaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGa > 2:456563‑M1/103‑143 (MQ=255) aTTGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTAtt < 2:319695/143‑1 (MQ=255) ttGCGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTCTAACAATACGGAATGTTTATGGTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTa < 1:205093/143‑1 (MQ=255) aaattgtgtatataatataaattacaaattaaaaccacattctcattataaataattatatgatgaaaaaacggtatgaattaatactcaaataaATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTaa > 2:301692‑M1/96‑143 (MQ=255) cGGGAAATTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAAtt > 1:416637/1‑143 (MQ=255) aaTTGAACCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATAc > 1:474277/1‑143 (MQ=255) aCCTGGCAGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑tttt > 1:207521/1‑143 (MQ=255) tGGCCGGAAACGCCTGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGCAACAGTAACAGATGTAACATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCCGAGATATGATTAAGCTCTGCTTTCTTTATGTGCGTAGTAATTCATACCG‑TTTTTtc > 1:424265/1‑143 (MQ=255) tGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGGTGTAAAATTTTTTTGTCCCTTTAATTATAATGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAattatt < 2:7652/143‑1 (MQ=255) tGGTATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAattatt > 2:9751/1‑143 (MQ=255) tATTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAAttatttat > 1:125334/1‑143 (MQ=255) aTTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTACTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTtata > 2:239994/1‑143 (MQ=255) aTTTGATGAGAATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTtata < 1:167819/143‑1 (MQ=255) tgtgatgaGGATCAGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATaa < 1:192100/141‑1 (MQ=255) gagaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAGTgagca > 1:449979/1‑141 (MQ=255) agaATCTGCGTCCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑At < 2:440825/143‑1 (MQ=255) agaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTCATTCTTTCTG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑At > 1:88648/1‑143 (MQ=255) agaATCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑At > 1:379821/1‑143 (MQ=255) aaTCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTANTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTCTTTATAATGATA‑Atgt > 2:67768/1‑143 (MQ=255) aTCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTGTAGTGAGC‑Atgtg > 2:228812/1‑143 (MQ=255) tCTGCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTgg > 2:49224/1‑143 (MQ=255) gCGACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATCTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTACTTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATACTTTATACTCAGA‑ATGTGGttg > 1:323389/1‑142 (MQ=255) gACCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTa > 1:404284/1‑143 (MQ=255) aCCGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCCTCATATCATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTaa < 1:489924/143‑1 (MQ=255) ccGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCACTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTGTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATAACG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAAt > 2:311093/1‑143 (MQ=255) cGAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAAtt > 1:21990/1‑143 (MQ=255) gAAACAGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTAGTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAAtt > 2:174151/1‑143 (MQ=255) aGTAACAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTCTTTGAGTATTAATTCATACCT‑TTTTTTCATCATATACTTATTTATAATTAGA‑ACTTGGTTTTTAttttttat > 2:186756/1‑138 (MQ=255) aaCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCATAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATtta < 2:203175/143‑1 (MQ=255) aCAGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATttat > 1:312899/1‑143 (MQ=255) aGATGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATCATGAGA‑CTGTGGTTTTAGTGTGTAATttatat > 1:87054/1‑143 (MQ=255) tGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATttatattat > 1:397552/1‑143 (MQ=255) tGTAAAATTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTATTCATCATATAATTATTTTTATTGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATttatattat > 2:232303/1‑143 (MQ=255) aaaaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTAATT‑TAATGATACCCGTGTTTTTAATTTGTAATTTATATtatata < 2:267756/143‑1 (MQ=255) aaTTATTTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATaca > 2:440817/1‑143 (MQ=255) attattTTGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATacac > 1:416047/1‑143 (MQ=255) ttttctGTCCTTTTAATTATAAAGCATATTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAAAAATT‑GGATTGTCTGAATTTGTAATTTATATTATATACACaa < 2:148677/138‑1 (MQ=255) gattTTGGCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTACGTACTTCGTTATTTATTTGAGAATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAGTTATTCATATTGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACaa < 2:78254/142‑1 (MQ=255) ttttGTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAtt > 2:443566/1‑143 (MQ=255) ttaatactcaaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAAttt > 2:301692‑M2/49‑143 (MQ=255) gTCCCTTTAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtata < 1:361539/143‑1 (MQ=255) tcaaataaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTtatttatt > 2:456563‑M2/42‑143 (MQ=255) tAATTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCa < 2:464109/143‑1 (MQ=255) taaataaagcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGAGGTTTTTGTTAGTAAGTTATATTGTTTACAAAATTTATATATTTCATg > 2:342514‑M2/37‑143 (MQ=255) aTTATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATg < 2:351696/143‑1 (MQ=255) ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTc > 1:115145‑M1/1‑143 (MQ=255) gcagagcttaaacataactctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCttttt > 2:35168‑M2/29‑143 (MQ=255) GCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTCTATACACAATTTATATATTTCATGGTCttttt > 1:182959‑M1/1‑143 (MQ=255) GCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCttttt > 2:125334‑M1/1‑143 (MQ=255) CAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCtttttt > 2:480930‑M1/1‑143 (MQ=255) AGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCttttttt > 1:424855‑M1/1‑143 (MQ=255) AGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTAt < 1:148882‑M1/143‑1 (MQ=255) ttAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGCTCTTTGGTTATTCACCTGa > 2:340819/1‑143 (MQ=255) aGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAAtt > 1:281318/1‑143 (MQ=255) ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATTGTCTTTTTTTATTCTCCTTaatttt > 2:13121‑M2/12‑141 (MQ=255) gctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCG‑TTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGA‑ATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAAtt < 1:28014‑M2/136‑1 (MQ=255) 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NC_000913/1464983‑1465267 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |