New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | KX077536 | 6245 = | 2353 (0.640) | 1007 (0.290) | 183/186 | 0.0 | 32.0% | coding (669/1020 nt) | unknown | prkA |
? | KX077536 | = 6255 | 2099 (0.610) | coding (679/1020 nt) | unknown | prkA |
Only 100 of 1501 total aligned reads displayed.
CGTGACCGTAGTAGGTGTCAGGGCCGTAGGCTAAGCGAATGCCCGGATAGGAGCAGGTCAGCTTACGACCGCAGGGCGTCCACTGGATGGTCGAACCTTCGTCGAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < KX077536/6351‑6245 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtcgaacCTTCGTCGAACAGGTAAGCCGGCTCAAAACCATCGCGGCCTTCCCGTTGGATCAACTGCACCCGCAGCACCTTGCGCTCGGTGTCATTGGGGATTAGCTG < KX077536/6255‑6156 CGTGACCGTAGTAGGTGTCAGGGCCGTAGGCTAAGCGAATGCCCGGATAGGAGCAGGTCAGCTTACGACCGCGGGGCGTCCACTGGATGGTCGAACCTTCG < 2:1002688/101‑1 CGTGACCGTAGTAGGTGTCAGGGCCGTAGGCTAAGCGAATGCCCGGATAGGAGCAGGTCAGCTTACGACCGCAGGGCGTCCACTGGATGGTCGAACCTTCG < 1:2587052/101‑1 GTGACCGTAGTAGGTGTCAGGGCCGTAGGCTAAGCGAATGCCCGGATAGGAGCAGGTCAGCTTACGACCGCAGGGCGTCCACTGGATGGTCGAACCTTCGT > 1:2988864/1‑101 GTGACCGTAGTAGGTGTCAGGGCCGTAGGCTAAGCGAATGCCCGGATAGGAGCAGGTCAGCTTACGACCGCAGGGCGTCCACTGGATGGTCGAACCTTCGT > 1:2462759/1‑101 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |