| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | KX077536 | 6245 = | 2353 (0.640) | 1007 (0.290) | 183/186 | 0.0 | 32.0% | coding (669/1020 nt) | unknown | prkA |
| ? | KX077536 | = 6255 | 2099 (0.610) | coding (679/1020 nt) | unknown | prkA | |||||
Only 100 of 4616 total aligned reads displayed.
CCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCACGAAGT > KX077536/6155‑6355 | ccAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAg > 2:2471266/1‑101 (MQ=255) aGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgt < 2:2572407‑M2/101‑3 (MQ=255) gCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgtt < 2:2249950‑M2/101‑4 (MQ=255) gCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgtt > 1:778963‑M2/1‑98 (MQ=255) cTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttc > 1:1378647‑M2/1‑97 (MQ=255) tAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcg > 2:2978159‑M2/1‑96 (MQ=255) tAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcg < 1:297053‑M2/101‑6 (MQ=255) gacaccgagcgcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaaggttcgacgaaggttcg < 2:2519418‑M1/16‑1 (MQ=255) aTCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgac < 1:283902‑M2/101‑8 (MQ=255) ccccAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCa > 1:1204300/1‑101 (MQ=255) cccAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCAt < 1:2723679/101‑1 (MQ=255) ccAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATc > 1:2176336/1‑101 (MQ=255) ccAAAGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaag > 2:419791‑M2/1‑90 (MQ=255) cAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaagg < 1:1686197‑M2/101‑13 (MQ=255) tGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGt < 1:1000751/101‑1 (MQ=255) gcaaggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGt > 1:2324753‑M1/76‑101 (MQ=255) gACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcg > 2:1866002‑M2/1‑85 (MQ=255) acacCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTgg > 2:2625135/1‑101 (MQ=255) acacCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTgg < 2:1576302/101‑1 (MQ=255) acacCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTgg < 1:1321999/101‑1 (MQ=255) aggtgctgcgggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGa > 1:184153‑M1/73‑101 (MQ=255) acCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgacc < 2:1140801‑M2/101‑20 (MQ=255) cGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGc > 2:1449494/1‑101 (MQ=255) gcgcAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCt < 2:799029/101‑1 (MQ=255) cgcAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccag < 1:2554458‑M2/101‑26 (MQ=255) gcAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagt < 2:1809146‑M2/101‑27 (MQ=255) gcAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGc < 2:1344419/101‑1 (MQ=255) gggtgcagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCg < 2:1511773‑M1/38‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtgg > 2:1408950‑M2/1‑73 (MQ=255) aaGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtgg > 1:3024835‑M2/1‑73 (MQ=255) ggTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggac < 1:1442841‑M2/101‑31 (MQ=255) gTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacg > 2:2300142‑M2/1‑70 (MQ=255) gTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacg > 1:1131549‑M2/1‑70 (MQ=255) gTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGCCCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCg < 2:1632843/101‑1 (MQ=255) tgctgcGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGt > 1:2248431/1‑101 (MQ=255) cagttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGt > 1:277406‑M1/59‑101 (MQ=255) agttgatccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTa > 1:1795119‑M1/58‑101 (MQ=255) tgcGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAg > 1:499666/1‑101 (MQ=255) gcGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGCTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGc < 2:2129977/101‑1 (MQ=255) atccaacgggaaggccgcgatggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTg < 1:3081015‑M1/49‑1 (MQ=255) tgTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGa > 2:3332864/2‑101 (MQ=255) gTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGAc > 2:3216953/1‑101 (MQ=255) gCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcg > 2:316004‑M2/1‑59 (MQ=255) cAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTg < 1:622999/101‑1 (MQ=255) cAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTg > 1:1736609/1‑101 (MQ=255) aGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgta < 2:1749903‑M2/101‑45 (MQ=255) ttGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaag < 2:2807518‑M2/101‑47 (MQ=255) tCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctga < 2:3276787‑M2/101‑51 (MQ=255) ccAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgac < 1:560378‑M2/101‑52 (MQ=255) ccAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATc > 1:2669881/1‑101 (MQ=255) aaCGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCg > 1:1630446/1‑101 (MQ=255) tgggaAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctat < 2:925342‑M2/100‑56 (MQ=255) gggAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgct > 2:610128‑M2/1‑45 (MQ=255) gAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCAt > 2:5492/1‑101 (MQ=255) ggttttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCAtt < 1:965891‑M1/70‑1 (MQ=255) aaGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcct < 2:675287‑M2/101‑60 (MQ=255) aaGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCAtt < 2:2053579/101‑1 (MQ=255) aGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTc > 2:1286065/1‑101 (MQ=255) ggCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCg > 2:1692985/1‑101 (MQ=255) ttgagccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCt < 1:1263343‑M1/74‑1 (MQ=255) ccGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCt > 2:1036302/1‑101 (MQ=255) cgcgATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccg < 2:1096763‑M2/101‑65 (MQ=255) cgATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAg > 2:1215076/1‑101 (MQ=255) agccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAg < 2:2356336‑M1/77‑1 (MQ=255) gATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGc > 1:3140367/1‑101 (MQ=255) ccggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGcc < 1:2916176‑M1/79‑1 (MQ=255) aTGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGcc < 1:2438357/101‑1 (MQ=255) tGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCt < 2:37863/101‑1 (MQ=255) ggcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTa > 1:1896351‑M1/21‑101 (MQ=255) gcttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTAc > 1:3224882‑M1/20‑101 (MQ=255) ttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTACGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTAcga < 1:345359‑M1/84‑2 (MQ=255) ttacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACgg < 1:211978‑M1/84‑1 (MQ=255) ttGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGc > 2:479614/1‑101 (MQ=255) tacctgttcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGc < 1:665997‑M1/85‑1 (MQ=255) tGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGcc > 1:194808/1‑101 (MQ=255) aGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCt > 2:721549/1‑101 (MQ=255) ccGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGa < 2:2868978/101‑1 (MQ=255) tcgacgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGaca > 2:3093861‑M1/10‑101 (MQ=255) ggCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGaca < 1:1559660/101‑1 (MQ=255) ggCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGaca > 1:897651/1‑101 (MQ=255) gCTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctac < 2:2917471‑M2/101‑83 (MQ=255) cTTACCTGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacg < 2:3044501‑M2/101‑84 (MQ=255) cTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACAcc > 2:2186544/1‑101 (MQ=255) acgaagGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACct > 1:2624161‑M1/7‑101 (MQ=255) ccTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACctact > 2:2758653/1‑101 (MQ=255) cTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCGTTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACctacta > 1:2052265/1‑101 (MQ=255) cTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACctacta > 2:1918412/1‑101 (MQ=255) tGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacggccctg < 1:2007178‑M2/101‑90 (MQ=255) tGTTCGACGAAGgttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacggccctg > 1:410997‑M2/1‑12 (MQ=255) tGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCtactac < 1:248921/101‑1 (MQ=255) tGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCtactac < 1:3289593/101‑1 (MQ=255) GTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACg < 1:1083323‑M1/101‑1 (MQ=255) GACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCa > 2:2699426‑M1/1‑101 (MQ=255) GACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCa > 2:875224‑M1/1‑101 (MQ=255) gaAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCACGa > 1:844904/1‑101 (MQ=255) gaAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCACGa < 1:149792/101‑1 (MQ=255) aaggttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacggccctgacacctact > 1:731342‑M2/1‑3 (MQ=255) aGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCACGAAg > 1:2385376/1‑101 (MQ=255) ggttcgacgaaggttcgaccatccagtggacgccctgcggtcgtaagctgacctgctcctatccgggcattcgcttagcctacggccctgacacctactac > 2:1975382‑M2/1‑1 (MQ=255) ggTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCACGAAGt < 2:2408794/101‑1 (MQ=255) | CCAGCTAATCCCCAATGACACCGAGCGCAAGGTGCTGCGGGTGCAGTTGATCCAACGGGAAGGCCGCGATGGTTTTGAGCCGGCTTACCTGTTCGACGAAGGTTCGACCATCCAGTGGACGCCCTGCGGTCGTAAGCTGACCTGCTCCTATCCGGGCATTCGCTTAGCCTACGGCCCTGACACCTACTACGGTCACGAAGT > KX077536/6155‑6355 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |